MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD2

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013718	T	7	7	597	603	0 %	100 %	0 %	0 %	283488385
2	NC_013718	T	7	7	1793	1799	0 %	100 %	0 %	0 %	283488388
3	NC_013718	T	6	6	1824	1829	0 %	100 %	0 %	0 %	283488388
4	NC_013718	T	6	6	2260	2265	0 %	100 %	0 %	0 %	283488389
5	NC_013718	T	7	7	2338	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	283488389
6	NC_013718	T	6	6	2601	2606	0 %	100 %	0 %	0 %	283488390
7	NC_013718	T	7	7	2807	2813	0 %	100 %	0 %	0 %	283488391
8	NC_013718	A	7	7	3136	3142	100 %	0 %	0 %	0 %	283488391
9	NC_013718	T	6	6	3393	3398	0 %	100 %	0 %	0 %	283488392
10	NC_013718	T	6	6	3770	3775	0 %	100 %	0 %	0 %	283488392
11	NC_013718	T	7	7	3873	3879	0 %	100 %	0 %	0 %	283488393
12	NC_013718	T	6	6	3904	3909	0 %	100 %	0 %	0 %	283488393
13	NC_013718	C	6	6	4557	4562	0 %	0 %	0 %	100 %	283488394
14	NC_013718	T	8	8	5251	5258	0 %	100 %	0 %	0 %	283488396
15	NC_013718	A	8	8	6967	6974	100 %	0 %	0 %	0 %	283488398
16	NC_013718	A	8	8	7438	7445	100 %	0 %	0 %	0 %	283488398
17	NC_013718	A	7	7	7525	7531	100 %	0 %	0 %	0 %	283488398
18	NC_013718	A	6	6	8302	8307	100 %	0 %	0 %	0 %	283488400
19	NC_013718	A	6	6	8689	8694	100 %	0 %	0 %	0 %	283488400
20	NC_013718	T	6	6	8733	8738	0 %	100 %	0 %	0 %	283488400
21	NC_013718	T	7	7	9026	9032	0 %	100 %	0 %	0 %	283488401
22	NC_013718	T	6	6	10241	10246	0 %	100 %	0 %	0 %	283488405
23	NC_013718	A	6	6	11001	11006	100 %	0 %	0 %	0 %	283488406
24	NC_013718	A	8	8	11818	11825	100 %	0 %	0 %	0 %	283488407
25	NC_013718	T	6	6	11835	11840	0 %	100 %	0 %	0 %	283488407
26	NC_013718	G	6	6	12145	12150	0 %	0 %	100 %	0 %	283488408
27	NC_013718	A	7	7	12186	12192	100 %	0 %	0 %	0 %	283488408
28	NC_013718	A	6	6	13143	13148	100 %	0 %	0 %	0 %	283488409
29	NC_013718	T	6	6	14350	14355	0 %	100 %	0 %	0 %	283488410
30	NC_013718	T	6	6	14392	14397	0 %	100 %	0 %	0 %	283488410
31	NC_013718	T	7	7	14722	14728	0 %	100 %	0 %	0 %	283488410
32	NC_013718	T	6	6	16147	16152	0 %	100 %	0 %	0 %	283488413
33	NC_013718	T	6	6	16770	16775	0 %	100 %	0 %	0 %	283488413
34	NC_013718	T	7	7	16848	16854	0 %	100 %	0 %	0 %	283488413
35	NC_013718	G	6	6	18529	18534	0 %	0 %	100 %	0 %	283488415
36	NC_013718	T	6	6	19039	19044	0 %	100 %	0 %	0 %	283488416
37	NC_013718	T	6	6	19948	19953	0 %	100 %	0 %	0 %	283488417
38	NC_013718	T	6	6	20338	20343	0 %	100 %	0 %	0 %	283488418
39	NC_013718	A	8	8	20491	20498	100 %	0 %	0 %	0 %	283488418
40	NC_013718	T	6	6	22908	22913	0 %	100 %	0 %	0 %	283488421
41	NC_013718	A	7	7	22929	22935	100 %	0 %	0 %	0 %	283488421
42	NC_013718	T	6	6	23080	23085	0 %	100 %	0 %	0 %	283488421
43	NC_013718	A	6	6	23144	23149	100 %	0 %	0 %	0 %	283488422
44	NC_013718	T	6	6	24188	24193	0 %	100 %	0 %	0 %	283488423
45	NC_013718	C	6	6	24601	24606	0 %	0 %	0 %	100 %	283488423
46	NC_013718	A	6	6	25731	25736	100 %	0 %	0 %	0 %	283488424
47	NC_013718	A	6	6	25759	25764	100 %	0 %	0 %	0 %	283488424
48	NC_013718	T	7	7	25969	25975	0 %	100 %	0 %	0 %	283488424
49	NC_013718	T	7	7	27487	27493	0 %	100 %	0 %	0 %	283488425
50	NC_013718	C	6	6	28408	28413	0 %	0 %	0 %	100 %	283488427
51	NC_013718	T	7	7	28570	28576	0 %	100 %	0 %	0 %	283488427
52	NC_013718	T	6	6	28888	28893	0 %	100 %	0 %	0 %	283488427
53	NC_013718	T	6	6	29077	29082	0 %	100 %	0 %	0 %	283488427
54	NC_013718	A	7	7	30220	30226	100 %	0 %	0 %	0 %	283488429
55	NC_013718	A	7	7	31755	31761	100 %	0 %	0 %	0 %	283488430
56	NC_013718	T	7	7	32658	32664	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
57	NC_013718	T	6	6	33503	33508	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
58	NC_013718	T	6	6	34010	34015	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
59	NC_013718	A	6	6	34270	34275	100 %	0 %	0 %	0 %	283488431
60	NC_013718	T	6	6	34326	34331	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
61	NC_013718	T	7	7	34512	34518	0 %	100 %	0 %	0 %	283488431
62	NC_013718	A	7	7	34978	34984	100 %	0 %	0 %	0 %	283488431
63	NC_013718	T	6	6	35670	35675	0 %	100 %	0 %	0 %	283488433
64	NC_013718	T	8	8	35717	35724	0 %	100 %	0 %	0 %	283488433
65	NC_013718	T	7	7	36852	36858	0 %	100 %	0 %	0 %	283488434
66	NC_013718	T	6	6	37263	37268	0 %	100 %	0 %	0 %	283488436
67	NC_013718	T	6	6	37524	37529	0 %	100 %	0 %	0 %	283488436
68	NC_013718	T	6	6	37649	37654	0 %	100 %	0 %	0 %	283488436
69	NC_013718	T	6	6	37770	37775	0 %	100 %	0 %	0 %	283488436
70	NC_013718	T	6	6	38631	38636	0 %	100 %	0 %	0 %	283488437

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.