MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 1058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013714	TCTG	2	8	1724	1731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013714	ACGC	2	8	10505	10512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013714	CCAT	2	8	13598	13605	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013714	TGAG	2	8	18062	18069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013714	GTTT	2	8	22920	22927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013714	GCGT	2	8	26666	26673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013714	AATG	2	8	26722	26729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013714	AGCG	2	8	35502	35509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013714	ATGC	2	8	35585	35592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013714	ACGG	2	8	35731	35738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013714	GCAA	2	8	35968	35975	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013714	GTTC	2	8	36061	36068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013714	TGCC	2	8	36136	36143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013714	AACG	2	8	37072	37079	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013714	TGGA	2	8	38902	38909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013714	TGGA	2	8	39008	39015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013714	TGGA	2	8	39061	39068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013714	TGGA	2	8	39114	39121	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013714	TTTC	2	8	51401	51408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013714	ACAA	2	8	62652	62659	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013714	AAGG	2	8	63558	63565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013714	TTTG	2	8	64136	64143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013714	GATA	2	8	64198	64205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013714	GGAT	2	8	66147	66154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013714	TTGC	2	8	73869	73876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013714	CATG	2	8	73899	73906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013714	CTGC	2	8	74075	74082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013714	CGGT	2	8	78722	78729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013714	CTGG	2	8	79899	79906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013714	ACCT	2	8	84056	84063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013714	ACTT	2	8	85653	85660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013714	CCTT	2	8	94041	94048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013714	AACA	2	8	94406	94413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013714	ACTT	2	8	94428	94435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013714	CTCA	2	8	94578	94585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013714	GCTG	2	8	100643	100650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013714	GTTT	2	8	100743	100750	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013714	ACAA	2	8	100771	100778	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013714	GGCG	2	8	106157	106164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013714	ACAA	2	8	107663	107670	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013714	TTGT	2	8	107688	107695	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013714	TGAG	2	8	109632	109639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013714	GAGG	2	8	128021	128028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013714	TCCC	2	8	129572	129579	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_013714	GGGA	2	8	129594	129601	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013714	ATGG	2	8	133607	133614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013714	AAAG	2	8	140724	140731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013714	CTGA	2	8	143337	143344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013714	GGTG	2	8	149610	149617	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013714	AGGC	2	8	149989	149996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013714	AAGG	2	8	150074	150081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013714	GGCC	2	8	151475	151482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013714	GCCA	2	8	151486	151493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013714	CGTC	2	8	157799	157806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013714	CTGA	2	8	157827	157834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013714	TCCC	2	8	162730	162737	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_013714	GCTC	2	8	169814	169821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013714	AGGG	2	8	173193	173200	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013714	GGAA	2	8	180869	180876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013714	TTGA	2	8	184421	184428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013714	CGTT	2	8	185165	185172	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013714	GCCA	2	8	185268	185275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013714	CAGT	2	8	186367	186374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013714	CAAC	2	8	188329	188336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013714	GTAA	2	8	188405	188412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013714	TGGC	2	8	192056	192063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013714	TGGC	2	8	192072	192079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013714	CGTT	2	8	193479	193486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013714	GGAG	2	8	198751	198758	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013714	GAAA	2	8	212641	212648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013714	ATTC	2	8	212657	212664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013714	GAAT	2	8	212682	212689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013714	ACAT	2	8	212732	212739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013714	CCAA	2	8	216601	216608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013714	AGAA	2	8	216618	216625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013714	GGAC	2	8	232899	232906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013714	CGAC	2	8	232921	232928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013714	TGCC	2	8	232985	232992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013714	GGTT	2	8	234416	234423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013714	GAGG	2	8	234605	234612	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013714	ATCC	2	8	238659	238666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013714	CGGT	2	8	242561	242568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013714	ATCT	2	8	242662	242669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013714	TTGC	2	8	242718	242725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013714	TTCA	2	8	242760	242767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013714	TTCG	2	8	243065	243072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013714	TTAA	2	8	262131	262138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013714	ATCA	2	8	265629	265636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013714	GCGG	2	8	265641	265648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013714	ACGA	2	8	271859	271866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013714	CGGT	2	8	280969	280976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013714	CGTC	2	8	280994	281001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013714	GCCG	2	8	283853	283860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013714	GCCG	2	8	283869	283876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013714	CGGT	2	8	283925	283932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013714	GACT	2	8	283941	283948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013714	GCCC	2	8	286385	286392	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_013714	CGAG	2	8	286399	286406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013714	CGTT	2	8	291506	291513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013714	CAGC	2	8	291602	291609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013714	GGCG	2	8	301442	301449	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013714	GGCC	2	8	302600	302607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013714	GGAA	2	8	302650	302657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013714	CCCT	2	8	305675	305682	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_013714	CGGT	2	8	306774	306781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013714	CATA	2	8	311569	311576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013714	GTTC	2	8	313001	313008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013714	AGGA	2	8	313104	313111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013714	TACG	2	8	314568	314575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013714	TGCC	2	8	315711	315718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013714	GGCG	2	8	321925	321932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013714	GACG	2	8	328348	328355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013714	GAGG	2	8	329512	329519	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013714	AAAC	2	8	331259	331266	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013714	ATAA	2	8	334279	334286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013714	GCCA	2	8	336243	336250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013714	GCTT	2	8	347822	347829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013714	CGTG	2	8	347935	347942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013714	CTGG	2	8	348068	348075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013714	AAAC	2	8	352552	352559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013714	CCAA	2	8	357326	357333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013714	TTTG	2	8	357389	357396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013714	ACGC	2	8	367050	367057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013714	TGCA	2	8	378182	378189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013714	CGTC	2	8	378255	378262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013714	CCGT	2	8	379156	379163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013714	GTCT	2	8	380542	380549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013714	GGCG	2	8	386544	386551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013714	TGCC	2	8	387560	387567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013714	AACG	2	8	391161	391168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013714	GGTG	2	8	392470	392477	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013714	GGCG	2	8	392555	392562	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013714	ATGG	2	8	399197	399204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013714	CCTT	2	8	399867	399874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013714	TCGT	2	8	401767	401774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013714	CTTC	2	8	402920	402927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013714	TTCG	2	8	403377	403384	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013714	TTGG	2	8	407603	407610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013714	GCTC	2	8	410819	410826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013714	ACTC	2	8	411911	411918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013714	CGGC	2	8	412279	412286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013714	TCTG	2	8	413614	413621	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013714	GCAG	2	8	415584	415591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013714	GCAT	2	8	417829	417836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013714	GCAT	2	8	421236	421243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013714	TCAA	2	8	421279	421286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013714	TCGG	2	8	421362	421369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013714	TCCT	2	8	422616	422623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013714	GGGA	2	8	428306	428313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013714	GACA	2	8	429537	429544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013714	AATC	2	8	432210	432217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013714	GGAA	2	8	432392	432399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013714	AGAA	2	8	432444	432451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013714	GGCT	2	8	451406	451413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_013714	CAGG	2	8	451418	451425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_013714	GCAG	2	8	451581	451588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_013714	GACA	2	8	454053	454060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_013714	GTCC	2	8	455043	455050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013714	AACG	2	8	458360	458367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_013714	CGTC	2	8	459108	459115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_013714	GCCT	2	8	461463	461470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_013714	CCAA	2	8	463237	463244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_013714	CCAA	2	8	463372	463379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_013714	TTGA	2	8	464969	464976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013714	GAAC	2	8	467347	467354	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_013714	GAAA	2	8	467513	467520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013714	CCAT	2	8	475039	475046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_013714	AAAT	2	8	484155	484162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013714	AGCT	2	8	485008	485015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_013714	CGGT	2	8	486218	486225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_013714	GCCG	2	8	486249	486256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_013714	TCTT	2	8	487790	487797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_013714	GTTG	2	8	488050	488057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013714	CTGC	2	8	488156	488163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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176	NC_013714	GGTG	2	8	498148	498155	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013714	AAGA	2	8	500281	500288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_013714	ACTG	2	8	502150	502157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_013714	TGTC	2	8	519698	519705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
182	NC_013714	TAAA	2	8	527813	527820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_013714	TGAG	2	8	537609	537616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013714	CTCA	2	8	537645	537652	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_013714	TCTT	2	8	557940	557947	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
190	NC_013714	GTTC	2	8	558586	558593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_013714	CTTG	2	8	576865	576872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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201	NC_013714	GGGA	2	8	609986	609993	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_013714	GATA	2	8	1266502	1266509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_013714	ATGC	2	8	1266712	1266719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_013714	TTCT	2	8	1269018	1269025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_013714	CAGG	2	8	1286268	1286275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_013714	GACT	2	8	1287528	1287535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_013714	TTGA	2	8	1288522	1288529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
489	NC_013714	ATGG	2	8	1290131	1290138	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_013714	GGGA	2	8	1291343	1291350	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_013714	CCGT	2	8	1299654	1299661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_013714	CGTC	2	8	1315364	1315371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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