MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD2

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013718	AAAAC	2	10	564	573	80 %	0 %	0 %	20 %	283488385
2	NC_013718	CAGAT	2	10	1257	1266	40 %	20 %	20 %	20 %	283488386
3	NC_013718	CATTT	2	10	1685	1694	20 %	60 %	0 %	20 %	283488387
4	NC_013718	CCTGC	2	10	1702	1711	0 %	20 %	20 %	60 %	283488388
5	NC_013718	ATTTT	2	10	2143	2152	20 %	80 %	0 %	0 %	283488389
6	NC_013718	ACCAG	2	10	3493	3502	40 %	0 %	20 %	40 %	283488392
7	NC_013718	CCTGC	2	10	3782	3791	0 %	20 %	20 %	60 %	283488393
8	NC_013718	ATCGC	2	10	4255	4264	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013718	GCAGA	2	10	8068	8077	40 %	0 %	40 %	20 %	283488399
10	NC_013718	GATTA	2	10	9199	9208	40 %	40 %	20 %	0 %	283488402
11	NC_013718	GGCAG	2	10	11875	11884	20 %	0 %	60 %	20 %	283488407
12	NC_013718	GAGCA	2	10	11937	11946	40 %	0 %	40 %	20 %	283488407
13	NC_013718	TAAGG	2	10	12729	12738	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013718	CGGCA	2	10	13296	13305	20 %	0 %	40 %	40 %	283488409
15	NC_013718	TGAAG	2	10	13566	13575	40 %	20 %	40 %	0 %	283488409
16	NC_013718	TTTCT	2	10	16049	16058	0 %	80 %	0 %	20 %	283488413
17	NC_013718	TGAAC	2	10	16467	16476	40 %	20 %	20 %	20 %	283488413
18	NC_013718	GCTTT	2	10	16598	16607	0 %	60 %	20 %	20 %	283488413
19	NC_013718	AATAC	2	10	18472	18481	60 %	20 %	0 %	20 %	283488415
20	NC_013718	AAAAT	2	10	18701	18710	80 %	20 %	0 %	0 %	283488416
21	NC_013718	TGATT	2	10	21540	21549	20 %	60 %	20 %	0 %	283488420
22	NC_013718	CTTTC	2	10	23604	23613	0 %	60 %	0 %	40 %	283488423
23	NC_013718	CTTTC	2	10	27025	27034	0 %	60 %	0 %	40 %	283488425
24	NC_013718	GATCA	2	10	31095	31104	40 %	20 %	20 %	20 %	283488430
25	NC_013718	GCAAA	2	10	31137	31146	60 %	0 %	20 %	20 %	283488430
26	NC_013718	TCCAC	2	10	34280	34289	20 %	20 %	0 %	60 %	283488431
27	NC_013718	TCATT	2	10	34455	34464	20 %	60 %	0 %	20 %	283488431
28	NC_013718	TTTCT	2	10	34495	34504	0 %	80 %	0 %	20 %	283488431
29	NC_013718	GTCTG	2	10	34546	34555	0 %	40 %	40 %	20 %	283488431
30	NC_013718	GTAAA	2	10	34565	34574	60 %	20 %	20 %	0 %	283488431
31	NC_013718	GTAAT	2	10	38206	38215	40 %	40 %	20 %	0 %	283488436
32	NC_013718	CGCTG	2	10	39248	39257	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.