MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	AGTTAC	2	12	136	147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013657	GACGAG	2	12	3765	3776	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	281427971
3	NC_013657	TTTAAT	2	12	5998	6009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427973
4	NC_013657	AAAAAT	2	12	7915	7926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281427974
5	NC_013657	TTTGCT	2	12	10164	10175	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281427977
6	NC_013657	GATCCA	2	12	12235	12246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013657	TAAAAA	2	12	12931	12942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281427981
8	NC_013657	AATAAA	2	12	13106	13117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281427981
9	NC_013657	CATTTA	2	12	14112	14123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013657	TATTTT	2	12	17125	17136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	281427985
11	NC_013657	TATAAA	2	12	19427	19438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013657	ACTTTT	2	12	20927	20938	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	281427986
13	NC_013657	TTTGTT	2	12	23171	23182	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013657	TTTGTT	2	12	23740	23751	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013657	AAATCC	2	12	29190	29201	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013657	TAATTT	2	12	29399	29410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013657	TTTCAT	2	12	32361	32372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	281427994
18	NC_013657	ATCTTC	2	12	33007	33018	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	281427995
19	NC_013657	CTCTTT	2	12	33826	33837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.