MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 chromosome

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013656	TTAAAT	2	12	11064	11075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013656	TAAAAA	2	12	65617	65628	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013656	TGAAAT	2	12	116362	116373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013656	AATTAA	2	12	125403	125414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013656	AAAGAA	2	12	125683	125694	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013656	AAAGTA	2	12	129789	129800	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013656	GTCAAG	2	12	129862	129873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013656	GATAAA	2	12	132772	132783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013656	AAATAT	2	12	133104	133115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013656	AAAGGT	2	12	133717	133728	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013656	ATATAA	2	12	152475	152486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013656	TAAAAA	2	12	171865	171876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013656	TAAAAA	2	12	216295	216306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013656	AAATAG	2	12	221128	221139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013656	AGTTAG	2	12	231738	231749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013656	TAAAAA	2	12	239224	239235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013656	AAAAGA	2	12	249256	249267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013656	TAAATT	2	12	254138	254149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013656	ATTCTA	2	12	264195	264206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013656	AATAAA	2	12	274713	274724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013656	TATTGC	2	12	275655	275666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013656	GAAGCG	2	12	293507	293518	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013656	ATTTAA	2	12	404684	404695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013656	TTAAAA	2	12	422774	422785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013656	TAAAAT	2	12	425049	425060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013656	TAAAAA	2	12	459996	460007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013656	ATGAAA	2	12	463110	463121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013656	TTTTTA	2	12	467939	467950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013656	ACACCG	2	12	473584	473595	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013656	AAATAA	2	12	479370	479381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013656	TGTTTT	2	12	495595	495606	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013656	TTTTAG	2	12	501551	501562	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013656	TGGAAG	2	12	534511	534522	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013656	ATTTTT	2	12	550374	550385	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013656	GTAAAG	2	12	553191	553202	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013656	ATTTTT	2	12	565500	565511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013656	AGAAAA	2	12	580343	580354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013656	ATGTAA	2	12	587915	587926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013656	ATATAA	2	12	608340	608351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013656	GGTTAA	2	12	619710	619721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013656	ATAAAA	2	12	666914	666925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013656	CTTTAA	2	12	693058	693069	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013656	ATTTTT	2	12	710900	710911	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013656	AAAATC	2	12	714380	714391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013656	GAAAAA	2	12	759243	759254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013656	GGAATA	2	12	760669	760680	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013656	AATTAA	2	12	766867	766878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013656	ATTTAA	2	12	775172	775183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013656	AGCATT	2	12	775202	775213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013656	AATTTA	2	12	795375	795386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013656	TTATTT	2	12	818713	818724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013656	AGATTT	2	12	852034	852045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013656	TATAAA	2	12	866699	866710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013656	TCAAAA	2	12	877554	877565	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013656	TAAAGA	2	12	925533	925544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013656	GGATTT	2	12	932337	932348	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013656	TAAAAA	2	12	938285	938296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013656	TAAATA	2	12	970461	970472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013656	TTTAAA	2	12	1051306	1051317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013656	TAAAAA	2	12	1065283	1065294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013656	ATTTAT	2	12	1101015	1101026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013656	TTTTAA	2	12	1102337	1102348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013656	ATTTTT	2	12	1106638	1106649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013656	TTTTTA	2	12	1127911	1127922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013656	AGTAAA	2	12	1188658	1188669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013656	GTATGT	2	12	1205457	1205468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013656	GAATAA	2	12	1208061	1208072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013656	ACAAAA	2	12	1223341	1223352	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013656	TAAAAG	2	12	1245988	1245999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013656	AGTGGC	2	12	1263752	1263763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013656	TTATAA	2	12	1274058	1274069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013656	ACAAGT	2	12	1278145	1278156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013656	GTTTTC	2	12	1279809	1279820	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013656	GAACTG	2	12	1295749	1295760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013656	TAAAAA	2	12	1335717	1335728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013656	TCACTA	2	12	1353993	1354004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013656	ATTTCT	2	12	1354092	1354103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013656	CAAGTA	2	12	1356550	1356561	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013656	TTAATT	2	12	1453810	1453821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013656	CTTTTT	2	12	1499087	1499098	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013656	TCTATT	2	12	1518912	1518923	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013656	TTTAAT	2	12	1529673	1529684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013656	TGCAGA	2	12	1529812	1529823	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013656	TTTCTG	2	12	1532874	1532885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_013656	AAAAAC	2	12	1545701	1545712	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013656	TTTTAT	2	12	1561592	1561603	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013656	CATTTT	2	12	1604638	1604649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013656	TAAATC	2	12	1605894	1605905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013656	TTTATA	2	12	1613415	1613426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013656	CAAAAA	2	12	1630646	1630657	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013656	TATTTT	2	12	1668729	1668740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013656	ATATTA	2	12	1693017	1693028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013656	TAAAAA	2	12	1704613	1704624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013656	TTTTTA	2	12	1725512	1725523	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013656	CTATTT	2	12	1750914	1750925	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013656	TCAACT	2	12	1756530	1756541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013656	GTGGCT	2	12	1780980	1780991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013656	TGACCT	2	12	1782140	1782151	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013656	TTGATT	2	12	1782310	1782321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013656	TTTTAC	2	12	1784196	1784207	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013656	TTTACA	2	12	1794176	1794187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013656	TAAAAA	2	12	1806058	1806069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013656	ATCATT	2	12	1822298	1822309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013656	TCTTTT	2	12	1836492	1836503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013656	ATTTTG	2	12	1847310	1847321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013656	TAAAAA	2	12	1851611	1851622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013656	ATGCCA	2	12	1876417	1876428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013656	CAAAAA	2	12	1878545	1878556	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013656	ATTTTT	2	12	1886980	1886991	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013656	CTTTCT	2	12	1897962	1897973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013656	CATTTT	2	12	1901994	1902005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013656	AATAAA	2	12	1928879	1928890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013656	TTAAAA	2	12	1930032	1930043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013656	TATTTT	2	12	1967769	1967780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013656	TATAAT	2	12	2032980	2032991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013656	CATTTT	2	12	2057293	2057304	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013656	TAAAAA	2	12	2083984	2083995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013656	ATTTTA	2	12	2085386	2085397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013656	TAAAAT	2	12	2090044	2090055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013656	TATTTT	2	12	2115977	2115988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013656	TTATCT	2	12	2163443	2163454	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013656	CTTCCA	2	12	2168127	2168138	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013656	TAGAAT	2	12	2184399	2184410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013656	TTTTTA	2	12	2198742	2198753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013656	TACAAA	2	12	2205999	2206010	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013656	TTTTTA	2	12	2243492	2243503	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013656	AGTGTT	2	12	2260209	2260220	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013656	TAAAAA	2	12	2263042	2263053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013656	ACAATT	2	12	2264320	2264331	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_013656	CAAAAT	2	12	2265426	2265437	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_013656	TATAAA	2	12	2279829	2279840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013656	AATTAT	2	12	2279878	2279889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013656	GAAAAA	2	12	2316655	2316666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013656	GAAAAA	2	12	2333333	2333344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013656	AAATTT	2	12	2334451	2334462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013656	ATTTTT	2	12	2334611	2334622	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_013656	GCAATA	2	12	2345594	2345605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.