MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	CT	3	6	1130	1135	0 %	50 %	0 %	50 %	283777749
2	NC_013717	GC	3	6	1450	1455	0 %	0 %	50 %	50 %	283777749
3	NC_013717	CT	3	6	2348	2353	0 %	50 %	0 %	50 %	283777750
4	NC_013717	TA	3	6	2539	2544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013717	TG	3	6	2756	2761	0 %	50 %	50 %	0 %	283777751
6	NC_013717	GT	3	6	3285	3290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013717	TA	3	6	5193	5198	50 %	50 %	0 %	0 %	283777755
8	NC_013717	GT	3	6	5302	5307	0 %	50 %	50 %	0 %	283777756
9	NC_013717	TG	3	6	6379	6384	0 %	50 %	50 %	0 %	283777758
10	NC_013717	CA	3	6	6391	6396	50 %	0 %	0 %	50 %	283777758
11	NC_013717	CA	3	6	6853	6858	50 %	0 %	0 %	50 %	283777758
12	NC_013717	TC	3	6	7538	7543	0 %	50 %	0 %	50 %	283777759
13	NC_013717	GA	3	6	9177	9182	50 %	0 %	50 %	0 %	283777759
14	NC_013717	GT	3	6	11928	11933	0 %	50 %	50 %	0 %	283777760
15	NC_013717	AG	3	6	11974	11979	50 %	0 %	50 %	0 %	283777760
16	NC_013717	AT	3	6	12023	12028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013717	AT	3	6	12213	12218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013717	GT	3	6	12342	12347	0 %	50 %	50 %	0 %	283777761
19	NC_013717	TA	3	6	13203	13208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013717	AT	3	6	13353	13358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013717	AT	3	6	13761	13766	50 %	50 %	0 %	0 %	283777762
22	NC_013717	TA	3	6	13961	13966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013717	TG	3	6	13967	13972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013717	CT	3	6	16563	16568	0 %	50 %	0 %	50 %	283777764
25	NC_013717	AT	3	6	17846	17851	50 %	50 %	0 %	0 %	283777766
26	NC_013717	GT	3	6	18153	18158	0 %	50 %	50 %	0 %	283777766
27	NC_013717	TA	3	6	18231	18236	50 %	50 %	0 %	0 %	283777766
28	NC_013717	AT	3	6	18623	18628	50 %	50 %	0 %	0 %	283777767
29	NC_013717	AT	3	6	18756	18761	50 %	50 %	0 %	0 %	283777767
30	NC_013717	TA	3	6	19127	19132	50 %	50 %	0 %	0 %	283777768
31	NC_013717	AT	3	6	19179	19184	50 %	50 %	0 %	0 %	283777768
32	NC_013717	AG	3	6	20470	20475	50 %	0 %	50 %	0 %	283777769
33	NC_013717	AT	3	6	20528	20533	50 %	50 %	0 %	0 %	283777769
34	NC_013717	TC	3	6	21011	21016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013717	GA	3	6	21113	21118	50 %	0 %	50 %	0 %	283777770
36	NC_013717	CT	3	6	21569	21574	0 %	50 %	0 %	50 %	283777770
37	NC_013717	AT	3	6	22854	22859	50 %	50 %	0 %	0 %	283777771
38	NC_013717	AG	3	6	24017	24022	50 %	0 %	50 %	0 %	283777771
39	NC_013717	TG	3	6	24619	24624	0 %	50 %	50 %	0 %	283777771
40	NC_013717	CG	3	6	26179	26184	0 %	0 %	50 %	50 %	283777771
41	NC_013717	AT	3	6	26240	26245	50 %	50 %	0 %	0 %	283777771
42	NC_013717	AT	3	6	26350	26355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013717	CT	3	6	27657	27662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013717	GT	3	6	28010	28015	0 %	50 %	50 %	0 %	283777773
45	NC_013717	GA	3	6	29021	29026	50 %	0 %	50 %	0 %	283777773
46	NC_013717	CA	3	6	29240	29245	50 %	0 %	0 %	50 %	283777773
47	NC_013717	AC	3	6	30548	30553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013717	TA	3	6	30562	30567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013717	AT	3	6	30574	30579	50 %	50 %	0 %	0 %	283777774
50	NC_013717	AT	4	8	31079	31086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013717	GA	3	6	31117	31122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013717	AG	3	6	31492	31497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013717	AT	3	6	31835	31840	50 %	50 %	0 %	0 %	283777775
54	NC_013717	TA	3	6	33087	33092	50 %	50 %	0 %	0 %	283777776
55	NC_013717	CT	3	6	33570	33575	0 %	50 %	0 %	50 %	283777777
56	NC_013717	AT	3	6	34243	34248	50 %	50 %	0 %	0 %	283777779
57	NC_013717	CG	3	6	34349	34354	0 %	0 %	50 %	50 %	283777779
58	NC_013717	TA	3	6	34562	34567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013717	AT	3	6	34904	34909	50 %	50 %	0 %	0 %	283777780
60	NC_013717	AG	4	8	35084	35091	50 %	0 %	50 %	0 %	283777781
61	NC_013717	TG	3	6	36465	36470	0 %	50 %	50 %	0 %	283777783
62	NC_013717	AT	3	6	37153	37158	50 %	50 %	0 %	0 %	283777784
63	NC_013717	AG	3	6	38316	38321	50 %	0 %	50 %	0 %	283777784
64	NC_013717	GC	3	6	38890	38895	0 %	0 %	50 %	50 %	283777784
65	NC_013717	TA	3	6	41223	41228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013717	AC	3	6	41380	41385	50 %	0 %	0 %	50 %	283777786
67	NC_013717	TA	3	6	41496	41501	50 %	50 %	0 %	0 %	283777786
68	NC_013717	GA	3	6	41928	41933	50 %	0 %	50 %	0 %	283777787
69	NC_013717	AT	3	6	42504	42509	50 %	50 %	0 %	0 %	283777787
70	NC_013717	AT	3	6	42765	42770	50 %	50 %	0 %	0 %	283777787
71	NC_013717	TC	3	6	42926	42931	0 %	50 %	0 %	50 %	283777787
72	NC_013717	TA	3	6	43426	43431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013717	TA	3	6	43862	43867	50 %	50 %	0 %	0 %	283777788
74	NC_013717	GT	4	8	45239	45246	0 %	50 %	50 %	0 %	283777790
75	NC_013717	GA	3	6	45628	45633	50 %	0 %	50 %	0 %	283777791
76	NC_013717	AG	3	6	47367	47372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013717	CT	3	6	47375	47380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013717	GA	3	6	47670	47675	50 %	0 %	50 %	0 %	283777794
79	NC_013717	AC	4	8	47702	47709	50 %	0 %	0 %	50 %	283777794
80	NC_013717	CT	3	6	47914	47919	0 %	50 %	0 %	50 %	283777794
81	NC_013717	CT	3	6	48541	48546	0 %	50 %	0 %	50 %	283777795
82	NC_013717	AT	3	6	48608	48613	50 %	50 %	0 %	0 %	283777795
83	NC_013717	AG	3	6	48627	48632	50 %	0 %	50 %	0 %	283777795
84	NC_013717	GA	4	8	48639	48646	50 %	0 %	50 %	0 %	283777795
85	NC_013717	GT	3	6	48828	48833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013717	AT	3	6	48874	48879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013717	CT	3	6	49639	49644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013717	TC	3	6	51414	51419	0 %	50 %	0 %	50 %	283777797
89	NC_013717	GA	3	6	52009	52014	50 %	0 %	50 %	0 %	283777798
90	NC_013717	CA	3	6	52323	52328	50 %	0 %	0 %	50 %	283777799
91	NC_013717	AT	3	6	53408	53413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013717	TG	3	6	54280	54285	0 %	50 %	50 %	0 %	283777801

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.