MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013721	TACTT	2	10	3042	3051	20 %	60 %	0 %	20 %	283782523
2	NC_013721	CATGC	2	10	3073	3082	20 %	20 %	20 %	40 %	283782523
3	NC_013721	TGTTT	2	10	4248	4257	0 %	80 %	20 %	0 %	283782524
4	NC_013721	ATTCA	2	10	4539	4548	40 %	40 %	0 %	20 %	283782524
5	NC_013721	AAACC	2	10	7129	7138	60 %	0 %	0 %	40 %	283782525
6	NC_013721	ATCCT	2	10	8262	8271	20 %	40 %	0 %	40 %	283782526
7	NC_013721	GCACA	2	10	12645	12654	40 %	0 %	20 %	40 %	283782528
8	NC_013721	TCCAT	2	10	12727	12736	20 %	40 %	0 %	40 %	283782528
9	NC_013721	TGCAA	2	10	19202	19211	40 %	20 %	20 %	20 %	283782535
10	NC_013721	CAAAT	2	10	20552	20561	60 %	20 %	0 %	20 %	283782535
11	NC_013721	TTGAT	2	10	22813	22822	20 %	60 %	20 %	0 %	283782536
12	NC_013721	GAAAG	2	10	24561	24570	60 %	0 %	40 %	0 %	283782537
13	NC_013721	CTCAT	2	10	24915	24924	20 %	40 %	0 %	40 %	283782537
14	NC_013721	GCCAC	2	10	27394	27403	20 %	0 %	20 %	60 %	283782540
15	NC_013721	GCTAT	2	10	28059	28068	20 %	40 %	20 %	20 %	283782540
16	NC_013721	CTTCT	2	10	28663	28672	0 %	60 %	0 %	40 %	283782540
17	NC_013721	TGTTT	2	10	30004	30013	0 %	80 %	20 %	0 %	283782542
18	NC_013721	CAATA	2	10	31282	31291	60 %	20 %	0 %	20 %	283782543
19	NC_013721	AAATA	2	10	32865	32874	80 %	20 %	0 %	0 %	283782545
20	NC_013721	ATTCC	2	10	33978	33987	20 %	40 %	0 %	40 %	283782546
21	NC_013721	CTTTG	2	10	34808	34817	0 %	60 %	20 %	20 %	283782547
22	NC_013721	AACCA	2	10	35172	35181	60 %	0 %	0 %	40 %	283782547
23	NC_013721	CCAAA	2	10	39409	39418	60 %	0 %	0 %	40 %	283782550
24	NC_013721	ATGCC	2	10	40252	40261	20 %	20 %	20 %	40 %	283782550
25	NC_013721	TATTT	2	10	40366	40375	20 %	80 %	0 %	0 %	283782551
26	NC_013721	AATAT	2	10	40627	40636	60 %	40 %	0 %	0 %	283782551
27	NC_013721	AGCGA	2	10	42432	42441	40 %	0 %	40 %	20 %	283782552
28	NC_013721	CAATT	2	10	43912	43921	40 %	40 %	0 %	20 %	283782554
29	NC_013721	ATTAT	2	10	44283	44292	40 %	60 %	0 %	0 %	283782555
30	NC_013721	AAAAG	2	10	44516	44525	80 %	0 %	20 %	0 %	283782555
31	NC_013721	CTTCA	2	10	45635	45644	20 %	40 %	0 %	40 %	283782557
32	NC_013721	TTACC	2	10	45661	45670	20 %	40 %	0 %	40 %	283782557
33	NC_013721	TTGCA	2	10	46721	46730	20 %	40 %	20 %	20 %	283782557
34	NC_013721	AGTTG	2	10	50568	50577	20 %	40 %	40 %	0 %	283782559
35	NC_013721	GTTAA	2	10	51554	51563	40 %	40 %	20 %	0 %	283782560
36	NC_013721	TATTT	2	10	55120	55129	20 %	80 %	0 %	0 %	283782562
37	NC_013721	CATTA	2	10	56111	56120	40 %	40 %	0 %	20 %	283782564
38	NC_013721	ACAGC	2	10	57372	57381	40 %	0 %	20 %	40 %	283782566
39	NC_013721	CAGAT	2	10	59151	59160	40 %	20 %	20 %	20 %	283782568
40	NC_013721	GCTTG	2	10	60869	60878	0 %	40 %	40 %	20 %	283782569
41	NC_013721	CAATT	2	10	61555	61564	40 %	40 %	0 %	20 %	283782570
42	NC_013721	AAGTT	2	10	64598	64607	40 %	40 %	20 %	0 %	283782572
43	NC_013721	ACTTA	2	10	65001	65010	40 %	40 %	0 %	20 %	283782572
44	NC_013721	TTTTC	2	10	67715	67724	0 %	80 %	0 %	20 %	283782573
45	NC_013721	ACGTA	2	10	70488	70497	40 %	20 %	20 %	20 %	283782574
46	NC_013721	GTTAA	2	10	72956	72965	40 %	40 %	20 %	0 %	283782576
47	NC_013721	TAATG	2	10	76902	76911	40 %	40 %	20 %	0 %	283782579
48	NC_013721	ACTCG	2	10	78917	78926	20 %	20 %	20 %	40 %	283782580
49	NC_013721	GCTTT	2	10	80980	80989	0 %	60 %	20 %	20 %	283782582
50	NC_013721	ATGGA	2	10	82062	82071	40 %	20 %	40 %	0 %	283782583
51	NC_013721	TGGAT	2	10	83039	83048	20 %	40 %	40 %	0 %	283782583
52	NC_013721	GTTTT	2	10	86188	86197	0 %	80 %	20 %	0 %	283782586
53	NC_013721	ATGAG	2	10	89757	89766	40 %	20 %	40 %	0 %	283782588
54	NC_013721	AAATC	2	10	91096	91105	60 %	20 %	0 %	20 %	283782589
55	NC_013721	TTTGG	2	10	91295	91304	0 %	60 %	40 %	0 %	283782589
56	NC_013721	ACAAA	2	10	91568	91577	80 %	0 %	0 %	20 %	283782589
57	NC_013721	GCTTG	2	10	93479	93488	0 %	40 %	40 %	20 %	283782591
58	NC_013721	CAACG	2	10	95775	95784	40 %	0 %	20 %	40 %	283782594
59	NC_013721	TCGCT	2	10	95883	95892	0 %	40 %	20 %	40 %	283782594
60	NC_013721	GCGAT	2	10	96328	96337	20 %	20 %	40 %	20 %	283782594
61	NC_013721	ATTGC	2	10	96467	96476	20 %	40 %	20 %	20 %	283782594
62	NC_013721	GCAAT	2	10	97996	98005	40 %	20 %	20 %	20 %	283782595
63	NC_013721	AATAA	2	10	105506	105515	80 %	20 %	0 %	0 %	283782601
64	NC_013721	GCTTG	2	10	111662	111671	0 %	40 %	40 %	20 %	283782605
65	NC_013721	GCTTG	2	10	114965	114974	0 %	40 %	40 %	20 %	283782609
66	NC_013721	AGCAG	2	10	115942	115951	40 %	0 %	40 %	20 %	283782610
67	NC_013721	AAAGT	2	10	116979	116988	60 %	20 %	20 %	0 %	283782610
68	NC_013721	TTCAA	2	10	120328	120337	40 %	40 %	0 %	20 %	283782614
69	NC_013721	TTCGC	2	10	126368	126377	0 %	40 %	20 %	40 %	283782619
70	NC_013721	GGTTG	2	10	133484	133493	0 %	40 %	60 %	0 %	283782624
71	NC_013721	ACGAA	2	10	134908	134917	60 %	0 %	20 %	20 %	283782626
72	NC_013721	CTTGG	2	10	135825	135834	0 %	40 %	40 %	20 %	283782627
73	NC_013721	ATCAT	2	10	137681	137690	40 %	40 %	0 %	20 %	283782628
74	NC_013721	TACGG	2	10	138916	138925	20 %	20 %	40 %	20 %	283782631
75	NC_013721	CATGG	2	10	140870	140879	20 %	20 %	40 %	20 %	283782632
76	NC_013721	ATGCA	2	10	141304	141313	40 %	20 %	20 %	20 %	283782632
77	NC_013721	TGCTT	2	10	145492	145501	0 %	60 %	20 %	20 %	283782639
78	NC_013721	TGGTA	2	10	149770	149779	20 %	40 %	40 %	0 %	283782641
79	NC_013721	CTTGG	2	10	151396	151405	0 %	40 %	40 %	20 %	283782642
80	NC_013721	GTTTT	2	10	151823	151832	0 %	80 %	20 %	0 %	283782643
81	NC_013721	CGATA	2	10	154016	154025	40 %	20 %	20 %	20 %	283782644
82	NC_013721	ATTGC	2	10	154920	154929	20 %	40 %	20 %	20 %	283782644
83	NC_013721	GTATT	2	10	155376	155385	20 %	60 %	20 %	0 %	283782645
84	NC_013721	TGCAG	2	10	156758	156767	20 %	20 %	40 %	20 %	283782646
85	NC_013721	GAGTC	2	10	157413	157422	20 %	20 %	40 %	20 %	283782646
86	NC_013721	TTGGC	2	10	165205	165214	0 %	40 %	40 %	20 %	283782653
87	NC_013721	AAGTA	2	10	165867	165876	60 %	20 %	20 %	0 %	283782654
88	NC_013721	AGCGC	2	10	166052	166061	20 %	0 %	40 %	40 %	283782655
89	NC_013721	AAGCT	2	10	168059	168068	40 %	20 %	20 %	20 %	283782656
90	NC_013721	CCATT	2	10	170196	170205	20 %	40 %	0 %	40 %	283782658
91	NC_013721	CTTAT	2	10	172013	172022	20 %	60 %	0 %	20 %	283782661
92	NC_013721	AACGC	2	10	172419	172428	40 %	0 %	20 %	40 %	283782661
93	NC_013721	GCAAT	2	10	174116	174125	40 %	20 %	20 %	20 %	283782662
94	NC_013721	TGCTA	2	10	176930	176939	20 %	40 %	20 %	20 %	283782664
95	NC_013721	TTATA	2	10	177673	177682	40 %	60 %	0 %	0 %	283782665
96	NC_013721	GGCAT	2	10	179228	179237	20 %	20 %	40 %	20 %	283782667
97	NC_013721	TTATT	2	10	179748	179757	20 %	80 %	0 %	0 %	283782668
98	NC_013721	GAGAT	2	10	180177	180186	40 %	20 %	40 %	0 %	283782668
99	NC_013721	TTGGA	2	10	184730	184739	20 %	40 %	40 %	0 %	283782672
100	NC_013721	TGTTT	2	10	186405	186414	0 %	80 %	20 %	0 %	283782674
101	NC_013721	GAAAT	2	10	187353	187362	60 %	20 %	20 %	0 %	283782674
102	NC_013721	TTCAA	2	10	189155	189164	40 %	40 %	0 %	20 %	283782676
103	NC_013721	GTTGC	2	10	191570	191579	0 %	40 %	40 %	20 %	283782680
104	NC_013721	TTTAA	2	10	194324	194333	40 %	60 %	0 %	0 %	283782685
105	NC_013721	GTGTG	2	10	198134	198143	0 %	40 %	60 %	0 %	283782687
106	NC_013721	TTTGA	2	10	200707	200716	20 %	60 %	20 %	0 %	283782690
107	NC_013721	AATGG	2	10	203604	203613	40 %	20 %	40 %	0 %	283782693
108	NC_013721	TCACG	2	10	205505	205514	20 %	20 %	20 %	40 %	283782695
109	NC_013721	CACAA	2	10	207590	207599	60 %	0 %	0 %	40 %	283782696
110	NC_013721	TAACT	2	10	207859	207868	40 %	40 %	0 %	20 %	283782696
111	NC_013721	AAGCT	2	10	207873	207882	40 %	20 %	20 %	20 %	283782696
112	NC_013721	TGTGG	2	10	212476	212485	0 %	40 %	60 %	0 %	283782701
113	NC_013721	CTTGG	2	10	215877	215886	0 %	40 %	40 %	20 %	283782702
114	NC_013721	TGCCT	2	10	216986	216995	0 %	40 %	20 %	40 %	283782703
115	NC_013721	CACAA	2	10	219515	219524	60 %	0 %	0 %	40 %	283782706
116	NC_013721	TACAA	2	10	220149	220158	60 %	20 %	0 %	20 %	283782706
117	NC_013721	TGCAT	2	10	220763	220772	20 %	40 %	20 %	20 %	283782706
118	NC_013721	TGCCT	2	10	226926	226935	0 %	40 %	20 %	40 %	283782713
119	NC_013721	GAACA	2	10	227765	227774	60 %	0 %	20 %	20 %	283782714
120	NC_013721	ATGCA	2	10	230431	230440	40 %	20 %	20 %	20 %	283782715
121	NC_013721	TCAAA	2	10	230817	230826	60 %	20 %	0 %	20 %	283782715
122	NC_013721	CTTTG	2	10	233889	233898	0 %	60 %	20 %	20 %	283782717
123	NC_013721	ATTGG	2	10	235032	235041	20 %	40 %	40 %	0 %	283782718
124	NC_013721	TACGC	2	10	236321	236330	20 %	20 %	20 %	40 %	283782720
125	NC_013721	ATCGC	2	10	237142	237151	20 %	20 %	20 %	40 %	283782720
126	NC_013721	GCAGA	2	10	241543	241552	40 %	0 %	40 %	20 %	283782723
127	NC_013721	GCAGC	2	10	242428	242437	20 %	0 %	40 %	40 %	283782723
128	NC_013721	GATTT	2	10	242546	242555	20 %	60 %	20 %	0 %	283782723
129	NC_013721	TGTGC	2	10	245137	245146	0 %	40 %	40 %	20 %	283782725
130	NC_013721	GAAAG	2	10	247106	247115	60 %	0 %	40 %	0 %	283782728
131	NC_013721	CTGCT	2	10	247232	247241	0 %	40 %	20 %	40 %	283782728
132	NC_013721	TGGGC	2	10	249111	249120	0 %	20 %	60 %	20 %	283782729
133	NC_013721	TGCTG	2	10	252879	252888	0 %	40 %	40 %	20 %	283782732
134	NC_013721	CTTGG	2	10	254151	254160	0 %	40 %	40 %	20 %	283782734
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