MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 43593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	ATC	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013665	ACA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013665	ATG	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013665	ATG	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013665	CCG	2	6	569	574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013665	TGA	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162671
7	NC_013665	GAG	2	6	647	652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162671
8	NC_013665	GCC	2	6	794	799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162671
9	NC_013665	AAG	2	6	881	886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
10	NC_013665	AAG	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
11	NC_013665	CAT	3	9	1081	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
12	NC_013665	GAA	2	6	1114	1119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
13	NC_013665	GCG	2	6	1122	1127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
14	NC_013665	CAT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
15	NC_013665	AGC	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
16	NC_013665	CGG	2	6	1353	1358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
17	NC_013665	GCG	2	6	1373	1378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
18	NC_013665	GGT	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
19	NC_013665	GAG	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162671
20	NC_013665	GGT	2	6	1528	1533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
21	NC_013665	GAT	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162671
22	NC_013665	CAT	2	6	1720	1725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
23	NC_013665	GTG	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
24	NC_013665	CCG	2	6	1788	1793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162671
25	NC_013665	CGA	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
26	NC_013665	CAG	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
27	NC_013665	GCC	2	6	1990	1995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
28	NC_013665	CTT	2	6	1996	2001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
29	NC_013665	CCG	2	6	2003	2008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
30	NC_013665	GCC	2	6	2086	2091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
31	NC_013665	TCT	2	6	2151	2156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
32	NC_013665	TCT	2	6	2211	2216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
33	NC_013665	CCT	2	6	2235	2240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162672
34	NC_013665	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013665	TCC	2	6	2299	2304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013665	AAG	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162673
37	NC_013665	GTT	2	6	2471	2476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162673
38	NC_013665	GCC	2	6	2516	2521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162673
39	NC_013665	TTG	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013665	AAG	2	6	2951	2956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013665	TGC	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162674
42	NC_013665	GGT	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162674
43	NC_013665	CGA	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162674
44	NC_013665	ACG	2	6	3298	3303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162674
45	NC_013665	GTG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162674
46	NC_013665	CGC	2	6	3448	3453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162674
47	NC_013665	GCC	2	6	3462	3467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162674
48	NC_013665	ACG	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162675
49	NC_013665	TCG	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162675
50	NC_013665	CGC	2	6	3950	3955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162675
51	NC_013665	GGC	2	6	4034	4039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162676
52	NC_013665	CAG	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162676
53	NC_013665	GAC	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162676
54	NC_013665	CGC	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
55	NC_013665	ATG	2	6	4412	4417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
56	NC_013665	GCC	2	6	4442	4447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
57	NC_013665	GTA	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
58	NC_013665	CGT	2	6	4638	4643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162676
59	NC_013665	CGT	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162676
60	NC_013665	TCA	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162676
61	NC_013665	GCG	2	6	4914	4919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162676
62	NC_013665	GTT	2	6	5143	5148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162676
63	NC_013665	CCT	2	6	5181	5186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162676
64	NC_013665	CCG	2	6	5223	5228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
65	NC_013665	GAT	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
66	NC_013665	GCG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
67	NC_013665	GCA	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
68	NC_013665	CAC	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162677
69	NC_013665	CGC	2	6	5687	5692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
70	NC_013665	GGC	2	6	5721	5726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
71	NC_013665	CGC	2	6	5736	5741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
72	NC_013665	GGC	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
73	NC_013665	GTC	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
74	NC_013665	CGG	3	9	5879	5887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
75	NC_013665	CTC	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162677
76	NC_013665	GCC	2	6	6033	6038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
77	NC_013665	CGG	3	9	6062	6070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
78	NC_013665	TCG	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
79	NC_013665	ATT	2	6	6253	6258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162677
80	NC_013665	GCC	2	6	6322	6327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
81	NC_013665	CAG	2	6	6346	6351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
82	NC_013665	CTG	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
83	NC_013665	ACG	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
84	NC_013665	GAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162677
85	NC_013665	CAG	2	6	6441	6446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
86	NC_013665	GTA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162677
87	NC_013665	CGA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
88	NC_013665	TCC	2	6	6724	6729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162677
89	NC_013665	CCG	2	6	6773	6778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
90	NC_013665	TCA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162677
91	NC_013665	GTT	2	6	6876	6881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162677
92	NC_013665	GAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162677
93	NC_013665	GAG	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162677
94	NC_013665	CTT	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162677
95	NC_013665	TCG	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
96	NC_013665	CGT	2	6	7478	7483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
97	NC_013665	CGT	2	6	7508	7513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
98	NC_013665	TGA	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162678
99	NC_013665	CCG	2	6	7616	7621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162678
100	NC_013665	CAC	2	6	7632	7637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162678
101	NC_013665	CTT	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162678
102	NC_013665	CGT	2	6	7670	7675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
103	NC_013665	CCG	3	9	7682	7690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162678
104	NC_013665	ATC	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162678
105	NC_013665	GCT	2	6	7751	7756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
106	NC_013665	GTG	2	6	7843	7848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162678
107	NC_013665	ACG	2	6	7879	7884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162678
108	NC_013665	GTC	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
109	NC_013665	TCC	2	6	7972	7977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162678
110	NC_013665	TGC	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
111	NC_013665	GAT	2	6	8043	8048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162678
112	NC_013665	CAG	2	6	8082	8087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162678
113	NC_013665	TCG	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
114	NC_013665	CTG	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162679
115	NC_013665	CGT	2	6	8415	8420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162679
116	NC_013665	CAG	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162679
117	NC_013665	TCC	2	6	8447	8452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162679
118	NC_013665	GAT	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162679
119	NC_013665	GAT	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162679
120	NC_013665	AGC	2	6	8581	8586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162679
121	NC_013665	CTG	3	9	8673	8681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162679
122	NC_013665	GCT	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162679
123	NC_013665	TCC	2	6	8987	8992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162681
124	NC_013665	GTG	2	6	9037	9042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162681
125	NC_013665	GCG	2	6	9065	9070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162681
126	NC_013665	CTC	2	6	9114	9119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162681
127	NC_013665	TCC	2	6	9136	9141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162681
128	NC_013665	AAT	2	6	9160	9165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	282162681
129	NC_013665	TGG	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162681
130	NC_013665	GCC	2	6	9207	9212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162681
131	NC_013665	GCC	2	6	9295	9300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162681
132	NC_013665	GAT	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162681
133	NC_013665	CGG	2	6	9326	9331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162681
134	NC_013665	GCG	2	6	9379	9384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162681
135	NC_013665	TCA	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162681
136	NC_013665	TGA	2	6	9467	9472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162681
137	NC_013665	TCG	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162681
138	NC_013665	CAC	2	6	9546	9551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162681
139	NC_013665	CGC	2	6	9659	9664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162682
140	NC_013665	GGC	2	6	9703	9708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162682
141	NC_013665	CTT	2	6	9828	9833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162682
142	NC_013665	ATG	2	6	9970	9975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162683
143	NC_013665	TCT	2	6	10025	10030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162683
144	NC_013665	CTT	2	6	10041	10046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162683
145	NC_013665	TCA	2	6	10066	10071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162684
146	NC_013665	CGA	2	6	10189	10194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162684
147	NC_013665	GTC	2	6	10322	10327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162684
148	NC_013665	GCC	3	9	10352	10360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162684
149	NC_013665	CGC	2	6	10364	10369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162684
150	NC_013665	CGG	2	6	10501	10506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162684
151	NC_013665	GAA	2	6	10565	10570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162684
152	NC_013665	GCC	2	6	10607	10612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162684
153	NC_013665	CTT	2	6	10665	10670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162685
154	NC_013665	CGT	2	6	10706	10711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162685
155	NC_013665	CTG	2	6	10857	10862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162685
156	NC_013665	CTG	2	6	10869	10874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162685
157	NC_013665	GCT	3	9	10877	10885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162685
158	NC_013665	CTC	2	6	10920	10925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162685
159	NC_013665	GCC	2	6	10934	10939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162685
160	NC_013665	CGC	2	6	10958	10963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162685
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162	NC_013665	CGG	2	6	11048	11053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162686
163	NC_013665	GCC	2	6	11121	11126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162686
164	NC_013665	GCT	2	6	11159	11164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162686
165	NC_013665	CGC	2	6	11219	11224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162686
166	NC_013665	TTC	2	6	11227	11232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162686
167	NC_013665	CCG	2	6	11236	11241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162686
168	NC_013665	ACC	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162686
169	NC_013665	CTG	2	6	11328	11333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162686
170	NC_013665	CGG	2	6	11337	11342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162686
171	NC_013665	ACG	2	6	11431	11436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162686
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174	NC_013665	TCC	2	6	11478	11483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_013665	TTC	2	6	11706	11711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162687
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179	NC_013665	CTT	2	6	11931	11936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162687
180	NC_013665	TTC	2	6	11944	11949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162687
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185	NC_013665	TTC	2	6	12124	12129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162687
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242	NC_013665	CTC	2	6	15541	15546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162692
243	NC_013665	CAT	2	6	15744	15749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162693
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248	NC_013665	GGA	3	9	16023	16031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162693
249	NC_013665	TCC	2	6	16052	16057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162693
250	NC_013665	CGC	2	6	16100	16105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162693
251	NC_013665	CCG	2	6	16158	16163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162693
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253	NC_013665	TCA	2	6	16241	16246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162693
254	NC_013665	GGC	2	6	16272	16277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162693
255	NC_013665	CAT	2	6	16302	16307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162693
256	NC_013665	GTC	2	6	16321	16326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162693
257	NC_013665	ACA	2	6	16344	16349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_013665	TTA	2	6	16350	16355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_013665	CGG	2	6	16448	16453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162694
260	NC_013665	CCG	2	6	16468	16473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162694
261	NC_013665	GCC	2	6	16487	16492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162694
262	NC_013665	GAG	2	6	16578	16583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162694
263	NC_013665	TGG	2	6	16642	16647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162694
264	NC_013665	ATG	2	6	16665	16670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162694
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267	NC_013665	TAC	2	6	16785	16790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162694
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273	NC_013665	GCG	2	6	17238	17243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162695
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277	NC_013665	GCC	2	6	17370	17375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162695
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281	NC_013665	GGC	2	6	17521	17526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162695
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288	NC_013665	CGG	2	6	17934	17939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162695
289	NC_013665	CGA	2	6	17953	17958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162695
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298	NC_013665	ACC	2	6	18416	18421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162696
299	NC_013665	AGA	2	6	18512	18517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162696
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302	NC_013665	TGG	2	6	18704	18709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162696
303	NC_013665	ATG	2	6	18718	18723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162696
304	NC_013665	ATG	2	6	18730	18735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162696
305	NC_013665	ATT	2	6	18914	18919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_013665	TCC	2	6	18928	18933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162697
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331	NC_013665	TTC	2	6	20255	20260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
332	NC_013665	CGA	2	6	20334	20339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162698
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340	NC_013665	TAT	2	6	20721	20726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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378	NC_013665	CCA	2	6	22547	22552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162700
379	NC_013665	GTG	2	6	22591	22596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162700
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381	NC_013665	CAT	2	6	22707	22712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162700
382	NC_013665	CAT	2	6	22743	22748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162700
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500	NC_013665	TCG	2	6	29873	29878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162710

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