MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 4132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	ATC	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013665	ACA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013665	ATG	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013665	ATG	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013665	CCG	2	6	569	574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013665	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013665	TCC	2	6	2299	2304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013665	TTG	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013665	AAG	2	6	2951	2956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013665	TCC	2	6	11478	11483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013665	ATT	3	9	13289	13297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013665	TAA	2	6	13762	13767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013665	GAA	2	6	13804	13809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013665	ATT	2	6	13839	13844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013665	ATG	2	6	13916	13921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013665	CTC	2	6	14856	14861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013665	ACA	2	6	16344	16349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013665	TTA	2	6	16350	16355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013665	ATT	2	6	18914	18919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013665	TTC	2	6	20255	20260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013665	AAC	2	6	20712	20717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013665	TAT	2	6	20721	20726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013665	AAG	2	6	24846	24851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013665	TAA	3	9	24896	24904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013665	GCG	2	6	24943	24948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013665	CAT	2	6	24952	24957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013665	GAC	2	6	24958	24963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013665	TTC	2	6	24977	24982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013665	GAC	2	6	28785	28790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013665	ACG	2	6	28798	28803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013665	GGC	2	6	28811	28816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013665	GCG	2	6	28824	28829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013665	ATT	2	6	28894	28899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013665	CGG	2	6	28960	28965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013665	GTA	3	9	29012	29020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013665	TCC	3	9	30533	30541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013665	GGA	2	6	30580	30585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013665	GTC	2	6	30610	30615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013665	CGC	3	9	30622	30630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013665	TCG	2	6	30638	30643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013665	GCC	2	6	30662	30667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013665	TAT	3	9	32373	32381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013665	ATA	3	9	34227	34235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013665	TTA	2	6	34310	34315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013665	TCG	2	6	36221	36226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013665	AGG	2	6	36266	36271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013665	AGA	2	6	36284	36289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013665	CCG	2	6	37174	37179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013665	GCG	2	6	37278	37283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013665	ACA	2	6	37346	37351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013665	ATC	2	6	38596	38601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013665	ATG	2	6	39175	39180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013665	TTC	2	6	39247	39252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013665	ATA	2	6	39255	39260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013665	TAT	2	6	39631	39636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013665	TAA	2	6	39652	39657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013665	GGT	2	6	39733	39738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013665	GTT	2	6	42200	42205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013665	ATT	2	6	42225	42230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013665	TGT	2	6	45663	45668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013665	GAC	2	6	45694	45699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013665	ATA	2	6	46529	46534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013665	ATT	2	6	46624	46629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013665	TAT	2	6	47620	47625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013665	GCC	2	6	49975	49980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013665	CCT	2	6	51895	51900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013665	ACA	2	6	51937	51942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013665	ATA	2	6	52205	52210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013665	GCC	2	6	53761	53766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013665	TCT	2	6	54431	54436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013665	TTC	2	6	57614	57619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013665	GAA	2	6	57743	57748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013665	GAA	2	6	57758	57763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013665	GCT	2	6	57765	57770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013665	GAA	3	9	57773	57781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013665	TAT	2	6	57840	57845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013665	CTT	2	6	58459	58464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013665	TAT	2	6	59802	59807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013665	TAA	2	6	62903	62908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013665	TAT	2	6	62969	62974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013665	CGG	2	6	62990	62995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013665	TCT	2	6	62999	63004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013665	ATA	3	9	63197	63205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013665	ATA	2	6	63997	64002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013665	ATC	2	6	66093	66098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013665	AAG	2	6	67639	67644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013665	ATT	2	6	67667	67672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013665	ATT	2	6	68937	68942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013665	GAT	2	6	69652	69657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013665	CGC	2	6	69696	69701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013665	AAG	2	6	69743	69748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013665	ATT	2	6	76598	76603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013665	ATT	2	6	76606	76611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013665	ATG	2	6	76630	76635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013665	TTA	2	6	76684	76689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013665	AAG	2	6	76709	76714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013665	TAT	2	6	76735	76740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013665	TAA	2	6	76795	76800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013665	TTA	2	6	76840	76845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013665	TAA	2	6	76857	76862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013665	AAT	2	6	76879	76884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013665	TTA	2	6	76885	76890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013665	TAA	2	6	77296	77301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013665	AAC	2	6	77303	77308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013665	ATC	2	6	77320	77325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013665	TTA	2	6	80760	80765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013665	GCA	2	6	80809	80814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013665	AGC	2	6	80815	80820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013665	CGG	2	6	80828	80833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013665	ATG	2	6	80856	80861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013665	GAA	2	6	82052	82057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013665	TCG	2	6	82076	82081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013665	GCT	2	6	82107	82112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013665	TTA	2	6	82160	82165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013665	CGG	2	6	82593	82598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013665	TGT	2	6	82599	82604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013665	TTG	2	6	85767	85772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013665	ATA	2	6	85867	85872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013665	GTC	2	6	88104	88109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013665	CTC	2	6	88134	88139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013665	TTC	2	6	90507	90512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013665	TGT	2	6	92537	92542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013665	GAT	2	6	92609	92614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013665	CCG	2	6	92690	92695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013665	GCA	2	6	92729	92734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013665	GGC	2	6	92742	92747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013665	TAA	2	6	95048	95053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013665	TGG	2	6	95355	95360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013665	GGC	3	9	95382	95390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013665	CTT	2	6	95459	95464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013665	CGT	2	6	95490	95495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013665	TGC	2	6	98020	98025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013665	TTA	2	6	98046	98051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013665	ACA	2	6	99635	99640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013665	TTA	2	6	99685	99690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013665	TGA	2	6	99720	99725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013665	ATT	2	6	100780	100785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013665	AGG	2	6	101132	101137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013665	CAT	2	6	101551	101556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013665	TAA	2	6	101729	101734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013665	TCA	2	6	101735	101740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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