MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	TCCCA	2	10	5394	5403	20 %	20 %	0 %	60 %	281427973
2	NC_013657	TATAG	2	10	7043	7052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013657	TTATT	2	10	7629	7638	20 %	80 %	0 %	0 %	281427974
4	NC_013657	TTTAT	2	10	8346	8355	20 %	80 %	0 %	0 %	281427975
5	NC_013657	TTGAG	2	10	9034	9043	20 %	40 %	40 %	0 %	281427976
6	NC_013657	TAAAT	2	10	9665	9674	60 %	40 %	0 %	0 %	281427977
7	NC_013657	TTAGG	2	10	9976	9985	20 %	40 %	40 %	0 %	281427977
8	NC_013657	ATATT	2	10	10052	10061	40 %	60 %	0 %	0 %	281427977
9	NC_013657	TATAG	2	10	10340	10349	40 %	40 %	20 %	0 %	281427977
10	NC_013657	TAAAA	2	10	10377	10386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013657	CTTTT	2	10	11327	11336	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013657	TTATT	2	10	11972	11981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013657	AAAAT	2	10	12062	12071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013657	AAAAG	2	10	12986	12995	80 %	0 %	20 %	0 %	281427981
15	NC_013657	AATAA	2	10	14765	14774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013657	GAAGC	2	10	19118	19127	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013657	CAATG	2	10	19804	19813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013657	AGAAA	2	10	23012	23021	80 %	0 %	20 %	0 %	281427987
19	NC_013657	GTAAA	2	10	23473	23482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013657	ATTTT	2	10	24336	24345	20 %	80 %	0 %	0 %	281427988
21	NC_013657	TAATT	2	10	27344	27353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013657	ATTTT	2	10	28187	28196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013657	TTCTT	2	10	29074	29083	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013657	TCTTT	2	10	30224	30233	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013657	ATTTT	2	10	30331	30340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013657	ATCAA	2	10	30463	30472	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013657	ACGTA	2	10	30533	30542	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013657	TTTAA	2	10	30814	30823	40 %	60 %	0 %	0 %	281427992
29	NC_013657	ATTTA	2	10	30861	30870	40 %	60 %	0 %	0 %	281427992
30	NC_013657	CTTAT	2	10	32923	32932	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013657	ATTTT	2	10	33900	33909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.