MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 10432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013716	GCA	3	9	39	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013716	TAA	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013716	ACA	2	6	157	162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013716	AAC	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013716	GCC	2	6	5069	5074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013716	ATG	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013716	GCC	2	6	5124	5129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013716	TTG	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013716	CGT	2	6	7624	7629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013716	ATC	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013716	AAT	2	6	8751	8756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013716	GCG	2	6	9368	9373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013716	ATT	2	6	9392	9397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013716	AAG	2	6	10800	10805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013716	ATC	2	6	11388	11393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013716	GTT	2	6	11430	11435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013716	ATA	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013716	TCA	2	6	11485	11490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013716	ATG	2	6	11497	11502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013716	TGA	2	6	11584	11589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013716	TAG	2	6	11609	11614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013716	TGA	2	6	11625	11630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013716	ATG	2	6	11699	11704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013716	ACA	2	6	13728	13733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013716	TGA	2	6	14964	14969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013716	TTG	2	6	15101	15106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013716	AAT	3	9	15107	15115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013716	CTT	2	6	15145	15150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013716	TAA	2	6	16120	16125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013716	AAT	2	6	16618	16623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013716	ATA	2	6	17209	17214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013716	TGA	2	6	17654	17659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013716	ATT	2	6	17832	17837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013716	ATC	2	6	17914	17919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013716	ATT	2	6	17966	17971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013716	CAG	2	6	20121	20126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013716	TTA	2	6	20187	20192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013716	TTG	2	6	20278	20283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013716	TCA	2	6	20617	20622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013716	AAT	2	6	20625	20630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013716	TCC	2	6	24906	24911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013716	TAT	2	6	26326	26331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013716	TGA	2	6	26392	26397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013716	TAG	2	6	26423	26428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013716	TGA	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013716	CTT	2	6	27069	27074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013716	GGC	2	6	31688	31693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013716	GGC	2	6	31773	31778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013716	GTG	2	6	31849	31854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013716	GGC	2	6	31946	31951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013716	GGC	2	6	32031	32036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013716	TGT	2	6	33632	33637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013716	CTG	2	6	33723	33728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013716	GCT	2	6	33732	33737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013716	CCG	2	6	33747	33752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013716	TAT	2	6	34584	34589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013716	GAA	2	6	34594	34599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013716	GCA	2	6	39095	39100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013716	GGA	2	6	39102	39107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013716	CAT	2	6	40120	40125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013716	GGC	2	6	40186	40191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013716	GCC	2	6	41423	41428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013716	ATT	2	6	45928	45933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013716	CGC	2	6	46002	46007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013716	GGC	2	6	46576	46581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013716	TCA	2	6	46650	46655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013716	GGC	2	6	46675	46680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013716	GGC	2	6	46774	46779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013716	CCG	2	6	47607	47612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013716	GGC	2	6	50510	50515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013716	TAT	2	6	53306	53311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013716	AGT	2	6	53537	53542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013716	ACA	2	6	57060	57065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013716	CCA	2	6	57184	57189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013716	CGG	2	6	58252	58257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013716	TTA	2	6	58284	58289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013716	ATA	2	6	58360	58365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013716	TAA	2	6	63070	63075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013716	TAT	2	6	63104	63109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013716	TAT	2	6	63197	63202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013716	GTT	2	6	63236	63241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013716	CAT	2	6	73263	73268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013716	GTG	2	6	73353	73358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013716	ACT	2	6	78035	78040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013716	GCT	2	6	78054	78059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013716	CGC	2	6	78068	78073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013716	GCC	2	6	78080	78085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013716	ATT	2	6	78089	78094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013716	GCC	2	6	78112	78117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013716	GCA	2	6	78129	78134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013716	CGG	2	6	78182	78187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013716	TAA	2	6	80641	80646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013716	ATA	2	6	80829	80834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013716	CCG	2	6	82082	82087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013716	GTT	2	6	82120	82125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013716	CCG	2	6	82176	82181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013716	GTT	2	6	82214	82219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013716	AGT	2	6	85556	85561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013716	GTT	2	6	85670	85675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013716	CGG	2	6	85772	85777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013716	TGA	2	6	85847	85852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013716	CAG	2	6	86783	86788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013716	GGC	2	6	87602	87607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013716	GGC	2	6	87688	87693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013716	AGC	2	6	91008	91013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013716	TTA	2	6	91166	91171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013716	TTG	2	6	91206	91211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013716	AGC	2	6	91215	91220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013716	TAT	2	6	92913	92918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013716	AAT	2	6	92933	92938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013716	GAA	2	6	93062	93067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013716	CAT	2	6	93110	93115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013716	CAG	2	6	93161	93166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013716	TAT	2	6	93168	93173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013716	CTG	2	6	93174	93179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013716	GCG	2	6	99250	99255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013716	GTC	2	6	99275	99280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013716	TCA	2	6	99551	99556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013716	ATT	2	6	99669	99674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013716	TAT	2	6	99760	99765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013716	ATT	2	6	99971	99976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013716	TGA	2	6	101091	101096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013716	GAT	2	6	101123	101128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013716	TAA	2	6	101267	101272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013716	CAA	2	6	103674	103679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013716	GCA	2	6	104862	104867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013716	ATT	2	6	104876	104881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013716	CGT	2	6	104933	104938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013716	CGG	2	6	104961	104966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013716	CGG	2	6	105037	105042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013716	TCA	2	6	105155	105160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013716	TTG	2	6	105241	105246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013716	TCC	2	6	105331	105336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013716	AGG	2	6	105382	105387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013716	AGT	2	6	116506	116511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013716	AAC	2	6	121103	121108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013716	CCG	2	6	122320	122325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013716	TTC	2	6	123367	123372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013716	TTC	2	6	123398	123403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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