MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD2

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013718	A	7	7	37	43	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013718	T	7	7	597	603	0 %	100 %	0 %	0 %	283488385
3	NC_013718	A	6	6	701	706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013718	T	7	7	729	735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013718	C	6	6	1373	1378	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_013718	T	7	7	1793	1799	0 %	100 %	0 %	0 %	283488388
7	NC_013718	T	6	6	1824	1829	0 %	100 %	0 %	0 %	283488388
8	NC_013718	T	6	6	2260	2265	0 %	100 %	0 %	0 %	283488389
9	NC_013718	T	7	7	2338	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	283488389
10	NC_013718	T	6	6	2601	2606	0 %	100 %	0 %	0 %	283488390
11	NC_013718	T	7	7	2807	2813	0 %	100 %	0 %	0 %	283488391
12	NC_013718	A	7	7	3136	3142	100 %	0 %	0 %	0 %	283488391
13	NC_013718	T	6	6	3393	3398	0 %	100 %	0 %	0 %	283488392
14	NC_013718	T	6	6	3770	3775	0 %	100 %	0 %	0 %	283488392
15	NC_013718	T	7	7	3873	3879	0 %	100 %	0 %	0 %	283488393
16	NC_013718	T	6	6	3904	3909	0 %	100 %	0 %	0 %	283488393
17	NC_013718	C	6	6	4557	4562	0 %	0 %	0 %	100 %	283488394
18	NC_013718	A	6	6	4777	4782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013718	T	8	8	5251	5258	0 %	100 %	0 %	0 %	283488396
20	NC_013718	A	6	6	5370	5375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013718	T	8	8	5445	5452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013718	A	6	6	6087	6092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013718	T	7	7	6112	6118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013718	T	6	6	6127	6132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013718	T	6	6	6186	6191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013718	T	6	6	6348	6353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013718	T	6	6	6374	6379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013718	A	9	9	6598	6606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013718	A	8	8	6967	6974	100 %	0 %	0 %	0 %	283488398
30	NC_013718	A	8	8	7438	7445	100 %	0 %	0 %	0 %	283488398
31	NC_013718	A	7	7	7525	7531	100 %	0 %	0 %	0 %	283488398
32	NC_013718	T	6	6	7704	7709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013718	A	6	6	8302	8307	100 %	0 %	0 %	0 %	283488400
34	NC_013718	A	6	6	8689	8694	100 %	0 %	0 %	0 %	283488400
35	NC_013718	T	6	6	8733	8738	0 %	100 %	0 %	0 %	283488400
36	NC_013718	T	7	7	9026	9032	0 %	100 %	0 %	0 %	283488401
37	NC_013718	T	6	6	10241	10246	0 %	100 %	0 %	0 %	283488405
38	NC_013718	A	6	6	11001	11006	100 %	0 %	0 %	0 %	283488406
39	NC_013718	T	7	7	11748	11754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013718	A	8	8	11818	11825	100 %	0 %	0 %	0 %	283488407
41	NC_013718	T	6	6	11835	11840	0 %	100 %	0 %	0 %	283488407
42	NC_013718	G	6	6	12145	12150	0 %	0 %	100 %	0 %	283488408
43	NC_013718	A	7	7	12186	12192	100 %	0 %	0 %	0 %	283488408
44	NC_013718	A	6	6	12608	12613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013718	A	6	6	13143	13148	100 %	0 %	0 %	0 %	283488409
46	NC_013718	T	6	6	14350	14355	0 %	100 %	0 %	0 %	283488410
47	NC_013718	T	6	6	14392	14397	0 %	100 %	0 %	0 %	283488410
48	NC_013718	T	7	7	14722	14728	0 %	100 %	0 %	0 %	283488410
49	NC_013718	T	6	6	16147	16152	0 %	100 %	0 %	0 %	283488413
50	NC_013718	T	6	6	16770	16775	0 %	100 %	0 %	0 %	283488413
51	NC_013718	T	7	7	16848	16854	0 %	100 %	0 %	0 %	283488413
52	NC_013718	G	6	6	18529	18534	0 %	0 %	100 %	0 %	283488415
53	NC_013718	T	6	6	18604	18609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013718	T	6	6	19039	19044	0 %	100 %	0 %	0 %	283488416
55	NC_013718	T	6	6	19948	19953	0 %	100 %	0 %	0 %	283488417
56	NC_013718	T	6	6	20338	20343	0 %	100 %	0 %	0 %	283488418
57	NC_013718	A	8	8	20491	20498	100 %	0 %	0 %	0 %	283488418
58	NC_013718	T	6	6	21103	21108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013718	T	6	6	22908	22913	0 %	100 %	0 %	0 %	283488421
60	NC_013718	A	7	7	22929	22935	100 %	0 %	0 %	0 %	283488421
61	NC_013718	T	6	6	23080	23085	0 %	100 %	0 %	0 %	283488421
62	NC_013718	A	6	6	23144	23149	100 %	0 %	0 %	0 %	283488422
63	NC_013718	T	6	6	24188	24193	0 %	100 %	0 %	0 %	283488423
64	NC_013718	C	6	6	24601	24606	0 %	0 %	0 %	100 %	283488423
65	NC_013718	A	6	6	25731	25736	100 %	0 %	0 %	0 %	283488424
66	NC_013718	A	6	6	25759	25764	100 %	0 %	0 %	0 %	283488424
67	NC_013718	T	7	7	25969	25975	0 %	100 %	0 %	0 %	283488424
68	NC_013718	T	7	7	27487	27493	0 %	100 %	0 %	0 %	283488425
69	NC_013718	C	6	6	28408	28413	0 %	0 %	0 %	100 %	283488427
70	NC_013718	T	7	7	28570	28576	0 %	100 %	0 %	0 %	283488427
71	NC_013718	T	6	6	28888	28893	0 %	100 %	0 %	0 %	283488427
72	NC_013718	T	6	6	29077	29082	0 %	100 %	0 %	0 %	283488427
73	NC_013718	A	8	8	29583	29590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013718	A	7	7	30220	30226	100 %	0 %	0 %	0 %	283488429
75	NC_013718	T	6	6	31049	31054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013718	A	7	7	31755	31761	100 %	0 %	0 %	0 %	283488430
77	NC_013718	T	6	6	32115	32120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013718	T	7	7	32658	32664	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
79	NC_013718	T	6	6	33503	33508	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
80	NC_013718	T	6	6	34010	34015	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
81	NC_013718	A	6	6	34270	34275	100 %	0 %	0 %	0 %	283488431
82	NC_013718	T	6	6	34326	34331	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
83	NC_013718	T	7	7	34512	34518	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
84	NC_013718	A	7	7	34978	34984	100 %	0 %	0 %	0 %	283488431
85	NC_013718	T	6	6	35670	35675	0 %	100 %	0 %	0 %	283488433
86	NC_013718	T	8	8	35717	35724	0 %	100 %	0 %	0 %	283488433
87	NC_013718	A	6	6	36411	36416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013718	T	6	6	36449	36454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013718	A	7	7	36576	36582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013718	T	7	7	36852	36858	0 %	100 %	0 %	0 %	283488434
91	NC_013718	T	6	6	37263	37268	0 %	100 %	0 %	0 %	283488436
92	NC_013718	T	6	6	37524	37529	0 %	100 %	0 %	0 %	283488436
93	NC_013718	T	6	6	37649	37654	0 %	100 %	0 %	0 %	283488436
94	NC_013718	T	6	6	37770	37775	0 %	100 %	0 %	0 %	283488436
95	NC_013718	T	6	6	38631	38636	0 %	100 %	0 %	0 %	283488437
96	NC_013718	A	6	6	39185	39190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.