MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	TA	5	10	119	128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013657	AG	3	6	301	306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013657	TA	3	6	478	483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013657	TA	3	6	503	508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013657	GA	3	6	731	736	50 %	0 %	50 %	0 %	281427969
6	NC_013657	AT	3	6	1489	1494	50 %	50 %	0 %	0 %	281427969
7	NC_013657	AT	3	6	2005	2010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013657	AG	3	6	2089	2094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013657	TA	3	6	2227	2232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013657	AG	3	6	2680	2685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013657	CT	3	6	4573	4578	0 %	50 %	0 %	50 %	281427973
12	NC_013657	AG	3	6	4779	4784	50 %	0 %	50 %	0 %	281427973
13	NC_013657	TC	3	6	5104	5109	0 %	50 %	0 %	50 %	281427973
14	NC_013657	TA	3	6	6841	6846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013657	AT	3	6	6987	6992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013657	CA	3	6	7431	7436	50 %	0 %	0 %	50 %	281427974
17	NC_013657	GA	3	6	7810	7815	50 %	0 %	50 %	0 %	281427974
18	NC_013657	AT	3	6	7925	7930	50 %	50 %	0 %	0 %	281427974
19	NC_013657	TA	3	6	7978	7983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013657	AT	3	6	8339	8344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013657	GA	3	6	8519	8524	50 %	0 %	50 %	0 %	281427975
22	NC_013657	AT	3	6	8784	8789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013657	TA	3	6	8798	8803	50 %	50 %	0 %	0 %	281427976
24	NC_013657	TA	3	6	9787	9792	50 %	50 %	0 %	0 %	281427977
25	NC_013657	CA	3	6	10176	10181	50 %	0 %	0 %	50 %	281427977
26	NC_013657	AG	3	6	10354	10359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013657	CT	3	6	10393	10398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013657	AT	3	6	11203	11208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013657	TC	3	6	11403	11408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013657	TA	3	6	11820	11825	50 %	50 %	0 %	0 %	281427979
31	NC_013657	CT	3	6	11847	11852	0 %	50 %	0 %	50 %	281427979
32	NC_013657	TA	4	8	12346	12353	50 %	50 %	0 %	0 %	281427980
33	NC_013657	AT	3	6	12402	12407	50 %	50 %	0 %	0 %	281427980
34	NC_013657	AT	3	6	12586	12591	50 %	50 %	0 %	0 %	281427980
35	NC_013657	AT	3	6	13816	13821	50 %	50 %	0 %	0 %	281427982
36	NC_013657	TA	3	6	13839	13844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013657	TA	3	6	13854	13859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013657	TA	3	6	13882	13887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013657	AT	4	8	13954	13961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013657	TA	3	6	14159	14164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013657	GA	3	6	14558	14563	50 %	0 %	50 %	0 %	281427983
42	NC_013657	AT	3	6	14746	14751	50 %	50 %	0 %	0 %	281427983
43	NC_013657	CT	3	6	15100	15105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013657	GA	3	6	15374	15379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013657	TG	3	6	15993	15998	0 %	50 %	50 %	0 %	281427984
46	NC_013657	AG	3	6	16158	16163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013657	TA	3	6	16531	16536	50 %	50 %	0 %	0 %	281427985
48	NC_013657	AT	5	10	17208	17217	50 %	50 %	0 %	0 %	281427985
49	NC_013657	CT	3	6	17625	17630	0 %	50 %	0 %	50 %	281427985
50	NC_013657	AT	3	6	17833	17838	50 %	50 %	0 %	0 %	281427985
51	NC_013657	AT	3	6	18495	18500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013657	TA	3	6	18550	18555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013657	TC	3	6	18764	18769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013657	AT	4	8	18796	18803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013657	GA	4	8	19259	19266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013657	TC	3	6	19270	19275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013657	AT	3	6	19903	19908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013657	TC	3	6	20785	20790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013657	AG	3	6	21534	21539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013657	TA	3	6	21997	22002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013657	AT	3	6	22143	22148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013657	AG	3	6	22246	22251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013657	AT	3	6	22723	22728	50 %	50 %	0 %	0 %	281427987
64	NC_013657	AT	4	8	22802	22809	50 %	50 %	0 %	0 %	281427987
65	NC_013657	AT	3	6	23255	23260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013657	TA	3	6	25477	25482	50 %	50 %	0 %	0 %	281427988
67	NC_013657	AG	3	6	25508	25513	50 %	0 %	50 %	0 %	281427988
68	NC_013657	AT	3	6	25959	25964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013657	AG	3	6	28269	28274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013657	TA	3	6	28337	28342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013657	AT	3	6	29582	29587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013657	TC	3	6	30675	30680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013657	AT	3	6	31307	31312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013657	AT	3	6	32706	32711	50 %	50 %	0 %	0 %	281427994
75	NC_013657	CA	3	6	33590	33595	50 %	0 %	0 %	50 %	281427996
76	NC_013657	TC	3	6	34528	34533	0 %	50 %	0 %	50 %	281427997
77	NC_013657	TA	3	6	36745	36750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013657	TA	3	6	36892	36897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.