MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 1240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013715	TTCGG	2	10	1120	1129	0 %	40 %	40 %	20 %	283457090
2	NC_013715	GCGTG	2	10	4544	4553	0 %	20 %	60 %	20 %	283457092
3	NC_013715	CGTAC	2	10	8967	8976	20 %	20 %	20 %	40 %	283457095
4	NC_013715	TACGA	2	10	10157	10166	40 %	20 %	20 %	20 %	283457095
5	NC_013715	AGCTG	2	10	15656	15665	20 %	20 %	40 %	20 %	283457100
6	NC_013715	AGAGA	2	10	16916	16925	60 %	0 %	40 %	0 %	283457101
7	NC_013715	TGGTG	2	10	19381	19390	0 %	40 %	60 %	0 %	283457105
8	NC_013715	CACGC	2	10	22666	22675	20 %	0 %	20 %	60 %	283457110
9	NC_013715	GACGC	2	10	25295	25304	20 %	0 %	40 %	40 %	283457112
10	NC_013715	GCTCG	2	10	26481	26490	0 %	20 %	40 %	40 %	283457113
11	NC_013715	GACCC	2	10	28043	28052	20 %	0 %	20 %	60 %	283457114
12	NC_013715	CGGTG	2	10	28464	28473	0 %	20 %	60 %	20 %	283457115
13	NC_013715	CACGG	2	10	30319	30328	20 %	0 %	40 %	40 %	283457117
14	NC_013715	AGGCC	2	10	30670	30679	20 %	0 %	40 %	40 %	283457118
15	NC_013715	ACCTG	2	10	31964	31973	20 %	20 %	20 %	40 %	283457119
16	NC_013715	TTTGG	2	10	41409	41418	0 %	60 %	40 %	0 %	283457126
17	NC_013715	TGGTT	2	10	42081	42090	0 %	60 %	40 %	0 %	283457127
18	NC_013715	TCGCC	2	10	42246	42255	0 %	20 %	20 %	60 %	283457128
19	NC_013715	TTGAG	2	10	43297	43306	20 %	40 %	40 %	0 %	283457129
20	NC_013715	CTGAC	2	10	44567	44576	20 %	20 %	20 %	40 %	283457130
21	NC_013715	TGGGC	2	10	48195	48204	0 %	20 %	60 %	20 %	283457133
22	NC_013715	GATGA	2	10	49742	49751	40 %	20 %	40 %	0 %	283457133
23	NC_013715	GCTGT	2	10	51521	51530	0 %	40 %	40 %	20 %	283457136
24	NC_013715	CTTCT	2	10	52537	52546	0 %	60 %	0 %	40 %	283457138
25	NC_013715	CGGTG	2	10	54864	54873	0 %	20 %	60 %	20 %	283457139
26	NC_013715	GCCCC	2	10	58845	58854	0 %	0 %	20 %	80 %	283457141
27	NC_013715	GCTCC	2	10	59490	59499	0 %	20 %	20 %	60 %	283457141
28	NC_013715	ACCCG	2	10	61241	61250	20 %	0 %	20 %	60 %	283457141
29	NC_013715	TGGCT	2	10	62337	62346	0 %	40 %	40 %	20 %	283457142
30	NC_013715	GCCCG	2	10	65073	65082	0 %	0 %	40 %	60 %	283457145
31	NC_013715	TCAGC	2	10	67394	67403	20 %	20 %	20 %	40 %	283457146
32	NC_013715	CCACC	2	10	68033	68042	20 %	0 %	0 %	80 %	283457148
33	NC_013715	GCACC	2	10	68949	68958	20 %	0 %	20 %	60 %	283457149
34	NC_013715	TGCGG	2	10	78716	78725	0 %	20 %	60 %	20 %	283457158
35	NC_013715	CGGTG	2	10	84214	84223	0 %	20 %	60 %	20 %	283457163
36	NC_013715	TGCAC	2	10	86385	86394	20 %	20 %	20 %	40 %	283457165
37	NC_013715	TCACC	2	10	87610	87619	20 %	20 %	0 %	60 %	283457167
38	NC_013715	CGAAG	2	10	89649	89658	40 %	0 %	40 %	20 %	283457169
39	NC_013715	AAACC	2	10	93233	93242	60 %	0 %	0 %	40 %	283457171
40	NC_013715	CGCCC	2	10	93775	93784	0 %	0 %	20 %	80 %	283457171
41	NC_013715	GGAGC	2	10	94289	94298	20 %	0 %	60 %	20 %	283457172
42	NC_013715	TGCGC	2	10	94378	94387	0 %	20 %	40 %	40 %	283457172
43	NC_013715	TTCTT	2	10	96585	96594	0 %	80 %	0 %	20 %	283457174
44	NC_013715	ATTCG	2	10	96848	96857	20 %	40 %	20 %	20 %	283457174
45	NC_013715	GCGCC	2	10	98345	98354	0 %	0 %	40 %	60 %	283457176
46	NC_013715	GCGGG	2	10	101100	101109	0 %	0 %	80 %	20 %	283457179
47	NC_013715	GCGCA	2	10	102229	102238	20 %	0 %	40 %	40 %	283457179
48	NC_013715	GGTGC	2	10	102256	102265	0 %	20 %	60 %	20 %	283457179
49	NC_013715	GCGCG	2	10	102495	102504	0 %	0 %	60 %	40 %	283457179
50	NC_013715	CGGCG	2	10	102511	102520	0 %	0 %	60 %	40 %	283457179
51	NC_013715	TCGCG	2	10	103533	103542	0 %	20 %	40 %	40 %	283457180
52	NC_013715	GGTCG	2	10	103989	103998	0 %	20 %	60 %	20 %	283457182
53	NC_013715	TGATC	2	10	107499	107508	20 %	40 %	20 %	20 %	283457185
54	NC_013715	TCTGC	2	10	109152	109161	0 %	40 %	20 %	40 %	283457186
55	NC_013715	ACGGT	2	10	118706	118715	20 %	20 %	40 %	20 %	283457195
56	NC_013715	GGTTG	2	10	119008	119017	0 %	40 %	60 %	0 %	283457195
57	NC_013715	TGCTC	2	10	120691	120700	0 %	40 %	20 %	40 %	283457198
58	NC_013715	GACCC	2	10	121208	121217	20 %	0 %	20 %	60 %	283457198
59	NC_013715	CATCC	2	10	127654	127663	20 %	20 %	0 %	60 %	283457207
60	NC_013715	GCGGT	2	10	129142	129151	0 %	20 %	60 %	20 %	283457207
61	NC_013715	AGAAA	2	10	130460	130469	80 %	0 %	20 %	0 %	283457208
62	NC_013715	GCAGA	2	10	130562	130571	40 %	0 %	40 %	20 %	283457208
63	NC_013715	TCCAC	2	10	130878	130887	20 %	20 %	0 %	60 %	283457208
64	NC_013715	GGTTC	2	10	132280	132289	0 %	40 %	40 %	20 %	283457210
65	NC_013715	GCGCT	2	10	132631	132640	0 %	20 %	40 %	40 %	283457210
66	NC_013715	CCGTG	2	10	132879	132888	0 %	20 %	40 %	40 %	283457210
67	NC_013715	TCCTG	2	10	133041	133050	0 %	40 %	20 %	40 %	283457210
68	NC_013715	CCCGA	2	10	133081	133090	20 %	0 %	20 %	60 %	283457210
69	NC_013715	GCTGG	2	10	140599	140608	0 %	20 %	60 %	20 %	283457214
70	NC_013715	GTGCT	2	10	142380	142389	0 %	40 %	40 %	20 %	283457216
71	NC_013715	GATAG	2	10	144640	144649	40 %	20 %	40 %	0 %	283457218
72	NC_013715	GCTCC	2	10	144670	144679	0 %	20 %	20 %	60 %	283457218
73	NC_013715	GGAAG	2	10	145584	145593	40 %	0 %	60 %	0 %	283457219
74	NC_013715	CGGGT	2	10	146928	146937	0 %	20 %	60 %	20 %	283457221
75	NC_013715	CAGTG	2	10	148090	148099	20 %	20 %	40 %	20 %	283457222
76	NC_013715	AAGAA	2	10	150347	150356	80 %	0 %	20 %	0 %	283457224
77	NC_013715	ACACC	2	10	151623	151632	40 %	0 %	0 %	60 %	283457226
78	NC_013715	CGCAC	2	10	152111	152120	20 %	0 %	20 %	60 %	283457226
79	NC_013715	GCGAG	2	10	152238	152247	20 %	0 %	60 %	20 %	283457226
80	NC_013715	AAGGT	2	10	154274	154283	40 %	20 %	40 %	0 %	283457226
81	NC_013715	GTCGG	2	10	154712	154721	0 %	20 %	60 %	20 %	283457227
82	NC_013715	CGACC	2	10	157725	157734	20 %	0 %	20 %	60 %	283457230
83	NC_013715	CCGAC	2	10	160232	160241	20 %	0 %	20 %	60 %	283457233
84	NC_013715	CCGAC	2	10	161347	161356	20 %	0 %	20 %	60 %	283457233
85	NC_013715	AATGA	2	10	164426	164435	60 %	20 %	20 %	0 %	283457237
86	NC_013715	GTACC	2	10	165638	165647	20 %	20 %	20 %	40 %	283457240
87	NC_013715	GTTCC	2	10	167247	167256	0 %	40 %	20 %	40 %	283457243
88	NC_013715	GCGCC	2	10	167430	167439	0 %	0 %	40 %	60 %	283457243
89	NC_013715	GCCCG	2	10	169217	169226	0 %	0 %	40 %	60 %	283457244
90	NC_013715	CGCAG	2	10	170534	170543	20 %	0 %	40 %	40 %	283457246
91	NC_013715	ACTCC	2	10	171259	171268	20 %	20 %	0 %	60 %	283457247
92	NC_013715	CGTGA	2	10	177169	177178	20 %	20 %	40 %	20 %	283457250
93	NC_013715	CCGCG	2	10	178146	178155	0 %	0 %	40 %	60 %	283457251
94	NC_013715	CCGTG	2	10	178167	178176	0 %	20 %	40 %	40 %	283457251
95	NC_013715	GCCCA	2	10	181775	181784	20 %	0 %	20 %	60 %	283457255
96	NC_013715	GCGCC	2	10	182689	182698	0 %	0 %	40 %	60 %	283457255
97	NC_013715	AGCTG	2	10	184081	184090	20 %	20 %	40 %	20 %	283457256
98	NC_013715	GCTCG	2	10	185000	185009	0 %	20 %	40 %	40 %	283457257
99	NC_013715	TCTGC	2	10	186322	186331	0 %	40 %	20 %	40 %	283457258
100	NC_013715	AACGC	2	10	186409	186418	40 %	0 %	20 %	40 %	283457258
101	NC_013715	ATCGA	2	10	186657	186666	40 %	20 %	20 %	20 %	283457258
102	NC_013715	CGGCA	2	10	186878	186887	20 %	0 %	40 %	40 %	283457258
103	NC_013715	GGTGC	2	10	191475	191484	0 %	20 %	60 %	20 %	283457263
104	NC_013715	GTTCT	2	10	191715	191724	0 %	60 %	20 %	20 %	283457263
105	NC_013715	CTGGG	2	10	192647	192656	0 %	20 %	60 %	20 %	283457264
106	NC_013715	GGGTT	2	10	193042	193051	0 %	40 %	60 %	0 %	283457265
107	NC_013715	CGCAT	2	10	194126	194135	20 %	20 %	20 %	40 %	283457266
108	NC_013715	TTCTC	2	10	195807	195816	0 %	60 %	0 %	40 %	283457267
109	NC_013715	GAGAC	2	10	196139	196148	40 %	0 %	40 %	20 %	283457267
110	NC_013715	GCGGG	2	10	196742	196751	0 %	0 %	80 %	20 %	283457268
111	NC_013715	GAAGA	2	10	202042	202051	60 %	0 %	40 %	0 %	283457271
112	NC_013715	GCTGA	2	10	204722	204731	20 %	20 %	40 %	20 %	283457273
113	NC_013715	ACGGC	2	10	205230	205239	20 %	0 %	40 %	40 %	283457273
114	NC_013715	GCCGC	2	10	208426	208435	0 %	0 %	40 %	60 %	283457277
115	NC_013715	ACCGC	2	10	215920	215929	20 %	0 %	20 %	60 %	283457283
116	NC_013715	GGCAG	2	10	220521	220530	20 %	0 %	60 %	20 %	283457289
117	NC_013715	CGCAC	2	10	221796	221805	20 %	0 %	20 %	60 %	283457290
118	NC_013715	TGCCC	2	10	222080	222089	0 %	20 %	20 %	60 %	283457290
119	NC_013715	TGCGC	2	10	222849	222858	0 %	20 %	40 %	40 %	283457291
120	NC_013715	CCGCA	2	10	224417	224426	20 %	0 %	20 %	60 %	283457292
121	NC_013715	CCAGA	2	10	225838	225847	40 %	0 %	20 %	40 %	283457293
122	NC_013715	GCCAG	2	10	227076	227085	20 %	0 %	40 %	40 %	283457293
123	NC_013715	GCGCC	2	10	231602	231611	0 %	0 %	40 %	60 %	283457298
124	NC_013715	GCGTG	2	10	232076	232085	0 %	20 %	60 %	20 %	283457298
125	NC_013715	GCGTG	2	10	236060	236069	0 %	20 %	60 %	20 %	283457303
126	NC_013715	GTTCC	2	10	236247	236256	0 %	40 %	20 %	40 %	283457303
127	NC_013715	GTTCA	2	10	239850	239859	20 %	40 %	20 %	20 %	283457306
128	NC_013715	ACGCC	2	10	241505	241514	20 %	0 %	20 %	60 %	283457308
129	NC_013715	CGCGC	2	10	243148	243157	0 %	0 %	40 %	60 %	283457309
130	NC_013715	GTGCG	2	10	244692	244701	0 %	20 %	60 %	20 %	283457310
131	NC_013715	TGCAC	2	10	246174	246183	20 %	20 %	20 %	40 %	283457312
132	NC_013715	TCTGA	2	10	247715	247724	20 %	40 %	20 %	20 %	283457314
133	NC_013715	TGGCT	2	10	249050	249059	0 %	40 %	40 %	20 %	283457314
134	NC_013715	CTGGC	2	10	249105	249114	0 %	20 %	40 %	40 %	283457314
135	NC_013715	CTTCG	2	10	249475	249484	0 %	40 %	20 %	40 %	283457314
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251	NC_013715	TCGGC	2	10	420804	420813	0 %	20 %	40 %	40 %	283457474
252	NC_013715	GCGAA	2	10	425559	425568	40 %	0 %	40 %	20 %	283457476
253	NC_013715	TGACC	2	10	427154	427163	20 %	20 %	20 %	40 %	283457478
254	NC_013715	GCGAG	2	10	430722	430731	20 %	0 %	60 %	20 %	283457482
255	NC_013715	TCGGC	2	10	431964	431973	0 %	20 %	40 %	40 %	283457484
256	NC_013715	AGGCC	2	10	432672	432681	20 %	0 %	40 %	40 %	283457484
257	NC_013715	CGGAA	2	10	433128	433137	40 %	0 %	40 %	20 %	283457484
258	NC_013715	AACGC	2	10	435323	435332	40 %	0 %	20 %	40 %	283457487
259	NC_013715	GCGCA	2	10	435500	435509	20 %	0 %	40 %	40 %	283457487
260	NC_013715	GGTAC	2	10	437200	437209	20 %	20 %	40 %	20 %	283457488
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262	NC_013715	AGGTG	2	10	445246	445255	20 %	20 %	60 %	0 %	283457495
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377	NC_013715	CTGGG	2	10	653402	653411	0 %	20 %	60 %	20 %	283457697
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383	NC_013715	GGGTC	2	10	660758	660767	0 %	20 %	60 %	20 %	283457704
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