MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 4203

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013715	TTC	2	6	1944	1949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013715	TAC	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013715	TCC	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013715	GAA	3	9	2193	2201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013715	TGA	2	6	5094	5099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013715	GGC	2	6	5139	5144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013715	CAT	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013715	GGC	2	6	5326	5331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013715	TTG	2	6	5465	5470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013715	GAC	2	6	5496	5501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013715	CCG	2	6	5541	5546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013715	GCG	2	6	5642	5647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013715	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_013715	TGG	2	6	11466	11471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013715	GCC	2	6	11479	11484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013715	GAA	2	6	11604	11609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013715	AGG	2	6	11620	11625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013715	AAT	2	6	11716	11721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013715	GAA	2	6	11722	11727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013715	ATT	2	6	11728	11733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013715	GTT	2	6	12093	12098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013715	CTG	2	6	12103	12108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013715	TGC	2	6	12153	12158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013715	TTC	2	6	12182	12187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013715	AAT	2	6	12315	12320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013715	ATG	2	6	14185	14190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013715	AGG	2	6	14201	14206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013715	CTG	2	6	14671	14676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013715	TAG	2	6	16142	16147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013715	CTC	3	9	16462	16470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013715	GCC	2	6	16521	16526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013715	CGC	2	6	16578	16583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013715	GCG	2	6	16586	16591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013715	AGA	2	6	16621	16626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013715	CTG	2	6	17713	17718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013715	TTC	2	6	17761	17766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013715	GCG	2	6	18846	18851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013715	CCG	2	6	19579	19584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013715	CAG	2	6	19602	19607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013715	AAC	2	6	19687	19692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013715	CAA	2	6	19810	19815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013715	GAA	2	6	19826	19831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013715	GAA	2	6	19875	19880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013715	CGC	2	6	21177	21182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013715	GCA	2	6	21198	21203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013715	ATG	2	6	21309	21314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013715	AAG	2	6	21369	21374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013715	ATT	2	6	21466	21471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013715	GAG	2	6	21533	21538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013715	AGG	2	6	21561	21566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013715	CCT	2	6	21745	21750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013715	TGG	2	6	21831	21836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013715	ACC	2	6	21978	21983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013715	GGA	2	6	22061	22066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013715	CCG	2	6	22142	22147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013715	ACA	2	6	23614	23619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013715	GCC	2	6	23707	23712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013715	AGC	2	6	23741	23746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013715	TAA	2	6	23809	23814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013715	AAG	2	6	23820	23825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013715	CCA	2	6	24589	24594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013715	GCC	2	6	24624	24629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013715	CTG	2	6	25742	25747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013715	ACA	2	6	25810	25815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013715	AAC	2	6	25915	25920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013715	TCG	2	6	28887	28892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013715	GAG	2	6	33301	33306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013715	GTT	2	6	33332	33337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013715	TTG	2	6	33537	33542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013715	TAA	2	6	33656	33661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013715	CGC	2	6	33712	33717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013715	CGT	2	6	34905	34910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013715	CCT	2	6	34911	34916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013715	TGT	2	6	37744	37749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013715	GCG	2	6	37769	37774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013715	TTG	2	6	37821	37826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013715	ACC	2	6	38763	38768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013715	TGG	2	6	42636	42641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013715	TGG	2	6	42720	42725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013715	GCG	2	6	42736	42741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013715	CAC	2	6	42768	42773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013715	CCT	2	6	43564	43569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_013715	AGC	2	6	43629	43634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013715	TGG	2	6	43722	43727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013715	TGC	2	6	43873	43878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013715	CGT	2	6	43901	43906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013715	GAT	2	6	43991	43996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013715	ATG	2	6	44127	44132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013715	TCA	3	9	44176	44184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013715	GGT	2	6	45358	45363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013715	GCC	2	6	45429	45434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013715	CAC	2	6	45693	45698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013715	TCA	2	6	45702	45707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013715	CGG	2	6	45773	45778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013715	CGC	2	6	45809	45814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013715	CGC	2	6	47122	47127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013715	TCG	2	6	47138	47143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013715	GTC	2	6	47151	47156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013715	TCT	2	6	47740	47745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013715	GAC	2	6	47786	47791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013715	TTC	2	6	47912	47917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013715	TGA	2	6	48024	48029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013715	ACC	2	6	50182	50187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013715	CGT	2	6	50207	50212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013715	ATG	2	6	53705	53710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013715	GCC	2	6	53890	53895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013715	ACC	2	6	53928	53933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013715	GGA	2	6	56463	56468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013715	CGG	2	6	61623	61628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013715	AGA	2	6	67785	67790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013715	CGG	2	6	68869	68874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013715	CCG	2	6	68889	68894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013715	GAG	2	6	68926	68931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013715	AGA	2	6	70591	70596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013715	GTG	2	6	72135	72140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013715	TAG	2	6	74014	74019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013715	TCC	3	9	75363	75371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013715	CTC	3	9	75372	75380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_013715	GTC	2	6	75390	75395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013715	TAA	2	6	75418	75423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013715	TTA	2	6	75444	75449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013715	TAA	2	6	75457	75462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013715	GCC	2	6	75515	75520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013715	CCT	2	6	75521	75526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013715	CCT	2	6	75530	75535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013715	GCA	2	6	75568	75573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013715	AGC	2	6	75640	75645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013715	CCT	2	6	77256	77261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_013715	AGT	2	6	77263	77268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013715	CAC	2	6	77300	77305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013715	CCG	2	6	77399	77404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013715	GCC	2	6	79396	79401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013715	GCG	2	6	80060	80065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013715	TGG	2	6	80099	80104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013715	GAA	2	6	81162	81167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013715	CTG	2	6	81170	81175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013715	CGA	2	6	81285	81290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013715	TTG	2	6	81337	81342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013715	GAA	2	6	81550	81555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013715	TGA	2	6	81573	81578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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