MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD2

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013718	GT	3	6	3337	3342	0 %	50 %	50 %	0 %	283488392
2	NC_013718	AC	3	6	4243	4248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013718	AC	3	6	4283	4288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013718	GA	3	6	4404	4409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013718	CT	3	6	4771	4776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013718	TA	3	6	7170	7175	50 %	50 %	0 %	0 %	283488398
7	NC_013718	TA	3	6	7284	7289	50 %	50 %	0 %	0 %	283488398
8	NC_013718	AG	3	6	7732	7737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013718	GA	3	6	7779	7784	50 %	0 %	50 %	0 %	283488399
10	NC_013718	GT	4	8	8708	8715	0 %	50 %	50 %	0 %	283488400
11	NC_013718	TA	3	6	9003	9008	50 %	50 %	0 %	0 %	283488401
12	NC_013718	TA	4	8	9045	9052	50 %	50 %	0 %	0 %	283488401
13	NC_013718	TA	3	6	9455	9460	50 %	50 %	0 %	0 %	283488403
14	NC_013718	CA	3	6	9584	9589	50 %	0 %	0 %	50 %	283488403
15	NC_013718	GT	3	6	9654	9659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013718	GT	3	6	9993	9998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013718	GT	3	6	10122	10127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013718	GT	3	6	10438	10443	0 %	50 %	50 %	0 %	283488405
19	NC_013718	GT	3	6	10822	10827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013718	GT	3	6	10893	10898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013718	CG	3	6	11064	11069	0 %	0 %	50 %	50 %	283488406
22	NC_013718	CA	3	6	11219	11224	50 %	0 %	0 %	50 %	283488406
23	NC_013718	GA	3	6	11567	11572	50 %	0 %	50 %	0 %	283488406
24	NC_013718	GA	3	6	11661	11666	50 %	0 %	50 %	0 %	283488406
25	NC_013718	TC	3	6	12268	12273	0 %	50 %	0 %	50 %	283488408
26	NC_013718	AT	3	6	13062	13067	50 %	50 %	0 %	0 %	283488409
27	NC_013718	AT	3	6	13101	13106	50 %	50 %	0 %	0 %	283488409
28	NC_013718	GT	3	6	17980	17985	0 %	50 %	50 %	0 %	283488414
29	NC_013718	AC	3	6	18578	18583	50 %	0 %	0 %	50 %	283488415
30	NC_013718	AT	3	6	18909	18914	50 %	50 %	0 %	0 %	283488416
31	NC_013718	AT	3	6	19164	19169	50 %	50 %	0 %	0 %	283488416
32	NC_013718	AT	3	6	19485	19490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013718	AC	3	6	19836	19841	50 %	0 %	0 %	50 %	283488417
34	NC_013718	TC	3	6	26071	26076	0 %	50 %	0 %	50 %	283488424
35	NC_013718	TG	3	6	26840	26845	0 %	50 %	50 %	0 %	283488425
36	NC_013718	TA	3	6	28735	28740	50 %	50 %	0 %	0 %	283488427
37	NC_013718	CA	3	6	29199	29204	50 %	0 %	0 %	50 %	283488428
38	NC_013718	AT	3	6	30038	30043	50 %	50 %	0 %	0 %	283488429
39	NC_013718	TG	3	6	30601	30606	0 %	50 %	50 %	0 %	283488429
40	NC_013718	AC	3	6	31600	31605	50 %	0 %	0 %	50 %	283488430
41	NC_013718	GC	3	6	31765	31770	0 %	0 %	50 %	50 %	283488430
42	NC_013718	TC	3	6	33188	33193	0 %	50 %	0 %	50 %	283488431
43	NC_013718	AT	3	6	33987	33992	50 %	50 %	0 %	0 %	283488431
44	NC_013718	GT	3	6	34575	34580	0 %	50 %	50 %	0 %	283488431
45	NC_013718	TA	3	6	34876	34881	50 %	50 %	0 %	0 %	283488431
46	NC_013718	AC	3	6	34990	34995	50 %	0 %	0 %	50 %	283488431
47	NC_013718	TG	3	6	35659	35664	0 %	50 %	50 %	0 %	283488433
48	NC_013718	AT	3	6	36212	36217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013718	CT	3	6	37243	37248	0 %	50 %	0 %	50 %	283488436
50	NC_013718	CT	3	6	37363	37368	0 %	50 %	0 %	50 %	283488436

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.