MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 5403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013715	CCCT	2	8	457	464	0 %	25 %	0 %	75 %	283457090
2	NC_013715	AAGG	2	8	1989	1996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013715	ACCG	2	8	2079	2086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013715	GGAT	2	8	2370	2377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013715	ACCG	2	8	3001	3008	25 %	0 %	25 %	50 %	283457091
6	NC_013715	GCCG	2	8	3373	3380	0 %	0 %	50 %	50 %	283457091
7	NC_013715	GTTC	2	8	3495	3502	0 %	50 %	25 %	25 %	283457091
8	NC_013715	GCCT	2	8	3790	3797	0 %	25 %	25 %	50 %	283457092
9	NC_013715	CGGG	2	8	3921	3928	0 %	0 %	75 %	25 %	283457092
10	NC_013715	GTGC	2	8	4044	4051	0 %	25 %	50 %	25 %	283457092
11	NC_013715	GACG	2	8	4388	4395	25 %	0 %	50 %	25 %	283457092
12	NC_013715	TCGA	2	8	4455	4462	25 %	25 %	25 %	25 %	283457092
13	NC_013715	CCCG	2	8	5438	5445	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_013715	CGTG	2	8	7137	7144	0 %	25 %	50 %	25 %	283457093
15	NC_013715	CGAG	2	8	8169	8176	25 %	0 %	50 %	25 %	283457094
16	NC_013715	CCTG	2	8	9036	9043	0 %	25 %	25 %	50 %	283457095
17	NC_013715	TCGT	2	8	9354	9361	0 %	50 %	25 %	25 %	283457095
18	NC_013715	TGCT	2	8	10110	10117	0 %	50 %	25 %	25 %	283457095
19	NC_013715	TGGT	2	8	11384	11391	0 %	50 %	50 %	0 %	283457096
20	NC_013715	AAAG	2	8	12336	12343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013715	AAGG	2	8	13777	13784	50 %	0 %	50 %	0 %	283457097
22	NC_013715	GCTG	2	8	13961	13968	0 %	25 %	50 %	25 %	283457098
23	NC_013715	GTGA	2	8	14396	14403	25 %	25 %	50 %	0 %	283457099
24	NC_013715	ACTC	2	8	14814	14821	25 %	25 %	0 %	50 %	283457100
25	NC_013715	TTCT	2	8	15299	15306	0 %	75 %	0 %	25 %	283457100
26	NC_013715	TGAA	2	8	15481	15488	50 %	25 %	25 %	0 %	283457100
27	NC_013715	GAAG	2	8	15500	15507	50 %	0 %	50 %	0 %	283457100
28	NC_013715	TGAT	2	8	15610	15617	25 %	50 %	25 %	0 %	283457100
29	NC_013715	CTAA	2	8	16087	16094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013715	GCGG	2	8	16545	16552	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013715	GCCC	2	8	17077	17084	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_013715	ACTA	2	8	17187	17194	50 %	25 %	0 %	25 %	283457102
33	NC_013715	TCGA	2	8	17658	17665	25 %	25 %	25 %	25 %	283457102
34	NC_013715	GGCG	2	8	18404	18411	0 %	0 %	75 %	25 %	283457103
35	NC_013715	CCGC	2	8	20134	20141	0 %	0 %	25 %	75 %	283457106
36	NC_013715	CAGC	2	8	20222	20229	25 %	0 %	25 %	50 %	283457106
37	NC_013715	GCCA	2	8	20295	20302	25 %	0 %	25 %	50 %	283457106
38	NC_013715	GCAC	2	8	20542	20549	25 %	0 %	25 %	50 %	283457106
39	NC_013715	CAGA	2	8	20663	20670	50 %	0 %	25 %	25 %	283457106
40	NC_013715	ACCT	2	8	21084	21091	25 %	25 %	0 %	50 %	283457107
41	NC_013715	GAGT	2	8	21421	21428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013715	TGAA	2	8	21432	21439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013715	GGGC	2	8	21801	21808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013715	CGTC	2	8	21938	21945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013715	CCAC	2	8	22362	22369	25 %	0 %	0 %	75 %	283457110
46	NC_013715	GAAC	2	8	22595	22602	50 %	0 %	25 %	25 %	283457110
47	NC_013715	ATCA	2	8	22826	22833	50 %	25 %	0 %	25 %	283457110
48	NC_013715	CGCA	2	8	23012	23019	25 %	0 %	25 %	50 %	283457110
49	NC_013715	CCAC	2	8	23139	23146	25 %	0 %	0 %	75 %	283457110
50	NC_013715	ACGC	2	8	23755	23762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013715	ACAT	2	8	23798	23805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013715	AATC	2	8	23877	23884	50 %	25 %	0 %	25 %	283457111
53	NC_013715	CAAA	2	8	24492	24499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013715	TCAC	2	8	24545	24552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013715	CCTC	2	8	25172	25179	0 %	25 %	0 %	75 %	283457112
56	NC_013715	GAAG	2	8	25569	25576	50 %	0 %	50 %	0 %	283457112
57	NC_013715	ACCG	2	8	26060	26067	25 %	0 %	25 %	50 %	283457113
58	NC_013715	CTTC	2	8	26103	26110	0 %	50 %	0 %	50 %	283457113
59	NC_013715	CCCG	2	8	26295	26302	0 %	0 %	25 %	75 %	283457113
60	NC_013715	GGCT	2	8	26521	26528	0 %	25 %	50 %	25 %	283457113
61	NC_013715	CTGG	2	8	26901	26908	0 %	25 %	50 %	25 %	283457113
62	NC_013715	GCAG	2	8	27486	27493	25 %	0 %	50 %	25 %	283457113
63	NC_013715	CGCC	2	8	27626	27633	0 %	0 %	25 %	75 %	283457113
64	NC_013715	ACGT	2	8	27821	27828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013715	CCTC	2	8	27900	27907	0 %	25 %	0 %	75 %	283457114
66	NC_013715	CTGG	2	8	27961	27968	0 %	25 %	50 %	25 %	283457114
67	NC_013715	TAGG	2	8	28391	28398	25 %	25 %	50 %	0 %	283457114
68	NC_013715	TCAA	2	8	28876	28883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013715	GCGA	2	8	28910	28917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013715	GTGC	2	8	29089	29096	0 %	25 %	50 %	25 %	283457116
71	NC_013715	GGCG	2	8	29824	29831	0 %	0 %	75 %	25 %	283457117
72	NC_013715	ACCG	2	8	30464	30471	25 %	0 %	25 %	50 %	283457117
73	NC_013715	CGCC	2	8	30727	30734	0 %	0 %	25 %	75 %	283457118
74	NC_013715	GAAC	2	8	31301	31308	50 %	0 %	25 %	25 %	283457118
75	NC_013715	CAGG	2	8	31513	31520	25 %	0 %	50 %	25 %	283457119
76	NC_013715	ACGA	2	8	31945	31952	50 %	0 %	25 %	25 %	283457119
77	NC_013715	TGCC	2	8	32714	32721	0 %	25 %	25 %	50 %	283457120
78	NC_013715	TATT	2	8	33433	33440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013715	CAGC	2	8	34609	34616	25 %	0 %	25 %	50 %	283457121
80	NC_013715	CAGA	2	8	34711	34718	50 %	0 %	25 %	25 %	283457121
81	NC_013715	AGAA	2	8	35982	35989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013715	GCAA	2	8	36467	36474	50 %	0 %	25 %	25 %	283457123
83	NC_013715	TGGT	2	8	36723	36730	0 %	50 %	50 %	0 %	283457123
84	NC_013715	AGCC	2	8	37589	37596	25 %	0 %	25 %	50 %	283457123
85	NC_013715	CCGC	2	8	37983	37990	0 %	0 %	25 %	75 %	283457124
86	NC_013715	CACC	2	8	38539	38546	25 %	0 %	0 %	75 %	283457124
87	NC_013715	TCAC	2	8	38800	38807	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013715	CGTC	2	8	40042	40049	0 %	25 %	25 %	50 %	283457126
89	NC_013715	CGGT	2	8	40099	40106	0 %	25 %	50 %	25 %	283457126
90	NC_013715	CATC	2	8	40399	40406	25 %	25 %	0 %	50 %	283457126
91	NC_013715	TGGC	2	8	40469	40476	0 %	25 %	50 %	25 %	283457126
92	NC_013715	TCCT	2	8	41013	41020	0 %	50 %	0 %	50 %	283457126
93	NC_013715	TGAG	2	8	41560	41567	25 %	25 %	50 %	0 %	283457126
94	NC_013715	TGCC	2	8	41768	41775	0 %	25 %	25 %	50 %	283457127
95	NC_013715	GTTC	2	8	41861	41868	0 %	50 %	25 %	25 %	283457127
96	NC_013715	ATTC	2	8	41929	41936	25 %	50 %	0 %	25 %	283457127
97	NC_013715	CCGC	2	8	42469	42476	0 %	0 %	25 %	75 %	283457128
98	NC_013715	TTGT	2	8	42561	42568	0 %	75 %	25 %	0 %	283457128
99	NC_013715	ACTC	2	8	42818	42825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013715	TTCT	2	8	43030	43037	0 %	75 %	0 %	25 %	283457129
101	NC_013715	TGAT	2	8	43524	43531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013715	CGGG	2	8	44720	44727	0 %	0 %	75 %	25 %	283457130
103	NC_013715	GAGG	2	8	45400	45407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013715	AAAT	2	8	45549	45556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013715	AGGG	2	8	46597	46604	25 %	0 %	75 %	0 %	283457131
106	NC_013715	GGGA	2	8	47020	47027	25 %	0 %	75 %	0 %	283457131
107	NC_013715	GCCT	2	8	47318	47325	0 %	25 %	25 %	50 %	283457132
108	NC_013715	AGGA	2	8	47490	47497	50 %	0 %	50 %	0 %	283457132
109	NC_013715	TTAT	2	8	47846	47853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013715	CTTG	2	8	48045	48052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013715	CTTC	2	8	48315	48322	0 %	50 %	0 %	50 %	283457133
112	NC_013715	GTGG	2	8	49117	49124	0 %	25 %	75 %	0 %	283457133
113	NC_013715	ACCG	2	8	50444	50451	25 %	0 %	25 %	50 %	283457134
114	NC_013715	TGAT	2	8	50487	50494	25 %	50 %	25 %	0 %	283457134
115	NC_013715	TGCT	2	8	50622	50629	0 %	50 %	25 %	25 %	283457134
116	NC_013715	GTTC	2	8	50972	50979	0 %	50 %	25 %	25 %	283457134
117	NC_013715	CTTC	2	8	51055	51062	0 %	50 %	0 %	50 %	283457135
118	NC_013715	GGTC	2	8	51535	51542	0 %	25 %	50 %	25 %	283457136
119	NC_013715	TGAT	2	8	51825	51832	25 %	50 %	25 %	0 %	283457136
120	NC_013715	CGGT	2	8	52892	52899	0 %	25 %	50 %	25 %	283457138
121	NC_013715	GCTG	2	8	53767	53774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013715	CGCC	2	8	53966	53973	0 %	0 %	25 %	75 %	283457139
123	NC_013715	TGCC	2	8	54259	54266	0 %	25 %	25 %	50 %	283457139
124	NC_013715	GACC	2	8	55425	55432	25 %	0 %	25 %	50 %	283457140
125	NC_013715	GCCC	2	8	55695	55702	0 %	0 %	25 %	75 %	283457140
126	NC_013715	AGGA	2	8	56213	56220	50 %	0 %	50 %	0 %	283457140
127	NC_013715	TGAC	2	8	56480	56487	25 %	25 %	25 %	25 %	283457141
128	NC_013715	CACC	2	8	56601	56608	25 %	0 %	0 %	75 %	283457141
129	NC_013715	CGCA	2	8	56652	56659	25 %	0 %	25 %	50 %	283457141
130	NC_013715	CGAC	2	8	56690	56697	25 %	0 %	25 %	50 %	283457141
131	NC_013715	CCCT	2	8	56878	56885	0 %	25 %	0 %	75 %	283457141
132	NC_013715	GAAG	2	8	56991	56998	50 %	0 %	50 %	0 %	283457141
133	NC_013715	GCTG	2	8	57191	57198	0 %	25 %	50 %	25 %	283457141
134	NC_013715	CCGC	2	8	57980	57987	0 %	0 %	25 %	75 %	283457141
135	NC_013715	ACCT	2	8	58210	58217	25 %	25 %	0 %	50 %	283457141
136	NC_013715	ACGC	2	8	58655	58662	25 %	0 %	25 %	50 %	283457141
137	NC_013715	CTGG	2	8	59301	59308	0 %	25 %	50 %	25 %	283457141
138	NC_013715	ACCG	2	8	59745	59752	25 %	0 %	25 %	50 %	283457141
139	NC_013715	CTTC	2	8	60095	60102	0 %	50 %	0 %	50 %	283457141
140	NC_013715	TTCC	2	8	60189	60196	0 %	50 %	0 %	50 %	283457141
141	NC_013715	GTCC	2	8	60339	60346	0 %	25 %	25 %	50 %	283457141
142	NC_013715	GGGA	2	8	61464	61471	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013715	ACCA	2	8	61761	61768	50 %	0 %	0 %	50 %	283457142
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