MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	CGT	2	6	14	19	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013717	TCG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013717	GTA	2	6	192	197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013717	GAG	2	6	229	234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013717	AGA	2	6	521	526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013717	TCT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013717	CAA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013717	CCT	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013717	AAT	2	6	1670	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013717	TCA	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013717	GCC	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013717	ACT	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013717	CGG	2	6	2438	2443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013717	AAC	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013717	GCC	2	6	2476	2481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013717	ACA	2	6	4039	4044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013717	CTG	2	6	4286	4291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013717	GCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013717	CGT	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013717	ATT	2	6	4858	4863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013717	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013717	TAT	2	6	5705	5710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013717	AAT	2	6	11792	11797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013717	TCT	2	6	11799	11804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013717	ATG	2	6	12047	12052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013717	ATC	2	6	12078	12083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013717	GTT	2	6	12159	12164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013717	ATG	2	6	12273	12278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013717	TCA	2	6	12288	12293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013717	TGC	2	6	12693	12698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013717	GAT	2	6	12752	12757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013717	GCT	2	6	12897	12902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013717	AGC	2	6	12921	12926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013717	TCA	2	6	12945	12950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013717	AGG	2	6	12980	12985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013717	TTA	2	6	13018	13023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013717	TGC	2	6	13119	13124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013717	ATA	2	6	13239	13244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013717	GAT	2	6	13259	13264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013717	ATT	2	6	13265	13270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013717	CAA	2	6	14010	14015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013717	CAA	2	6	14024	14029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013717	GGA	2	6	14638	14643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013717	ACA	2	6	19931	19936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013717	AAT	2	6	20872	20877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013717	ATG	2	6	20888	20893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013717	TGA	2	6	21705	21710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013717	TAG	2	6	21718	21723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013717	TTG	2	6	21835	21840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013717	TGA	2	6	21888	21893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013717	TAT	2	6	22013	22018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013717	TAA	2	6	22052	22057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013717	TGT	2	6	22079	22084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013717	TTA	2	6	22162	22167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013717	AGC	2	6	22197	22202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013717	TTA	2	6	22246	22251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013717	ATA	2	6	26280	26285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013717	AGG	2	6	26341	26346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013717	GTT	2	6	26455	26460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013717	AGA	2	6	26478	26483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013717	CGG	2	6	26485	26490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013717	ATT	2	6	26554	26559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013717	TGT	2	6	26617	26622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013717	GCC	2	6	26830	26835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013717	TAC	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013717	GAT	2	6	26934	26939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013717	CAG	2	6	26979	26984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013717	AAT	2	6	26989	26994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013717	TGG	2	6	27008	27013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013717	TGA	2	6	27521	27526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013717	CAA	2	6	27527	27532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013717	TTC	2	6	27635	27640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013717	TGA	2	6	27821	27826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013717	CCT	2	6	27829	27834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013717	AGT	2	6	27871	27876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013717	GGT	2	6	27907	27912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013717	TAG	2	6	31071	31076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013717	GGA	2	6	31102	31107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013717	ACA	2	6	31477	31482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013717	TAC	2	6	32424	32429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013717	TAA	2	6	32571	32576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013717	ATC	2	6	32662	32667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013717	TTG	2	6	32716	32721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013717	AAT	2	6	32735	32740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013717	GCT	2	6	32766	32771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013717	CTG	2	6	32787	32792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013717	AGA	2	6	32806	32811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013717	AAT	2	6	32827	32832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013717	CTG	2	6	32881	32886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013717	CAT	2	6	33506	33511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013717	GCA	2	6	34665	34670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013717	TTG	2	6	34695	34700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013717	AGA	2	6	34721	34726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013717	GTA	2	6	34782	34787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013717	AGA	2	6	34823	34828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013717	TAT	2	6	35650	35655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013717	CGG	2	6	36498	36503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013717	ATA	2	6	40756	40761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013717	AGG	2	6	40818	40823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013717	ATG	2	6	40836	40841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013717	ATG	2	6	40947	40952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013717	TAA	2	6	43435	43440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013717	CGC	2	6	43446	43451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013717	GCT	2	6	43510	43515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013717	ACA	2	6	43538	43543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013717	GGA	2	6	43597	43602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013717	GCT	2	6	43609	43614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013717	ACG	2	6	43619	43624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013717	GAT	2	6	44027	44032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013717	GAT	3	9	44077	44085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013717	CAG	2	6	44096	44101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013717	AGC	2	6	44128	44133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013717	CAG	2	6	44142	44147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013717	AGG	2	6	44561	44566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013717	ATG	2	6	45577	45582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013717	CTA	2	6	45840	45845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013717	TTG	2	6	45846	45851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013717	TAT	2	6	46536	46541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013717	TGG	2	6	46543	46548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013717	TGG	2	6	46591	46596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013717	CAA	2	6	46708	46713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013717	AGG	2	6	47332	47337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013717	GGT	2	6	47557	47562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013717	GGA	2	6	48732	48737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013717	ACC	2	6	48955	48960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013717	TCT	2	6	49320	49325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013717	TCT	2	6	49354	49359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013717	TTC	2	6	49368	49373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013717	GTA	2	6	49563	49568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013717	CTT	2	6	49693	49698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013717	ATC	3	9	49835	49843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013717	TAG	2	6	49972	49977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013717	ATT	3	9	50022	50030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013717	GGA	2	6	52713	52718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013717	GGT	2	6	52885	52890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013717	TGA	2	6	52900	52905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013717	GGC	2	6	53030	53035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013717	ACA	2	6	53053	53058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013717	TGC	2	6	53068	53073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013717	ACA	2	6	53096	53101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013717	CAG	2	6	53197	53202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013717	TCA	2	6	53256	53261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013717	CAG	3	9	53335	53343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013717	ACC	2	6	53344	53349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_013717	ATA	2	6	53417	53422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.