MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013716	GCGCT	2	10	5016	5025	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013716	ATAAA	2	10	17708	17717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013716	AGCGC	2	10	31654	31663	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013716	AGCGC	2	10	31739	31748	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013716	AGCGC	2	10	31912	31921	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013716	AGCGC	2	10	31997	32006	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013716	AGCGC	2	10	32082	32091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013716	TTTTA	2	10	41147	41156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013716	AAATT	2	10	41192	41201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013716	CGTTC	2	10	41346	41355	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013716	AGCGC	2	10	46740	46749	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013716	AGCGC	2	10	50480	50489	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013716	AAAAT	2	10	53261	53270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013716	AAGCG	2	10	58377	58386	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013716	AATAT	2	10	80799	80808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013716	AAGCG	2	10	82267	82276	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013716	AAGCG	2	10	87658	87667	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013716	AAGCG	2	10	87744	87753	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013716	CAGAG	2	10	99607	99616	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013716	CGCTT	2	10	126870	126879	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013716	GCGCT	2	10	136051	136060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013716	AAGCG	2	10	147514	147523	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013716	AGCGC	2	10	157998	158007	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013716	AAGCG	2	10	163310	163319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013716	GTAAG	2	10	167302	167311	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013716	TTGTC	2	10	169623	169632	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013716	AGCGC	2	10	189538	189547	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013716	GTTCA	2	10	205068	205077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013716	GTCTG	2	10	208150	208159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013716	GTCTG	2	10	225425	225434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013716	GCGGG	2	10	229138	229147	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013716	CATAA	2	10	236011	236020	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013716	TTTAA	2	10	238326	238335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013716	AGCGA	2	10	251229	251238	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013716	AGTCG	2	10	251256	251265	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013716	ATCTT	2	10	253590	253599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013716	TTTAG	2	10	257633	257642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013716	AGCGC	2	10	271803	271812	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013716	CCTTT	2	10	274694	274703	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013716	TGGTG	2	10	311685	311694	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013716	GAATC	2	10	319048	319057	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013716	AATTA	2	10	320613	320622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013716	CGGCC	2	10	328995	329004	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_013716	CGCAG	2	10	330526	330535	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013716	AAAGG	2	10	332567	332576	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013716	TTAAC	2	10	347353	347362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013716	CGGGG	2	10	363985	363994	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013716	TAAAT	2	10	365294	365303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013716	TGGGC	2	10	367762	367771	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013716	GTGAT	2	10	368498	368507	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013716	ATATG	2	10	369968	369977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013716	TTGAA	2	10	372557	372566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013716	AATGC	2	10	373725	373734	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013716	CCCCG	2	10	378346	378355	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
55	NC_013716	TAAAT	2	10	403544	403553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013716	TAAAA	2	10	404205	404214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013716	CAAAA	2	10	409890	409899	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013716	GCATG	2	10	412583	412592	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013716	TCTGG	2	10	427297	427306	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013716	GCGCT	2	10	430539	430548	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013716	AGCGC	2	10	430632	430641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013716	AGCGC	2	10	430680	430689	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013716	AGCGC	2	10	430728	430737	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_013716	AGCGC	2	10	430826	430835	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013716	GCTAT	2	10	431118	431127	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013716	CGCTT	2	10	431265	431274	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013716	CGTGG	2	10	433774	433783	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013716	TAAAA	2	10	436829	436838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013716	AGTTA	2	10	436899	436908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013716	ATAAA	2	10	436937	436946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013716	AGTGA	2	10	449213	449222	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013716	ACAAG	2	10	461163	461172	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013716	AACAG	2	10	464616	464625	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013716	CAAAA	2	10	465865	465874	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013716	CAGCA	2	10	471029	471038	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_013716	AGCGC	2	10	474316	474325	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013716	CTTTC	2	10	477899	477908	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013716	ACTCT	2	10	486335	486344	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013716	GCCTG	2	10	495282	495291	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013716	AACGC	2	10	506599	506608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_013716	AGCGC	2	10	506748	506757	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_013716	AGCGC	2	10	506831	506840	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013716	AGCGC	2	10	506914	506923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013716	TTTTC	2	10	513136	513145	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013716	GCTTA	2	10	521484	521493	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013716	GCGCT	2	10	526228	526237	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013716	GCAAC	2	10	527867	527876	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_013716	AAATA	2	10	542830	542839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013716	AAATA	2	10	542877	542886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013716	GTTTT	2	10	545806	545815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013716	TTTTC	2	10	564612	564621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013716	CAGGT	2	10	570168	570177	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013716	CCCGT	2	10	583320	583329	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_013716	AGCGC	2	10	592361	592370	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013716	AGCGC	2	10	592451	592460	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013716	CAGGC	2	10	593388	593397	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013716	GCGCT	2	10	601896	601905	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013716	GCGCT	2	10	601987	601996	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013716	AGCGC	2	10	609753	609762	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_013716	GAAAG	2	10	624998	625007	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013716	GCTCC	2	10	625070	625079	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_013716	TTAAT	2	10	626404	626413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013716	GCGCG	2	10	635006	635015	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_013716	CGGGG	2	10	637375	637384	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013716	TGTTC	2	10	645604	645613	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013716	GCGCG	2	10	646455	646464	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013716	GGAAG	2	10	647132	647141	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013716	ACCGC	2	10	648431	648440	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_013716	CAATG	2	10	671854	671863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013716	ATAAG	2	10	676289	676298	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013716	TTGAT	2	10	678546	678555	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013716	CAGAC	2	10	706796	706805	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013716	GGGAA	2	10	710148	710157	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013716	CGTAA	2	10	710494	710503	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013716	GCATA	2	10	723864	723873	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013716	AATTT	2	10	736721	736730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013716	CAGAC	2	10	748762	748771	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_013716	GCGAA	2	10	750621	750630	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013716	TTTAA	2	10	750669	750678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013716	TCGCG	2	10	750855	750864	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013716	AGTAA	2	10	758824	758833	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013716	TCAGA	2	10	760325	760334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013716	GTGAA	2	10	762568	762577	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013716	CCTTT	2	10	767846	767855	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_013716	GCGCT	2	10	794472	794481	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_013716	GTCGT	2	10	810915	810924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013716	GGCGA	2	10	811183	811192	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013716	GGCGA	2	10	811399	811408	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013716	GCACT	2	10	833665	833674	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_013716	CGGGA	2	10	838353	838362	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013716	AAGCG	2	10	866806	866815	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013716	GCAAT	2	10	866823	866832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013716	GCAAC	2	10	877012	877021	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013716	TATAT	2	10	902009	902018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013716	CGGGA	2	10	904857	904866	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013716	TGAGC	2	10	937736	937745	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013716	TAAAA	2	10	941203	941212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013716	CAGAC	2	10	994025	994034	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013716	GGCGT	2	10	1028807	1028816	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013716	GGCGT	2	10	1029119	1029128	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013716	GTGAT	2	10	1033906	1033915	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013716	GCAAT	2	10	1035560	1035569	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013716	TTGTT	2	10	1035654	1035663	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013716	GCGCT	2	10	1036207	1036216	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_013716	AAACG	2	10	1056568	1056577	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_013716	AAAAT	2	10	1058009	1058018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_013716	CAACG	2	10	1865185	1865194	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_013716	GACGG	2	10	1879032	1879041	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_013716	GCGCT	2	10	2037605	2037614	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_013716	GCCCG	2	10	2044997	2045006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
287	NC_013716	AATCA	2	10	2067160	2067169	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_013716	TGATT	2	10	2067260	2067269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013716	TTAAA	2	10	2074877	2074886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013716	ATTTA	2	10	2080363	2080372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_013716	TTTAC	2	10	2135385	2135394	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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294	NC_013716	TAAAA	2	10	2145443	2145452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_013716	GTTCT	2	10	2150061	2150070	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
296	NC_013716	TTTAA	2	10	2151843	2151852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_013716	TACAC	2	10	2160462	2160471	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
298	NC_013716	CGTAC	2	10	2177068	2177077	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
299	NC_013716	TATTC	2	10	2178284	2178293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_013716	CAATA	2	10	2180099	2180108	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_013716	ACTGC	2	10	2222216	2222225	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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319	NC_013716	GCGCT	2	10	2348101	2348110	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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403	NC_013716	GCGCT	2	10	2867663	2867672	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
404	NC_013716	ATTTT	2	10	2871676	2871685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_013716	TTGTA	2	10	2906158	2906167	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_013716	ACCCG	2	10	2917277	2917286	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
410	NC_013716	TTCAC	2	10	2921016	2921025	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
411	NC_013716	CCAGC	2	10	2924043	2924052	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
412	NC_013716	CCGCC	2	10	2952016	2952025	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
413	NC_013716	ACTTT	2	10	2953963	2953972	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
414	NC_013716	GCCTG	2	10	2976968	2976977	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
415	NC_013716	CATGC	2	10	2977058	2977067	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
416	NC_013716	CATGC	2	10	2977172	2977181	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
417	NC_013716	CATGC	2	10	2977286	2977295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
418	NC_013716	CATGC	2	10	2977400	2977409	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
419	NC_013716	CATGC	2	10	2977514	2977523	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
420	NC_013716	AAGCG	2	10	2980622	2980631	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
421	NC_013716	ATTAA	2	10	2980710	2980719	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_013716	GCCCG	2	10	2983220	2983229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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424	NC_013716	CAGAC	2	10	2990228	2990237	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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467	NC_013716	CTTTT	2	10	3287126	3287135	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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476	NC_013716	GTTCT	2	10	3339328	3339337	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_013716	ACGCC	2	10	3502438	3502447	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

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