MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 1676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	TCATT	2	10	507	516	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013665	GTCCC	2	10	5111	5120	0 %	20 %	20 %	60 %	282162676
3	NC_013665	CGGCG	2	10	5236	5245	0 %	0 %	60 %	40 %	282162676
4	NC_013665	CCAGG	2	10	5475	5484	20 %	0 %	40 %	40 %	282162677
5	NC_013665	TCATT	2	10	7247	7256	20 %	60 %	0 %	20 %	282162677
6	NC_013665	GCCGC	2	10	7417	7426	0 %	0 %	40 %	60 %	282162678
7	NC_013665	CGACT	2	10	8877	8886	20 %	20 %	20 %	40 %	282162680
8	NC_013665	TTCTG	2	10	9992	10001	0 %	60 %	20 %	20 %	282162683
9	NC_013665	AGGGG	2	10	12294	12303	20 %	0 %	80 %	0 %	282162687
10	NC_013665	CGGCA	2	10	21655	21664	20 %	0 %	40 %	40 %	282162699
11	NC_013665	GGGCT	2	10	27429	27438	0 %	20 %	60 %	20 %	282162706
12	NC_013665	CGTGT	2	10	29587	29596	0 %	40 %	40 %	20 %	282162710
13	NC_013665	GGCGT	2	10	32597	32606	0 %	20 %	60 %	20 %	282162712
14	NC_013665	GGGCG	2	10	33521	33530	0 %	0 %	80 %	20 %	282162712
15	NC_013665	CAGCC	2	10	34822	34831	20 %	0 %	20 %	60 %	282162714
16	NC_013665	CCCCG	2	10	35302	35311	0 %	0 %	20 %	80 %	282162715
17	NC_013665	AAGTG	2	10	35554	35563	40 %	20 %	40 %	0 %	282162715
18	NC_013665	ACGCT	2	10	36419	36428	20 %	20 %	20 %	40 %	282162716
19	NC_013665	AGCGG	2	10	39864	39873	20 %	0 %	60 %	20 %	282162722
20	NC_013665	GTGCC	2	10	40112	40121	0 %	20 %	40 %	40 %	282162722
21	NC_013665	AGTCG	2	10	41292	41301	20 %	20 %	40 %	20 %	282162722
22	NC_013665	AATTC	2	10	42212	42221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013665	ACATT	2	10	42318	42327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013665	AAGTA	2	10	45734	45743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013665	TTACA	2	10	45901	45910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013665	ATCTC	2	10	47018	47027	20 %	40 %	0 %	40 %	282162726
27	NC_013665	CGGAC	2	10	48909	48918	20 %	0 %	40 %	40 %	282162727
28	NC_013665	GCCTG	2	10	51301	51310	0 %	20 %	40 %	40 %	282162729
29	NC_013665	CAAGC	2	10	52472	52481	40 %	0 %	20 %	40 %	282162730
30	NC_013665	GATAA	2	10	52953	52962	60 %	20 %	20 %	0 %	282162730
31	NC_013665	ACGTC	2	10	53428	53437	20 %	20 %	20 %	40 %	282162730
32	NC_013665	CTGGA	2	10	64492	64501	20 %	20 %	40 %	20 %	282162741
33	NC_013665	AGCAC	2	10	66867	66876	40 %	0 %	20 %	40 %	282162745
34	NC_013665	GCCTC	2	10	67944	67953	0 %	20 %	20 %	60 %	282162746
35	NC_013665	ATATA	2	10	68945	68954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013665	GGAGC	2	10	70152	70161	20 %	0 %	60 %	20 %	282162749
37	NC_013665	AAGGC	2	10	71949	71958	40 %	0 %	40 %	20 %	282162750
38	NC_013665	GGGGC	2	10	72658	72667	0 %	0 %	80 %	20 %	282162751
39	NC_013665	TCACG	2	10	73855	73864	20 %	20 %	20 %	40 %	282162752
40	NC_013665	TTTAT	2	10	80290	80299	20 %	80 %	0 %	0 %	282162759
41	NC_013665	CAGCG	2	10	84573	84582	20 %	0 %	40 %	40 %	282162763
42	NC_013665	ATAAA	2	10	85819	85828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013665	ATTCG	2	10	88894	88903	20 %	40 %	20 %	20 %	282162769
44	NC_013665	GGCCG	2	10	94664	94673	0 %	0 %	60 %	40 %	282162775
45	NC_013665	GCCGT	2	10	95287	95296	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013665	CCGGC	2	10	95844	95853	0 %	0 %	40 %	60 %	282162776
47	NC_013665	TTCCT	2	10	97070	97079	0 %	60 %	0 %	40 %	282162778
48	NC_013665	GACAA	2	10	99572	99581	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013665	AGGGC	2	10	102463	102472	20 %	0 %	60 %	20 %	282162783
50	NC_013665	AGGGA	2	10	102895	102904	40 %	0 %	60 %	0 %	282162783
51	NC_013665	GCCCT	2	10	103575	103584	0 %	20 %	20 %	60 %	282162784
52	NC_013665	TTTAT	2	10	103874	103883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013665	AGTGA	2	10	106540	106549	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013665	TGGCT	2	10	108808	108817	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013665	CTAAC	2	10	111006	111015	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_013665	TCAAC	2	10	111088	111097	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_013665	ACAAA	2	10	111993	112002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013665	CGCCT	2	10	112693	112702	0 %	20 %	20 %	60 %	282162788
59	NC_013665	GCCTT	2	10	113085	113094	0 %	40 %	20 %	40 %	282162788
60	NC_013665	CTGGG	2	10	113875	113884	0 %	20 %	60 %	20 %	282162788
61	NC_013665	GTCGT	2	10	114230	114239	0 %	40 %	40 %	20 %	282162788
62	NC_013665	TGGGC	2	10	116706	116715	0 %	20 %	60 %	20 %	282162790
63	NC_013665	GTCCA	2	10	119549	119558	20 %	20 %	20 %	40 %	282162793
64	NC_013665	CATGC	2	10	130191	130200	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013665	CGGGG	2	10	131808	131817	0 %	0 %	80 %	20 %	282162807
66	NC_013665	CTGTC	2	10	132578	132587	0 %	40 %	20 %	40 %	282162807
67	NC_013665	GGCAC	2	10	134898	134907	20 %	0 %	40 %	40 %	282162809
68	NC_013665	GCGCG	2	10	138069	138078	0 %	0 %	60 %	40 %	282162813
69	NC_013665	TCCAG	2	10	138124	138133	20 %	20 %	20 %	40 %	282162813
70	NC_013665	CGTGG	2	10	141194	141203	0 %	20 %	60 %	20 %	282162815
71	NC_013665	GAACG	2	10	145560	145569	40 %	0 %	40 %	20 %	282162818
72	NC_013665	CGGCA	2	10	149863	149872	20 %	0 %	40 %	40 %	282162822
73	NC_013665	GCCGA	2	10	151035	151044	20 %	0 %	40 %	40 %	282162824
74	NC_013665	GGAAG	2	10	159235	159244	40 %	0 %	60 %	0 %	282162833
75	NC_013665	TTTTA	2	10	159428	159437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013665	ACCGC	2	10	162482	162491	20 %	0 %	20 %	60 %	282162837
77	NC_013665	GGACC	2	10	162624	162633	20 %	0 %	40 %	40 %	282162837
78	NC_013665	CGGAG	2	10	163239	163248	20 %	0 %	60 %	20 %	282162838
79	NC_013665	CTGTG	2	10	167121	167130	0 %	40 %	40 %	20 %	282162842
80	NC_013665	CCTTT	2	10	168354	168363	0 %	60 %	0 %	40 %	282162844
81	NC_013665	GCCCC	2	10	168407	168416	0 %	0 %	20 %	80 %	282162844
82	NC_013665	CCGGG	2	10	168913	168922	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013665	CGAGG	2	10	169277	169286	20 %	0 %	60 %	20 %	282162845
84	NC_013665	ATCTC	2	10	171577	171586	20 %	40 %	0 %	40 %	282162848
85	NC_013665	GCCTC	2	10	172471	172480	0 %	20 %	20 %	60 %	282162848
86	NC_013665	GGAAT	2	10	175768	175777	40 %	20 %	40 %	0 %	282162852
87	NC_013665	TTATT	2	10	182690	182699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013665	GCCCG	2	10	184073	184082	0 %	0 %	40 %	60 %	282162859
89	NC_013665	TCGGC	2	10	184827	184836	0 %	20 %	40 %	40 %	282162860
90	NC_013665	CTCGC	2	10	185232	185241	0 %	20 %	20 %	60 %	282162861
91	NC_013665	AGCGA	2	10	189990	189999	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013665	TCACG	2	10	190496	190505	20 %	20 %	20 %	40 %	282162866
93	NC_013665	ATTAT	2	10	193279	193288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013665	AGTAG	2	10	194539	194548	40 %	20 %	40 %	0 %	282162870
95	NC_013665	GGAGC	2	10	195814	195823	20 %	0 %	60 %	20 %	282162870
96	NC_013665	AGCCT	2	10	196122	196131	20 %	20 %	20 %	40 %	282162870
97	NC_013665	GTCGG	2	10	197224	197233	0 %	20 %	60 %	20 %	282162871
98	NC_013665	CCTTT	2	10	206515	206524	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013665	GGGCC	2	10	206792	206801	0 %	0 %	60 %	40 %	282162881
100	NC_013665	AGGGG	2	10	211540	211549	20 %	0 %	80 %	0 %	282162885
101	NC_013665	CCTGG	2	10	216240	216249	0 %	20 %	40 %	40 %	282162889
102	NC_013665	GACCG	2	10	217451	217460	20 %	0 %	40 %	40 %	282162890
103	NC_013665	GATAA	2	10	219983	219992	60 %	20 %	20 %	0 %	282162890
104	NC_013665	GCCCC	2	10	222045	222054	0 %	0 %	20 %	80 %	282162893
105	NC_013665	GCTCC	2	10	222825	222834	0 %	20 %	20 %	60 %	282162893
106	NC_013665	GCACG	2	10	224826	224835	20 %	0 %	40 %	40 %	282162896
107	NC_013665	CAGGG	2	10	224925	224934	20 %	0 %	60 %	20 %	282162896
108	NC_013665	GGCGA	2	10	226125	226134	20 %	0 %	60 %	20 %	282162898
109	NC_013665	GACCG	2	10	227719	227728	20 %	0 %	40 %	40 %	282162900
110	NC_013665	TGGGA	2	10	234876	234885	20 %	20 %	60 %	0 %	282162903
111	NC_013665	TTTCC	2	10	239740	239749	0 %	60 %	0 %	40 %	282162908
112	NC_013665	TCAAT	2	10	240904	240913	40 %	40 %	0 %	20 %	282162909
113	NC_013665	CCTTT	2	10	242688	242697	0 %	60 %	0 %	40 %	282162912
114	NC_013665	TTTTA	2	10	246814	246823	20 %	80 %	0 %	0 %	282162914
115	NC_013665	ATTTG	2	10	248201	248210	20 %	60 %	20 %	0 %	282162915
116	NC_013665	AGTAA	2	10	249125	249134	60 %	20 %	20 %	0 %	282162916
117	NC_013665	GTCGA	2	10	250350	250359	20 %	20 %	40 %	20 %	282162917
118	NC_013665	GAAGC	2	10	251094	251103	40 %	0 %	40 %	20 %	282162918
119	NC_013665	CGTCC	2	10	251310	251319	0 %	20 %	20 %	60 %	282162918
120	NC_013665	CAGGG	2	10	252418	252427	20 %	0 %	60 %	20 %	282162919
121	NC_013665	CAGCG	2	10	253668	253677	20 %	0 %	40 %	40 %	282162920
122	NC_013665	AGCCT	2	10	258112	258121	20 %	20 %	20 %	40 %	282162924
123	NC_013665	TGATC	2	10	264769	264778	20 %	40 %	20 %	20 %	282162929
124	NC_013665	TACTT	2	10	265886	265895	20 %	60 %	0 %	20 %	282162930
125	NC_013665	GGATT	2	10	266371	266380	20 %	40 %	40 %	0 %	282162931
126	NC_013665	CAACT	2	10	269678	269687	40 %	20 %	0 %	40 %	282162935
127	NC_013665	AATAC	2	10	270369	270378	60 %	20 %	0 %	20 %	282162935
128	NC_013665	ATAAA	2	10	273163	273172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013665	GGCCG	2	10	275850	275859	0 %	0 %	60 %	40 %	282162940
130	NC_013665	CAGCG	2	10	277729	277738	20 %	0 %	40 %	40 %	282162942
131	NC_013665	GCGCA	2	10	279702	279711	20 %	0 %	40 %	40 %	282162944
132	NC_013665	AAAAT	2	10	281519	281528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013665	CGTAG	2	10	282336	282345	20 %	20 %	40 %	20 %	282162947
134	NC_013665	TTTAA	2	10	283941	283950	40 %	60 %	0 %	0 %	282162950
135	NC_013665	ACTGT	2	10	284945	284954	20 %	40 %	20 %	20 %	282162951
136	NC_013665	TAATC	2	10	289185	289194	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013665	GATGA	2	10	292789	292798	40 %	20 %	40 %	0 %	282162957
138	NC_013665	CTGCC	2	10	294567	294576	0 %	20 %	20 %	60 %	282162958
139	NC_013665	TCTTG	2	10	297735	297744	0 %	60 %	20 %	20 %	282162962
140	NC_013665	GCCGT	2	10	300069	300078	0 %	20 %	40 %	40 %	282162965
141	NC_013665	TTCCT	2	10	303290	303299	0 %	60 %	0 %	40 %	282162969
142	NC_013665	ATATC	2	10	304855	304864	40 %	40 %	0 %	20 %	282162971
143	NC_013665	CGGGG	2	10	308686	308695	0 %	0 %	80 %	20 %	282162977
144	NC_013665	GAGAG	2	10	311904	311913	40 %	0 %	60 %	0 %	282162980
145	NC_013665	GCCCC	2	10	315471	315480	0 %	0 %	20 %	80 %	282162985
146	NC_013665	CCGGC	2	10	315869	315878	0 %	0 %	40 %	60 %	282162985
147	NC_013665	GCGGG	2	10	323415	323424	0 %	0 %	80 %	20 %	282162992
148	NC_013665	ACGGC	2	10	324150	324159	20 %	0 %	40 %	40 %	282162993
149	NC_013665	ATTAT	2	10	325324	325333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013665	TGGGG	2	10	327169	327178	0 %	20 %	80 %	0 %	282162995
151	NC_013665	CGGAC	2	10	328836	328845	20 %	0 %	40 %	40 %	282162995
152	NC_013665	CGGCG	2	10	330552	330561	0 %	0 %	60 %	40 %	282162996
153	NC_013665	GCGTC	2	10	331667	331676	0 %	20 %	40 %	40 %	282162996
154	NC_013665	AGATA	2	10	332526	332535	60 %	20 %	20 %	0 %	282162996
155	NC_013665	ATGGC	2	10	333554	333563	20 %	20 %	40 %	20 %	282162997
156	NC_013665	CCTGC	2	10	339176	339185	0 %	20 %	20 %	60 %	282163003
157	NC_013665	CCCGA	2	10	339487	339496	20 %	0 %	20 %	60 %	282163003
158	NC_013665	CAGCG	2	10	340163	340172	20 %	0 %	40 %	40 %	282163005
159	NC_013665	CACGG	2	10	342842	342851	20 %	0 %	40 %	40 %	282163007
160	NC_013665	GTCCT	2	10	343198	343207	0 %	40 %	20 %	40 %	282163008
161	NC_013665	TTATC	2	10	346260	346269	20 %	60 %	0 %	20 %	282163010
162	NC_013665	CGCTT	2	10	348032	348041	0 %	40 %	20 %	40 %	282163012
163	NC_013665	GGAGC	2	10	350232	350241	20 %	0 %	60 %	20 %	282163014
164	NC_013665	TTTTA	2	10	350825	350834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013665	GATGG	2	10	351678	351687	20 %	20 %	60 %	0 %	282163016
166	NC_013665	ATACG	2	10	354491	354500	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_013665	CAGCA	2	10	355066	355075	40 %	0 %	20 %	40 %	282163020
168	NC_013665	GGCAA	2	10	358690	358699	40 %	0 %	40 %	20 %	282163024
169	NC_013665	TTATG	2	10	359619	359628	20 %	60 %	20 %	0 %	282163025
170	NC_013665	GGCCC	2	10	359986	359995	0 %	0 %	40 %	60 %	282163026
171	NC_013665	AGGCA	2	10	361867	361876	40 %	0 %	40 %	20 %	282163027
172	NC_013665	AAGCT	2	10	365671	365680	40 %	20 %	20 %	20 %	282163032
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175	NC_013665	AGCCC	2	10	370272	370281	20 %	0 %	20 %	60 %	282163036
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177	NC_013665	ATTTT	2	10	376271	376280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_013665	CCTTC	2	10	377906	377915	0 %	40 %	0 %	60 %	282163041
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181	NC_013665	GGCCG	2	10	384152	384161	0 %	0 %	60 %	40 %	282163049
182	NC_013665	GCGAG	2	10	385490	385499	20 %	0 %	60 %	20 %	282163051
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184	NC_013665	GAAAA	2	10	388837	388846	80 %	0 %	20 %	0 %	282163054
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199	NC_013665	CCGGG	2	10	422566	422575	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
200	NC_013665	CTATT	2	10	425144	425153	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
201	NC_013665	CTATT	2	10	427270	427279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
202	NC_013665	TATAA	2	10	429698	429707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_013665	CCGGA	2	10	431766	431775	20 %	0 %	40 %	40 %	282163101
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208	NC_013665	GCCGC	2	10	439624	439633	0 %	0 %	40 %	60 %	282163108
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220	NC_013665	AGGCC	2	10	461511	461520	20 %	0 %	40 %	40 %	282163132
221	NC_013665	CTGGT	2	10	464152	464161	0 %	40 %	40 %	20 %	282163136
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250	NC_013665	CGACC	2	10	517647	517656	20 %	0 %	20 %	60 %	282163197
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252	NC_013665	GCCCG	2	10	521581	521590	0 %	0 %	40 %	60 %	282163205
253	NC_013665	CCTGC	2	10	524180	524189	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
254	NC_013665	CGGCG	2	10	527492	527501	0 %	0 %	60 %	40 %	282163211
255	NC_013665	TCGAC	2	10	529715	529724	20 %	20 %	20 %	40 %	282163216
256	NC_013665	CAGGC	2	10	529934	529943	20 %	0 %	40 %	40 %	282163216
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259	NC_013665	TGGCG	2	10	533051	533060	0 %	20 %	60 %	20 %	282163218
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263	NC_013665	CCAGG	2	10	542915	542924	20 %	0 %	40 %	40 %	282163231
264	NC_013665	CATTC	2	10	545519	545528	20 %	40 %	0 %	40 %	282163234
265	NC_013665	TCCTT	2	10	547289	547298	0 %	60 %	0 %	40 %	282163236
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389	NC_013665	TCCTC	2	10	776577	776586	0 %	40 %	0 %	60 %	282163458
390	NC_013665	AAGCC	2	10	776671	776680	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
391	NC_013665	ATTTT	2	10	777706	777715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_013665	AGCGC	2	10	784551	784560	20 %	0 %	40 %	40 %	282163468
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394	NC_013665	GCCGC	2	10	789820	789829	0 %	0 %	40 %	60 %	282163473
395	NC_013665	GCACC	2	10	792228	792237	20 %	0 %	20 %	60 %	282163475
396	NC_013665	GTCCT	2	10	798936	798945	0 %	40 %	20 %	40 %	282163482
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399	NC_013665	GCCCG	2	10	804516	804525	0 %	0 %	40 %	60 %	282163485
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402	NC_013665	GTCGG	2	10	818395	818404	0 %	20 %	60 %	20 %	282163501
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