MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	TGA	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427969
2	NC_013657	TGC	2	6	689	694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427969
3	NC_013657	ATG	3	9	919	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427969
4	NC_013657	CAA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427969
5	NC_013657	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427969
6	NC_013657	ACT	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427969
7	NC_013657	GAA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427969
8	NC_013657	GCA	2	6	1480	1485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427969
9	NC_013657	CTT	2	6	1510	1515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427969
10	NC_013657	AAT	2	6	1613	1618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427969
11	NC_013657	ATT	2	6	1633	1638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427969
12	NC_013657	GAT	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427969
13	NC_013657	CTT	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427969
14	NC_013657	GTG	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427969
15	NC_013657	TAA	2	6	1781	1786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427969
16	NC_013657	GTT	2	6	1800	1805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427969
17	NC_013657	AAC	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427969
18	NC_013657	ACA	3	9	2736	2744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427970
19	NC_013657	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
20	NC_013657	TCA	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427970
21	NC_013657	ATT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427970
22	NC_013657	TAT	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427970
23	NC_013657	CAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427970
24	NC_013657	ATT	3	9	3111	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427970
25	NC_013657	TGA	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
26	NC_013657	ATC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427970
27	NC_013657	ATT	2	6	3204	3209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427970
28	NC_013657	GAT	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
29	NC_013657	ATA	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427970
30	NC_013657	ACA	2	6	3315	3320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427970
31	NC_013657	GAT	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
32	NC_013657	TGA	2	6	3425	3430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427970
33	NC_013657	GAG	2	6	3537	3542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427971
34	NC_013657	AAC	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427971
35	NC_013657	TTA	2	6	3618	3623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427971
36	NC_013657	AAC	2	6	3640	3645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427971
37	NC_013657	TGA	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427971
38	NC_013657	AGA	3	9	3839	3847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427971
39	NC_013657	CAT	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427971
40	NC_013657	TGA	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427971
41	NC_013657	GAA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427971
42	NC_013657	GAA	3	9	4131	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427971
43	NC_013657	GTT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427971
44	NC_013657	ATT	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427972
45	NC_013657	GAT	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427972
46	NC_013657	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427972
47	NC_013657	TCC	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281427973
48	NC_013657	TGC	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427973
49	NC_013657	ACT	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427973
50	NC_013657	TCA	2	6	4687	4692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427973
51	NC_013657	TTC	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427973
52	NC_013657	AGA	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427973
53	NC_013657	AGC	2	6	4932	4937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427973
54	NC_013657	TTG	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427973
55	NC_013657	TCG	2	6	5119	5124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427973
56	NC_013657	TTA	2	6	5299	5304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427973
57	NC_013657	AGA	2	6	5498	5503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427973
58	NC_013657	TCA	2	6	5536	5541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427973
59	NC_013657	TCA	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427973
60	NC_013657	GGA	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427973
61	NC_013657	AGT	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427973
62	NC_013657	ACG	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427973
63	NC_013657	AGT	2	6	5981	5986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427973
64	NC_013657	GGA	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427974
65	NC_013657	ATT	2	6	7677	7682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427974
66	NC_013657	ATT	2	6	7828	7833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427974
67	NC_013657	ATA	2	6	8416	8421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427975
68	NC_013657	TAT	2	6	8463	8468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427975
69	NC_013657	TTG	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427975
70	NC_013657	TAT	2	6	8589	8594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427975
71	NC_013657	TGA	2	6	8632	8637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427975
72	NC_013657	TTA	2	6	8647	8652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427975
73	NC_013657	TAC	2	6	8831	8836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427976
74	NC_013657	ATA	2	6	8875	8880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427976
75	NC_013657	GAA	2	6	8906	8911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427976
76	NC_013657	TAA	2	6	8953	8958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427976
77	NC_013657	TTA	2	6	9094	9099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427976
78	NC_013657	AAC	2	6	9177	9182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427976
79	NC_013657	TAA	2	6	9227	9232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427976
80	NC_013657	ATT	2	6	9745	9750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427977
81	NC_013657	TTA	2	6	9819	9824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427977
82	NC_013657	TGG	2	6	9829	9834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427977
83	NC_013657	ATT	2	6	9849	9854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427977
84	NC_013657	GGT	2	6	9892	9897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427977
85	NC_013657	ACT	2	6	9917	9922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427977
86	NC_013657	TAG	2	6	10069	10074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427977
87	NC_013657	TAT	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427977
88	NC_013657	GAA	2	6	10086	10091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427977
89	NC_013657	AAT	2	6	10196	10201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427977
90	NC_013657	AGA	2	6	10618	10623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427978
91	NC_013657	TGT	2	6	10669	10674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427978
92	NC_013657	ATA	2	6	10742	10747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427978
93	NC_013657	TTG	3	9	10839	10847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427978
94	NC_013657	TAC	2	6	10865	10870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427978
95	NC_013657	ATA	2	6	10995	11000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427978
96	NC_013657	TTC	2	6	11058	11063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427978
97	NC_013657	CTT	2	6	11116	11121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427978
98	NC_013657	TTC	2	6	11147	11152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427978
99	NC_013657	ATT	2	6	11525	11530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427979
100	NC_013657	TAT	2	6	11543	11548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427979
101	NC_013657	ACG	2	6	11618	11623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427979
102	NC_013657	ACT	2	6	11653	11658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427979
103	NC_013657	AAT	2	6	11711	11716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427979
104	NC_013657	AAG	2	6	11838	11843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427979
105	NC_013657	TAT	2	6	11883	11888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427979
106	NC_013657	TAA	2	6	12374	12379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427980
107	NC_013657	ATA	2	6	12457	12462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427980
108	NC_013657	TAC	2	6	12530	12535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427980
109	NC_013657	CTT	2	6	12601	12606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427980
110	NC_013657	AAT	2	6	12616	12621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427980
111	NC_013657	TTG	2	6	12643	12648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427980
112	NC_013657	GAA	2	6	12943	12948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427981
113	NC_013657	CTA	2	6	13085	13090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427981
114	NC_013657	TCT	2	6	13147	13152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427981
115	NC_013657	CAC	2	6	13230	13235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281427981
116	NC_013657	TTA	2	6	13251	13256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427981
117	NC_013657	TAG	2	6	13362	13367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427981
118	NC_013657	CTT	2	6	13428	13433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427981
119	NC_013657	TTC	3	9	13450	13458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427981
120	NC_013657	TTC	2	6	13487	13492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427981
121	NC_013657	CCT	2	6	13502	13507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281427982
122	NC_013657	AGA	2	6	13521	13526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427982
123	NC_013657	CTT	2	6	13540	13545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427982
124	NC_013657	CTT	2	6	13571	13576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427982
125	NC_013657	CTT	3	9	13603	13611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427982
126	NC_013657	TCT	2	6	13630	13635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427982
127	NC_013657	GCT	2	6	13684	13689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427982
128	NC_013657	AAT	2	6	13728	13733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427982
129	NC_013657	GTT	2	6	13780	13785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427982
130	NC_013657	TTG	2	6	14382	14387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427983
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.