MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 4043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013721	CGAT	2	8	111	118	25 %	25 %	25 %	25 %	283782521
2	NC_013721	CTAC	2	8	214	221	25 %	25 %	0 %	50 %	283782521
3	NC_013721	AAGT	2	8	597	604	50 %	25 %	25 %	0 %	283782521
4	NC_013721	TCCC	2	8	727	734	0 %	25 %	0 %	75 %	283782521
5	NC_013721	CTTC	2	8	865	872	0 %	50 %	0 %	50 %	283782521
6	NC_013721	CGAG	2	8	1660	1667	25 %	0 %	50 %	25 %	283782522
7	NC_013721	ATGT	2	8	2220	2227	25 %	50 %	25 %	0 %	283782522
8	NC_013721	CTTC	2	8	2636	2643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013721	ACTT	2	8	3248	3255	25 %	50 %	0 %	25 %	283782523
10	NC_013721	ATTT	2	8	3480	3487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013721	AAAT	2	8	3558	3565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013721	ATGC	2	8	3714	3721	25 %	25 %	25 %	25 %	283782524
13	NC_013721	ATAA	2	8	4111	4118	75 %	25 %	0 %	0 %	283782524
14	NC_013721	TTGA	2	8	4402	4409	25 %	50 %	25 %	0 %	283782524
15	NC_013721	GTTG	2	8	4577	4584	0 %	50 %	50 %	0 %	283782524
16	NC_013721	TGGA	2	8	4810	4817	25 %	25 %	50 %	0 %	283782524
17	NC_013721	TAAT	2	8	4862	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013721	ATAG	2	8	4891	4898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013721	AGTA	2	8	5208	5215	50 %	25 %	25 %	0 %	283782525
20	NC_013721	GATT	2	8	5394	5401	25 %	50 %	25 %	0 %	283782525
21	NC_013721	CTTG	2	8	5898	5905	0 %	50 %	25 %	25 %	283782525
22	NC_013721	ACTA	2	8	6156	6163	50 %	25 %	0 %	25 %	283782525
23	NC_013721	GAAT	2	8	6293	6300	50 %	25 %	25 %	0 %	283782525
24	NC_013721	CAAA	2	8	6854	6861	75 %	0 %	0 %	25 %	283782525
25	NC_013721	AAAG	2	8	7809	7816	75 %	0 %	25 %	0 %	283782525
26	NC_013721	ACAA	2	8	7829	7836	75 %	0 %	0 %	25 %	283782525
27	NC_013721	TGTT	2	8	7913	7920	0 %	75 %	25 %	0 %	283782525
28	NC_013721	GTAA	2	8	8399	8406	50 %	25 %	25 %	0 %	283782526
29	NC_013721	AAGC	2	8	8422	8429	50 %	0 %	25 %	25 %	283782526
30	NC_013721	ACGT	2	8	8619	8626	25 %	25 %	25 %	25 %	283782526
31	NC_013721	GCAT	2	8	8913	8920	25 %	25 %	25 %	25 %	283782526
32	NC_013721	ACTA	2	8	9168	9175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013721	TTTA	2	8	9205	9212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013721	CTTT	2	8	9265	9272	0 %	75 %	0 %	25 %	283782527
35	NC_013721	CCAG	2	8	9512	9519	25 %	0 %	25 %	50 %	283782527
36	NC_013721	GCAA	2	8	9585	9592	50 %	0 %	25 %	25 %	283782527
37	NC_013721	TGGC	2	8	9811	9818	0 %	25 %	50 %	25 %	283782527
38	NC_013721	AATA	2	8	10046	10053	75 %	25 %	0 %	0 %	283782527
39	NC_013721	ACTG	2	8	11134	11141	25 %	25 %	25 %	25 %	283782528
40	NC_013721	AGAT	2	8	12795	12802	50 %	25 %	25 %	0 %	283782528
41	NC_013721	TTTA	2	8	13345	13352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013721	ATTT	2	8	13520	13527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013721	ATAA	2	8	13600	13607	75 %	25 %	0 %	0 %	283782529
44	NC_013721	AAGA	2	8	14012	14019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013721	ATCA	2	8	14050	14057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013721	CTAA	2	8	14443	14450	50 %	25 %	0 %	25 %	283782530
47	NC_013721	TCCT	2	8	14856	14863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013721	AGAA	2	8	15984	15991	75 %	0 %	25 %	0 %	283782531
49	NC_013721	AAAT	2	8	16860	16867	75 %	25 %	0 %	0 %	283782532
50	NC_013721	AATT	2	8	17409	17416	50 %	50 %	0 %	0 %	283782533
51	NC_013721	CAAG	2	8	18062	18069	50 %	0 %	25 %	25 %	283782533
52	NC_013721	ACAG	2	8	19223	19230	50 %	0 %	25 %	25 %	283782535
53	NC_013721	AGCA	2	8	19945	19952	50 %	0 %	25 %	25 %	283782535
54	NC_013721	AAGC	2	8	20070	20077	50 %	0 %	25 %	25 %	283782535
55	NC_013721	TGGA	2	8	20980	20987	25 %	25 %	50 %	0 %	283782535
56	NC_013721	CAAA	2	8	21075	21082	75 %	0 %	0 %	25 %	283782535
57	NC_013721	GCAA	2	8	21332	21339	50 %	0 %	25 %	25 %	283782535
58	NC_013721	AGTT	2	8	21391	21398	25 %	50 %	25 %	0 %	283782535
59	NC_013721	ATTC	2	8	21541	21548	25 %	50 %	0 %	25 %	283782535
60	NC_013721	CGTG	2	8	22358	22365	0 %	25 %	50 %	25 %	283782536
61	NC_013721	TTGC	2	8	22876	22883	0 %	50 %	25 %	25 %	283782536
62	NC_013721	CTTG	2	8	22898	22905	0 %	50 %	25 %	25 %	283782536
63	NC_013721	TCGT	2	8	23527	23534	0 %	50 %	25 %	25 %	283782536
64	NC_013721	TAAT	2	8	23864	23871	50 %	50 %	0 %	0 %	283782537
65	NC_013721	AATT	2	8	24200	24207	50 %	50 %	0 %	0 %	283782537
66	NC_013721	CGTC	2	8	24270	24277	0 %	25 %	25 %	50 %	283782537
67	NC_013721	TATT	2	8	25907	25914	25 %	75 %	0 %	0 %	283782539
68	NC_013721	CAAG	2	8	27195	27202	50 %	0 %	25 %	25 %	283782540
69	NC_013721	GCCA	2	8	27367	27374	25 %	0 %	25 %	50 %	283782540
70	NC_013721	CTAC	2	8	27549	27556	25 %	25 %	0 %	50 %	283782540
71	NC_013721	CGTT	2	8	27804	27811	0 %	50 %	25 %	25 %	283782540
72	NC_013721	TGTT	2	8	29530	29537	0 %	75 %	25 %	0 %	283782542
73	NC_013721	AACA	2	8	30829	30836	75 %	0 %	0 %	25 %	283782543
74	NC_013721	CATA	2	8	30990	30997	50 %	25 %	0 %	25 %	283782543
75	NC_013721	ATAA	2	8	31195	31202	75 %	25 %	0 %	0 %	283782543
76	NC_013721	GCTG	2	8	31255	31262	0 %	25 %	50 %	25 %	283782543
77	NC_013721	AAAC	2	8	31405	31412	75 %	0 %	0 %	25 %	283782543
78	NC_013721	GTTT	2	8	31631	31638	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013721	CAAT	2	8	32051	32058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013721	TATT	2	8	32199	32206	25 %	75 %	0 %	0 %	283782545
81	NC_013721	GAAA	2	8	32268	32275	75 %	0 %	25 %	0 %	283782545
82	NC_013721	AATT	2	8	32327	32334	50 %	50 %	0 %	0 %	283782545
83	NC_013721	AGGA	2	8	32935	32942	50 %	0 %	50 %	0 %	283782546
84	NC_013721	AAGC	2	8	33278	33285	50 %	0 %	25 %	25 %	283782546
85	NC_013721	TCTT	2	8	33716	33723	0 %	75 %	0 %	25 %	283782546
86	NC_013721	ATTC	2	8	33816	33823	25 %	50 %	0 %	25 %	283782546
87	NC_013721	ATTT	2	8	33918	33925	25 %	75 %	0 %	0 %	283782546
88	NC_013721	TAAA	2	8	34190	34197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013721	TCTT	2	8	34927	34934	0 %	75 %	0 %	25 %	283782547
90	NC_013721	CATT	2	8	36083	36090	25 %	50 %	0 %	25 %	283782547
91	NC_013721	AATA	2	8	36799	36806	75 %	25 %	0 %	0 %	283782548
92	NC_013721	AACT	2	8	37361	37368	50 %	25 %	0 %	25 %	283782548
93	NC_013721	ATTT	2	8	38271	38278	25 %	75 %	0 %	0 %	283782549
94	NC_013721	GCTC	2	8	38949	38956	0 %	25 %	25 %	50 %	283782550
95	NC_013721	GCAA	2	8	39066	39073	50 %	0 %	25 %	25 %	283782550
96	NC_013721	ATAA	2	8	39329	39336	75 %	25 %	0 %	0 %	283782550
97	NC_013721	TAGC	2	8	39346	39353	25 %	25 %	25 %	25 %	283782550
98	NC_013721	ATCC	2	8	39573	39580	25 %	25 %	0 %	50 %	283782550
99	NC_013721	TCTG	2	8	40294	40301	0 %	50 %	25 %	25 %	283782550
100	NC_013721	CGCA	2	8	40420	40427	25 %	0 %	25 %	50 %	283782551
101	NC_013721	ATAA	2	8	40597	40604	75 %	25 %	0 %	0 %	283782551
102	NC_013721	AATG	2	8	40739	40746	50 %	25 %	25 %	0 %	283782551
103	NC_013721	TTTA	2	8	41035	41042	25 %	75 %	0 %	0 %	283782551
104	NC_013721	ATCA	2	8	41431	41438	50 %	25 %	0 %	25 %	283782551
105	NC_013721	CATA	2	8	41844	41851	50 %	25 %	0 %	25 %	283782551
106	NC_013721	TGAT	2	8	42124	42131	25 %	50 %	25 %	0 %	283782552
107	NC_013721	TAAA	2	8	43693	43700	75 %	25 %	0 %	0 %	283782554
108	NC_013721	AAAG	2	8	45010	45017	75 %	0 %	25 %	0 %	283782556
109	NC_013721	TCAT	2	8	45292	45299	25 %	50 %	0 %	25 %	283782556
110	NC_013721	CATT	2	8	46519	46526	25 %	50 %	0 %	25 %	283782557
111	NC_013721	AGCA	2	8	46997	47004	50 %	0 %	25 %	25 %	283782557
112	NC_013721	TTGC	2	8	47400	47407	0 %	50 %	25 %	25 %	283782557
113	NC_013721	ATAG	2	8	47756	47763	50 %	25 %	25 %	0 %	283782557
114	NC_013721	ATAA	2	8	47864	47871	75 %	25 %	0 %	0 %	283782557
115	NC_013721	ATTT	2	8	48101	48108	25 %	75 %	0 %	0 %	283782557
116	NC_013721	TTGC	2	8	48784	48791	0 %	50 %	25 %	25 %	283782558
117	NC_013721	ATTT	2	8	50449	50456	25 %	75 %	0 %	0 %	283782559
118	NC_013721	TTGA	2	8	50587	50594	25 %	50 %	25 %	0 %	283782559
119	NC_013721	CTAG	2	8	51338	51345	25 %	25 %	25 %	25 %	283782560
120	NC_013721	TATT	2	8	51993	52000	25 %	75 %	0 %	0 %	283782560
121	NC_013721	ATTA	2	8	52310	52317	50 %	50 %	0 %	0 %	283782561
122	NC_013721	AAGT	2	8	52461	52468	50 %	25 %	25 %	0 %	283782561
123	NC_013721	CCAT	2	8	52501	52508	25 %	25 %	0 %	50 %	283782561
124	NC_013721	TTTC	2	8	52603	52610	0 %	75 %	0 %	25 %	283782561
125	NC_013721	GAAT	2	8	52867	52874	50 %	25 %	25 %	0 %	283782561
126	NC_013721	TAGA	2	8	52910	52917	50 %	25 %	25 %	0 %	283782561
127	NC_013721	GCAT	2	8	53972	53979	25 %	25 %	25 %	25 %	283782562
128	NC_013721	CGAG	2	8	54071	54078	25 %	0 %	50 %	25 %	283782562
129	NC_013721	AACC	2	8	55376	55383	50 %	0 %	0 %	50 %	283782562
130	NC_013721	TTTA	2	8	55735	55742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013721	TAAT	2	8	55962	55969	50 %	50 %	0 %	0 %	283782563
132	NC_013721	GAAT	2	8	57013	57020	50 %	25 %	25 %	0 %	283782566
133	NC_013721	CCTA	2	8	57260	57267	25 %	25 %	0 %	50 %	283782566
134	NC_013721	TAAT	2	8	58030	58037	50 %	50 %	0 %	0 %	283782567
135	NC_013721	TAAT	2	8	58588	58595	50 %	50 %	0 %	0 %	283782567
136	NC_013721	TTTA	2	8	58597	58604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013721	TATT	2	8	58685	58692	25 %	75 %	0 %	0 %	283782568
138	NC_013721	GTAG	2	8	58999	59006	25 %	25 %	50 %	0 %	283782568
139	NC_013721	TTGA	2	8	59065	59072	25 %	50 %	25 %	0 %	283782568
140	NC_013721	TGGA	2	8	59247	59254	25 %	25 %	50 %	0 %	283782568
141	NC_013721	CAAC	2	8	59401	59408	50 %	0 %	0 %	50 %	283782568
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