MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	CTCCG	2	10	4	13	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013717	CCTGT	2	10	1995	2004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013717	GCCCC	2	10	2151	2160	0 %	0 %	20 %	80 %	283777750
4	NC_013717	TCCCC	2	10	5066	5075	0 %	20 %	0 %	80 %	283777755
5	NC_013717	TGGCC	2	10	6616	6625	0 %	20 %	40 %	40 %	283777758
6	NC_013717	TGCTG	2	10	10823	10832	0 %	40 %	40 %	20 %	283777759
7	NC_013717	AAATT	2	10	12092	12101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013717	ACATA	2	10	12555	12564	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013717	ATTTT	2	10	12629	12638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013717	GCATT	2	10	14442	14451	20 %	40 %	20 %	20 %	283777763
11	NC_013717	TGTGG	2	10	16669	16678	0 %	40 %	60 %	0 %	283777764
12	NC_013717	CAAAA	2	10	17287	17296	80 %	0 %	0 %	20 %	283777765
13	NC_013717	ACCCC	2	10	17542	17551	20 %	0 %	0 %	80 %	283777765
14	NC_013717	GATTG	2	10	18913	18922	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013717	ATGGT	2	10	19472	19481	20 %	40 %	40 %	0 %	283777768
16	NC_013717	GGCAG	2	10	21001	21010	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013717	GGTGA	2	10	24066	24075	20 %	20 %	60 %	0 %	283777771
18	NC_013717	TTTTA	2	10	26415	26424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013717	TGTGT	2	10	26560	26569	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013717	GAACA	2	10	27959	27968	60 %	0 %	20 %	20 %	283777773
21	NC_013717	CAAAA	2	10	30857	30866	80 %	0 %	0 %	20 %	283777774
22	NC_013717	ATATT	2	10	32914	32923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013717	GGACG	2	10	34039	34048	20 %	0 %	60 %	20 %	283777778
24	NC_013717	TTCAT	2	10	34798	34807	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013717	GGTGA	2	10	38365	38374	20 %	20 %	60 %	0 %	283777784
26	NC_013717	TAAGC	2	10	40585	40594	40 %	20 %	20 %	20 %	283777784
27	NC_013717	TTTTA	2	10	40892	40901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013717	CATGA	2	10	43577	43586	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013717	AAAGA	2	10	46824	46833	80 %	0 %	20 %	0 %	283777793
30	NC_013717	TCCGG	2	10	50744	50753	0 %	20 %	40 %	40 %	283777797
31	NC_013717	ACATC	2	10	51220	51229	40 %	20 %	0 %	40 %	283777797
32	NC_013717	CGTTC	2	10	51692	51701	0 %	40 %	20 %	40 %	283777798
33	NC_013717	CAGAC	2	10	52721	52730	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013717	AAAAC	2	10	53217	53226	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.