MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	GGTGGC	2	12	1282	1293	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	283777749
2	NC_013717	AGCCGC	2	12	4745	4756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013717	CAGGTG	2	12	10315	10326	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283777759
4	NC_013717	TGCTAC	2	12	14086	14097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	283777763
5	NC_013717	GCATCG	2	12	16421	16432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283777764
6	NC_013717	CATTAA	2	12	16702	16713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	283777764
7	NC_013717	AACTTT	2	12	19029	19040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	283777768
8	NC_013717	TTTATT	2	12	25247	25258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	283777771
9	NC_013717	CAAGAT	2	12	26050	26061	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	283777771
10	NC_013717	ATAACC	2	12	26316	26327	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013717	CCTGAC	2	12	27774	27785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013717	ACCGTT	2	12	30326	30337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	283777773
13	NC_013717	TATAAA	2	12	32596	32607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013717	TGACAG	2	12	34863	34874	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	283777780
15	NC_013717	ATAACC	2	12	40793	40804	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013717	CAACAT	2	12	42650	42661	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	283777787
17	NC_013717	AACCAC	2	12	44206	44217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013717	CAATTT	2	12	44965	44976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	283777790
19	NC_013717	GGCGCT	2	12	46934	46945	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283777793

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.