MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	A	6	6	184	189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013717	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013717	A	6	6	1743	1748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013717	A	6	6	2709	2714	100 %	0 %	0 %	0 %	283777751
5	NC_013717	T	7	7	3290	3296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013717	G	6	6	3935	3940	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013717	T	6	6	3997	4002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013717	A	6	6	4588	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	283777754
9	NC_013717	G	7	7	4893	4899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013717	T	6	6	5045	5050	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
11	NC_013717	T	9	9	5108	5116	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
12	NC_013717	T	7	7	5177	5183	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
13	NC_013717	A	6	6	5198	5203	100 %	0 %	0 %	0 %	283777755
14	NC_013717	A	8	8	5214	5221	100 %	0 %	0 %	0 %	283777756
15	NC_013717	A	6	6	5245	5250	100 %	0 %	0 %	0 %	283777756
16	NC_013717	T	7	7	5275	5281	0 %	100 %	0 %	0 %	283777756
17	NC_013717	T	6	6	5632	5637	0 %	100 %	0 %	0 %	283777757
18	NC_013717	T	6	6	5747	5752	0 %	100 %	0 %	0 %	283777758
19	NC_013717	G	7	7	7918	7924	0 %	0 %	100 %	0 %	283777759
20	NC_013717	A	7	7	11834	11840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013717	T	6	6	12119	12124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013717	A	6	6	12130	12135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013717	G	6	6	12148	12153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013717	G	7	7	12366	12372	0 %	0 %	100 %	0 %	283777761
25	NC_013717	T	6	6	12498	12503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013717	A	8	8	12579	12586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013717	A	6	6	12619	12624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013717	A	7	7	13375	13381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013717	T	6	6	13436	13441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013717	T	6	6	13448	13453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013717	T	7	7	14128	14134	0 %	100 %	0 %	0 %	283777763
32	NC_013717	A	6	6	14829	14834	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
33	NC_013717	A	7	7	14871	14877	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
34	NC_013717	A	7	7	14964	14970	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
35	NC_013717	A	8	8	14987	14994	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
36	NC_013717	A	8	8	17157	17164	100 %	0 %	0 %	0 %	283777765
37	NC_013717	G	6	6	17205	17210	0 %	0 %	100 %	0 %	283777765
38	NC_013717	T	7	7	17270	17276	0 %	100 %	0 %	0 %	283777765
39	NC_013717	G	7	7	17707	17713	0 %	0 %	100 %	0 %	283777765
40	NC_013717	A	6	6	17902	17907	100 %	0 %	0 %	0 %	283777766
41	NC_013717	T	6	6	18655	18660	0 %	100 %	0 %	0 %	283777767
42	NC_013717	T	6	6	19055	19060	0 %	100 %	0 %	0 %	283777768
43	NC_013717	T	7	7	19078	19084	0 %	100 %	0 %	0 %	283777768
44	NC_013717	A	7	7	19135	19141	100 %	0 %	0 %	0 %	283777768
45	NC_013717	G	8	8	19405	19412	0 %	0 %	100 %	0 %	283777768
46	NC_013717	G	6	6	19521	19526	0 %	0 %	100 %	0 %	283777768
47	NC_013717	T	6	6	20137	20142	0 %	100 %	0 %	0 %	283777769
48	NC_013717	A	9	9	20751	20759	100 %	0 %	0 %	0 %	283777769
49	NC_013717	C	7	7	20792	20798	0 %	0 %	0 %	100 %	283777769
50	NC_013717	A	6	6	21298	21303	100 %	0 %	0 %	0 %	283777770
51	NC_013717	T	8	8	21442	21449	0 %	100 %	0 %	0 %	283777770
52	NC_013717	C	6	6	22917	22922	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
53	NC_013717	T	6	6	23021	23026	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
54	NC_013717	T	7	7	24663	24669	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
55	NC_013717	T	6	6	24755	24760	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
56	NC_013717	C	8	8	24845	24852	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
57	NC_013717	C	6	6	25163	25168	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
58	NC_013717	T	6	6	25463	25468	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
59	NC_013717	T	6	6	25992	25997	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
60	NC_013717	G	6	6	27734	27739	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013717	A	6	6	28304	28309	100 %	0 %	0 %	0 %	283777773
62	NC_013717	C	6	6	28442	28447	0 %	0 %	0 %	100 %	283777773
63	NC_013717	T	6	6	29372	29377	0 %	100 %	0 %	0 %	283777773
64	NC_013717	G	7	7	29612	29618	0 %	0 %	100 %	0 %	283777773
65	NC_013717	T	7	7	31060	31066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013717	A	6	6	32055	32060	100 %	0 %	0 %	0 %	283777775
67	NC_013717	A	7	7	32130	32136	100 %	0 %	0 %	0 %	283777775
68	NC_013717	T	8	8	32982	32989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013717	A	8	8	32991	32998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013717	T	7	7	33009	33015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013717	A	6	6	33345	33350	100 %	0 %	0 %	0 %	283777776
72	NC_013717	T	6	6	33386	33391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013717	T	7	7	33492	33498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013717	A	6	6	34314	34319	100 %	0 %	0 %	0 %	283777779
75	NC_013717	A	6	6	34496	34501	100 %	0 %	0 %	0 %	283777779
76	NC_013717	T	7	7	34645	34651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013717	G	6	6	35405	35410	0 %	0 %	100 %	0 %	283777782
78	NC_013717	G	6	6	35936	35941	0 %	0 %	100 %	0 %	283777783
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82	NC_013717	T	6	6	40309	40314	0 %	100 %	0 %	0 %	283777784
83	NC_013717	T	8	8	40643	40650	0 %	100 %	0 %	0 %	283777784
84	NC_013717	A	6	6	40764	40769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013717	T	6	6	40848	40853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013717	T	6	6	40970	40975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013717	T	6	6	41685	41690	0 %	100 %	0 %	0 %	283777786
88	NC_013717	A	6	6	41960	41965	100 %	0 %	0 %	0 %	283777787
89	NC_013717	T	6	6	42450	42455	0 %	100 %	0 %	0 %	283777787
90	NC_013717	T	6	6	42533	42538	0 %	100 %	0 %	0 %	283777787
91	NC_013717	T	6	6	42794	42799	0 %	100 %	0 %	0 %	283777787
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93	NC_013717	A	6	6	43359	43364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013717	A	7	7	43501	43507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013717	A	6	6	44262	44267	100 %	0 %	0 %	0 %	283777789
96	NC_013717	G	6	6	44356	44361	0 %	0 %	100 %	0 %	283777789
97	NC_013717	G	6	6	45533	45538	0 %	0 %	100 %	0 %	283777790
98	NC_013717	A	7	7	45560	45566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_013717	T	6	6	46443	46448	0 %	100 %	0 %	0 %	283777792
101	NC_013717	T	6	6	46504	46509	0 %	100 %	0 %	0 %	283777792
102	NC_013717	T	6	6	47402	47407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013717	A	6	6	48326	48331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013717	A	9	9	48339	48347	100 %	0 %	0 %	0 %	283777795
105	NC_013717	A	7	7	48471	48477	100 %	0 %	0 %	0 %	283777795
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107	NC_013717	T	6	6	49286	49291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013717	T	6	6	49958	49963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013717	T	6	6	52228	52233	0 %	100 %	0 %	0 %	283777799
110	NC_013717	T	7	7	52401	52407	0 %	100 %	0 %	0 %	283777799
111	NC_013717	C	6	6	53136	53141	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_013717	A	6	6	53275	53280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013717	T	6	6	54301	54306	0 %	100 %	0 %	0 %	283777801

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.