MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 4221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013715	GC	3	6	19	24	0 %	0 %	50 %	50 %	283457090
2	NC_013715	CG	3	6	377	382	0 %	0 %	50 %	50 %	283457090
3	NC_013715	CT	3	6	1369	1374	0 %	50 %	0 %	50 %	283457090
4	NC_013715	GC	3	6	1607	1612	0 %	0 %	50 %	50 %	283457090
5	NC_013715	GC	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	283457090
6	NC_013715	CG	5	10	2381	2390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013715	CG	3	6	3640	3645	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
8	NC_013715	CT	3	6	3882	3887	0 %	50 %	0 %	50 %	283457092
9	NC_013715	CG	3	6	3934	3939	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
10	NC_013715	CG	3	6	4250	4255	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
11	NC_013715	GC	3	6	4755	4760	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
12	NC_013715	GC	3	6	4877	4882	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
13	NC_013715	CG	3	6	5060	5065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013715	GA	3	6	5297	5302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013715	CA	3	6	5432	5437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013715	CT	3	6	5902	5907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013715	GC	3	6	6666	6671	0 %	0 %	50 %	50 %	283457093
18	NC_013715	AG	3	6	6762	6767	50 %	0 %	50 %	0 %	283457093
19	NC_013715	CG	3	6	7083	7088	0 %	0 %	50 %	50 %	283457093
20	NC_013715	GC	3	6	7557	7562	0 %	0 %	50 %	50 %	283457093
21	NC_013715	TA	3	6	8161	8166	50 %	50 %	0 %	0 %	283457094
22	NC_013715	CG	3	6	8740	8745	0 %	0 %	50 %	50 %	283457095
23	NC_013715	GC	3	6	8900	8905	0 %	0 %	50 %	50 %	283457095
24	NC_013715	GC	3	6	8998	9003	0 %	0 %	50 %	50 %	283457095
25	NC_013715	GC	3	6	10685	10690	0 %	0 %	50 %	50 %	283457095
26	NC_013715	GC	3	6	10919	10924	0 %	0 %	50 %	50 %	283457096
27	NC_013715	TG	3	6	11444	11449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013715	GT	3	6	11752	11757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013715	GT	3	6	12325	12330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013715	AC	3	6	12376	12381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013715	CT	3	6	12799	12804	0 %	50 %	0 %	50 %	283457097
32	NC_013715	TC	3	6	14232	14237	0 %	50 %	0 %	50 %	283457099
33	NC_013715	CG	3	6	14291	14296	0 %	0 %	50 %	50 %	283457099
34	NC_013715	AG	3	6	14808	14813	50 %	0 %	50 %	0 %	283457100
35	NC_013715	GC	3	6	15033	15038	0 %	0 %	50 %	50 %	283457100
36	NC_013715	GC	3	6	15183	15188	0 %	0 %	50 %	50 %	283457100
37	NC_013715	TC	3	6	16556	16561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013715	GC	3	6	17030	17035	0 %	0 %	50 %	50 %	283457101
39	NC_013715	CG	4	8	17792	17799	0 %	0 %	50 %	50 %	283457103
40	NC_013715	GC	3	6	18075	18080	0 %	0 %	50 %	50 %	283457103
41	NC_013715	TC	3	6	18300	18305	0 %	50 %	0 %	50 %	283457103
42	NC_013715	GC	3	6	18483	18488	0 %	0 %	50 %	50 %	283457103
43	NC_013715	GC	3	6	18944	18949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013715	GT	3	6	19164	19169	0 %	50 %	50 %	0 %	283457105
45	NC_013715	TA	3	6	19209	19214	50 %	50 %	0 %	0 %	283457105
46	NC_013715	GT	3	6	19290	19295	0 %	50 %	50 %	0 %	283457105
47	NC_013715	GC	3	6	19449	19454	0 %	0 %	50 %	50 %	283457105
48	NC_013715	GT	4	8	19774	19781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013715	GC	3	6	20228	20233	0 %	0 %	50 %	50 %	283457106
50	NC_013715	GA	4	8	21473	21480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013715	GC	3	6	22963	22968	0 %	0 %	50 %	50 %	283457110
52	NC_013715	AC	3	6	22994	22999	50 %	0 %	0 %	50 %	283457110
53	NC_013715	AC	3	6	23338	23343	50 %	0 %	0 %	50 %	283457110
54	NC_013715	CA	3	6	23460	23465	50 %	0 %	0 %	50 %	283457110
55	NC_013715	CA	4	8	24607	24614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013715	GC	3	6	24759	24764	0 %	0 %	50 %	50 %	283457112
57	NC_013715	AT	3	6	25707	25712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013715	CG	3	6	25904	25909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013715	GC	3	6	26547	26552	0 %	0 %	50 %	50 %	283457113
60	NC_013715	CT	3	6	27832	27837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013715	CT	3	6	27879	27884	0 %	50 %	0 %	50 %	283457114
62	NC_013715	GC	3	6	28111	28116	0 %	0 %	50 %	50 %	283457114
63	NC_013715	GC	3	6	28385	28390	0 %	0 %	50 %	50 %	283457114
64	NC_013715	GC	3	6	28985	28990	0 %	0 %	50 %	50 %	283457116
65	NC_013715	CA	3	6	29638	29643	50 %	0 %	0 %	50 %	283457117
66	NC_013715	AG	3	6	30550	30555	50 %	0 %	50 %	0 %	283457118
67	NC_013715	GT	3	6	33284	33289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013715	CG	3	6	33756	33761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013715	TA	4	8	33801	33808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013715	TA	3	6	33952	33957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013715	GC	3	6	34167	34172	0 %	0 %	50 %	50 %	283457121
72	NC_013715	CG	3	6	34519	34524	0 %	0 %	50 %	50 %	283457121
73	NC_013715	GC	3	6	34656	34661	0 %	0 %	50 %	50 %	283457121
74	NC_013715	GC	3	6	35339	35344	0 %	0 %	50 %	50 %	283457122
75	NC_013715	GA	3	6	36862	36867	50 %	0 %	50 %	0 %	283457123
76	NC_013715	GC	3	6	37241	37246	0 %	0 %	50 %	50 %	283457123
77	NC_013715	CG	3	6	37368	37373	0 %	0 %	50 %	50 %	283457123
78	NC_013715	GC	3	6	40435	40440	0 %	0 %	50 %	50 %	283457126
79	NC_013715	TC	3	6	40917	40922	0 %	50 %	0 %	50 %	283457126
80	NC_013715	CG	3	6	41725	41730	0 %	0 %	50 %	50 %	283457127
81	NC_013715	CG	3	6	41904	41909	0 %	0 %	50 %	50 %	283457127
82	NC_013715	CG	3	6	42351	42356	0 %	0 %	50 %	50 %	283457128
83	NC_013715	GT	3	6	42650	42655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013715	AT	3	6	42776	42781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013715	AT	3	6	42794	42799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013715	GC	3	6	42950	42955	0 %	0 %	50 %	50 %	283457129
87	NC_013715	GC	3	6	43256	43261	0 %	0 %	50 %	50 %	283457129
88	NC_013715	CG	3	6	43422	43427	0 %	0 %	50 %	50 %	283457129
89	NC_013715	CG	3	6	43440	43445	0 %	0 %	50 %	50 %	283457129
90	NC_013715	TC	3	6	43617	43622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013715	CG	3	6	44425	44430	0 %	0 %	50 %	50 %	283457130
92	NC_013715	GA	4	8	44821	44828	50 %	0 %	50 %	0 %	283457130
93	NC_013715	TG	3	6	45416	45421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013715	GC	3	6	45961	45966	0 %	0 %	50 %	50 %	283457131
95	NC_013715	CG	3	6	46155	46160	0 %	0 %	50 %	50 %	283457131
96	NC_013715	CG	3	6	46574	46579	0 %	0 %	50 %	50 %	283457131
97	NC_013715	CG	3	6	46679	46684	0 %	0 %	50 %	50 %	283457131
98	NC_013715	GC	3	6	47346	47351	0 %	0 %	50 %	50 %	283457132
99	NC_013715	CT	4	8	47996	48003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013715	CT	3	6	48236	48241	0 %	50 %	0 %	50 %	283457133
101	NC_013715	GT	3	6	49156	49161	0 %	50 %	50 %	0 %	283457133
102	NC_013715	GA	3	6	49282	49287	50 %	0 %	50 %	0 %	283457133
103	NC_013715	CG	3	6	49425	49430	0 %	0 %	50 %	50 %	283457133
104	NC_013715	CG	3	6	49578	49583	0 %	0 %	50 %	50 %	283457133
105	NC_013715	GC	3	6	49586	49591	0 %	0 %	50 %	50 %	283457133
106	NC_013715	AG	3	6	50215	50220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013715	TG	3	6	50251	50256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013715	GC	4	8	50465	50472	0 %	0 %	50 %	50 %	283457134
109	NC_013715	GC	3	6	52132	52137	0 %	0 %	50 %	50 %	283457136
110	NC_013715	CT	3	6	52778	52783	0 %	50 %	0 %	50 %	283457138
111	NC_013715	CT	3	6	52799	52804	0 %	50 %	0 %	50 %	283457138
112	NC_013715	GT	3	6	52847	52852	0 %	50 %	50 %	0 %	283457138
113	NC_013715	TG	3	6	53542	53547	0 %	50 %	50 %	0 %	283457138
114	NC_013715	GC	3	6	54396	54401	0 %	0 %	50 %	50 %	283457139
115	NC_013715	GC	3	6	54651	54656	0 %	0 %	50 %	50 %	283457139
116	NC_013715	AT	3	6	55248	55253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013715	TA	3	6	55258	55263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013715	GC	3	6	55837	55842	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
119	NC_013715	GC	4	8	55964	55971	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
120	NC_013715	GC	3	6	56299	56304	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
121	NC_013715	CG	3	6	56399	56404	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
122	NC_013715	GC	3	6	56410	56415	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
123	NC_013715	CA	3	6	56425	56430	50 %	0 %	0 %	50 %	283457140
124	NC_013715	CG	3	6	57140	57145	0 %	0 %	50 %	50 %	283457141
125	NC_013715	GC	3	6	57735	57740	0 %	0 %	50 %	50 %	283457141
126	NC_013715	TC	4	8	58141	58148	0 %	50 %	0 %	50 %	283457141
127	NC_013715	CG	3	6	58880	58885	0 %	0 %	50 %	50 %	283457141
128	NC_013715	GC	3	6	59895	59900	0 %	0 %	50 %	50 %	283457141
129	NC_013715	CT	3	6	61349	61354	0 %	50 %	0 %	50 %	283457141
130	NC_013715	TC	3	6	61411	61416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013715	AT	3	6	61601	61606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013715	AC	3	6	61708	61713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013715	TC	3	6	61828	61833	0 %	50 %	0 %	50 %	283457142
134	NC_013715	GC	3	6	62066	62071	0 %	0 %	50 %	50 %	283457142
135	NC_013715	CG	3	6	62456	62461	0 %	0 %	50 %	50 %	283457142
136	NC_013715	CG	3	6	62742	62747	0 %	0 %	50 %	50 %	283457142
137	NC_013715	GC	3	6	64093	64098	0 %	0 %	50 %	50 %	283457144
138	NC_013715	CG	3	6	64131	64136	0 %	0 %	50 %	50 %	283457144
139	NC_013715	TG	3	6	64722	64727	0 %	50 %	50 %	0 %	283457144
140	NC_013715	GT	3	6	65096	65101	0 %	50 %	50 %	0 %	283457145
141	NC_013715	CA	3	6	66055	66060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013715	TG	3	6	66073	66078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013715	TG	3	6	66167	66172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013715	GC	3	6	67156	67161	0 %	0 %	50 %	50 %	283457146
145	NC_013715	AC	3	6	68267	68272	50 %	0 %	0 %	50 %	283457148
146	NC_013715	GC	3	6	68302	68307	0 %	0 %	50 %	50 %	283457148
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