MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD2

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013718	AAACTC	2	12	2206	2217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	283488389
2	NC_013718	CCTTCA	2	12	5221	5232	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	283488396
3	NC_013718	TGCCTG	2	12	8244	8255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013718	ACACAT	2	12	10719	10730	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	283488405
5	NC_013718	CAAGAA	2	12	15579	15590	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	283488413
6	NC_013718	AACGGC	2	12	16829	16840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488413
7	NC_013718	ATCTGA	2	12	18080	18091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283488414
8	NC_013718	AAAAAC	2	12	20544	20555	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	283488418
9	NC_013718	ACGACT	2	12	23826	23837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283488423
10	NC_013718	AAATCA	2	12	24262	24273	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	283488423
11	NC_013718	TTCCTG	2	12	28122	28133	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	283488426
12	NC_013718	TGAAAC	2	12	28532	28543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	283488427
13	NC_013718	ACCTGC	2	12	29904	29915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283488429
14	NC_013718	CCATTA	2	12	33951	33962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488431
15	NC_013718	TTCTTT	2	12	35771	35782	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	283488433
16	NC_013718	GTTTTC	2	12	36281	36292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013718	TGCTCA	2	12	38714	38725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	283488437

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.