MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 chromosome

Total Repeats: 984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013656	TTGCTG	2	12	996	1007	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	281490499
2	NC_013656	TTGAAG	2	12	2205	2216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490500
3	NC_013656	AAATTA	2	12	3235	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490500
4	NC_013656	AATTGA	2	12	6776	6787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490502
5	NC_013656	AAAGAT	2	12	11810	11821	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281490505
6	NC_013656	AAAAAT	2	12	13926	13937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281490508
7	NC_013656	TTTTGC	2	12	15347	15358	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281490508
8	NC_013656	GATTGA	2	12	15494	15505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490509
9	NC_013656	TTGACA	2	12	19662	19673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281490512
10	NC_013656	GTTTTT	2	12	21176	21187	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	281490513
11	NC_013656	AAGAAA	2	12	21229	21240	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	281490513
12	NC_013656	AAAGAA	2	12	22928	22939	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	281490517
13	NC_013656	GAAATT	2	12	25102	25113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490518
14	NC_013656	GTAAAA	2	12	26343	26354	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281490520
15	NC_013656	CAGGTA	2	12	26809	26820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281490520
16	NC_013656	TGTCGG	2	12	26903	26914	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	281490520
17	NC_013656	AGAAAA	2	12	32563	32574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	281490522
18	NC_013656	GTTGAC	2	12	35586	35597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281490526
19	NC_013656	CGGCTG	2	12	37789	37800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	281490528
20	NC_013656	GATAAT	2	12	38151	38162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490529
21	NC_013656	AAGGTA	2	12	38429	38440	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	281490529
22	NC_013656	ATCTTT	2	12	45509	45520	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	281490535
23	NC_013656	GGTCAG	2	12	50015	50026	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281490540
24	NC_013656	TTGCTT	2	12	51971	51982	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281490542
25	NC_013656	TTTTTA	2	12	52283	52294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	281490542
26	NC_013656	ACCATT	2	12	52534	52545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281490542
27	NC_013656	GGCTCA	2	12	52713	52724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	281490542
28	NC_013656	TTTAGG	2	12	52986	52997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	281490542
29	NC_013656	TAGTTT	2	12	53309	53320	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	281490543
30	NC_013656	TCGTAA	2	12	57038	57049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281490546
31	NC_013656	TCTTTG	2	12	59800	59811	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281490550
32	NC_013656	CTTTTG	2	12	67532	67543	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281490559
33	NC_013656	AAAATT	2	12	67779	67790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490559
34	NC_013656	ATCAAA	2	12	69783	69794	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	281490561
35	NC_013656	TGGACG	2	12	72890	72901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281490564
36	NC_013656	AATTAG	2	12	81931	81942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490573
37	NC_013656	TTTTGA	2	12	84175	84186	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	281490575
38	NC_013656	TATGGG	2	12	91972	91983	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	281490581
39	NC_013656	ATTAAT	2	12	92390	92401	50 %	50 %	0 %	0 %	281490582
40	NC_013656	TTTTCT	2	12	95203	95214	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	281490586
41	NC_013656	TTTAGT	2	12	98228	98239	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	281490589
42	NC_013656	ATTTAA	2	12	98738	98749	50 %	50 %	0 %	0 %	281490590
43	NC_013656	TTATAT	2	12	99288	99299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490590
44	NC_013656	ATTGAA	2	12	102137	102148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490594
45	NC_013656	ATGAAA	2	12	102318	102329	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281490594
46	NC_013656	AATTTA	2	12	102353	102364	50 %	50 %	0 %	0 %	281490594
47	NC_013656	TGATAT	2	12	105450	105461	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281490599
48	NC_013656	CTATAT	2	12	106963	106974	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	281490600
49	NC_013656	AGGAAA	2	12	109541	109552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490604
50	NC_013656	TGAAAT	2	12	112728	112739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490606
51	NC_013656	TTCATA	2	12	115252	115263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	281490610
52	NC_013656	TCATAA	2	12	119384	119395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	281490616
53	NC_013656	TTGCCA	2	12	121925	121936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281490620
54	NC_013656	CATGAT	2	12	123246	123257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281490621
55	NC_013656	TTAAAT	2	12	131681	131692	50 %	50 %	0 %	0 %	281490624
56	NC_013656	CCTAAA	2	12	135265	135276	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	281490626
57	NC_013656	CAAAAA	2	12	136130	136141	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	281490627
58	NC_013656	ATTTTT	2	12	139124	139135	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	281490631
59	NC_013656	GTGTTT	2	12	139485	139496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281490631
60	NC_013656	ATGCGT	2	12	140282	140293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281490632
61	NC_013656	GAAAAA	2	12	142815	142826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	281490634
62	NC_013656	AATAAA	2	12	145650	145661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281490636
63	NC_013656	GCAATA	2	12	146487	146498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281490637
64	NC_013656	ATAATT	2	12	151890	151901	50 %	50 %	0 %	0 %	281490643
65	NC_013656	AGTCGT	2	12	152719	152730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281490644
66	NC_013656	TGCCTT	2	12	153861	153872	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	281490646
67	NC_013656	TTGCTT	2	12	158528	158539	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281490650
68	NC_013656	AATACA	2	12	160129	160140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	281490652
69	NC_013656	ATTGAA	2	12	160342	160353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490652
70	NC_013656	GCTTAT	2	12	160522	160533	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	281490652
71	NC_013656	AGTTTG	2	12	167694	167705	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	281490659
72	NC_013656	ATAAAA	2	12	171803	171814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281490663
73	NC_013656	TTCGGC	2	12	172005	172016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281490664
74	NC_013656	ATTGGG	2	12	173006	173017	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	281490664
75	NC_013656	AAATAG	2	12	177397	177408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281490668
76	NC_013656	ATCGCA	2	12	177847	177858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281490669
77	NC_013656	TCGTAA	2	12	178154	178165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281490669
78	NC_013656	CTTTTT	2	12	181961	181972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	281490673
79	NC_013656	ATGTTG	2	12	187362	187373	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	281490678
80	NC_013656	AGAAGT	2	12	188463	188474	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	281490679
81	NC_013656	AACTTT	2	12	188538	188549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	281490679
82	NC_013656	TTGGAA	2	12	190887	190898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490682
83	NC_013656	GAAGGT	2	12	193875	193886	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	281490687
84	NC_013656	GAAAAC	2	12	194418	194429	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	281490687
85	NC_013656	CTGAAT	2	12	194951	194962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281490688
86	NC_013656	AGCAAA	2	12	195321	195332	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	281490688
87	NC_013656	AAAAGC	2	12	195363	195374	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	281490688
88	NC_013656	TGTACT	2	12	199072	199083	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	281490692
89	NC_013656	CGAATT	2	12	199317	199328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281490692
90	NC_013656	ATTGGA	2	12	199977	199988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490693
91	NC_013656	TTAATT	2	12	201666	201677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490694
92	NC_013656	TTAAAG	2	12	202777	202788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490695
93	NC_013656	CAAAAA	2	12	203331	203342	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	281490695
94	NC_013656	AATGAA	2	12	203453	203464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281490695
95	NC_013656	TGGAGA	2	12	207216	207227	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	281490699
96	NC_013656	GCAAAA	2	12	209294	209305	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	281490701
97	NC_013656	GCCACT	2	12	215827	215838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	281490707
98	NC_013656	TGAAAA	2	12	218037	218048	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281490709
99	NC_013656	GAGTTA	2	12	220962	220973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490711
100	NC_013656	TGAAGA	2	12	222423	222434	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	281490714
101	NC_013656	CTGACC	2	12	226822	226833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	281490720
102	NC_013656	GATGAC	2	12	227067	227078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281490720
103	NC_013656	ACGTAA	2	12	232427	232438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281490726
104	NC_013656	ACGTAA	2	12	232451	232462	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281490726
105	NC_013656	TACTCT	2	12	236123	236134	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	281490729
106	NC_013656	GAAAGG	2	12	236422	236433	50 %	0 %	50 %	0 %	281490729
107	NC_013656	AAAGAA	2	12	237888	237899	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	281490732
108	NC_013656	TAAAAA	2	12	238072	238083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281490732
109	NC_013656	TGGAAT	2	12	241306	241317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490735
110	NC_013656	GCTGTC	2	12	244412	244423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281490740
111	NC_013656	TGTTAT	2	12	254504	254515	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	281490747
112	NC_013656	TAGACA	2	12	256692	256703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281490750
113	NC_013656	ACCAGT	2	12	257024	257035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281490750
114	NC_013656	GTTCGA	2	12	258695	258706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281490751
115	NC_013656	ATAAAA	2	12	259392	259403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281490751
116	NC_013656	CATAGT	2	12	263061	263072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281490754
117	NC_013656	GTTGAA	2	12	264570	264581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490756
118	NC_013656	TTTGAT	2	12	265621	265632	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	281490757
119	NC_013656	GAATTG	2	12	270386	270397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490762
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232	NC_013656	AAGCTG	2	12	576911	576922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281491059
233	NC_013656	TTTGCT	2	12	577128	577139	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281491059
234	NC_013656	CTTGTT	2	12	577538	577549	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281491060
235	NC_013656	TTTTGC	2	12	578123	578134	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281491061
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239	NC_013656	GTGCTG	2	12	586215	586226	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	281491070
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343	NC_013656	CTTTAG	2	12	853080	853091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	281491306
344	NC_013656	ATTGAT	2	12	853998	854009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281491307
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346	NC_013656	AAAGCT	2	12	854580	854591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281491307
347	NC_013656	GCTCGT	2	12	855449	855460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281491308
348	NC_013656	CCAATT	2	12	858210	858221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281491310
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351	NC_013656	AGATCT	2	12	862531	862542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281491313
352	NC_013656	TGAATA	2	12	862554	862565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281491313
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443	NC_013656	ATGAAA	2	12	1078761	1078772	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281491528
444	NC_013656	CTTTAT	2	12	1081803	1081814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	281491537
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448	NC_013656	GAATTT	2	12	1096906	1096917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281491555
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450	NC_013656	TCTTGG	2	12	1101422	1101433	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	281491561
451	NC_013656	GTTCAT	2	12	1101928	1101939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	281491562
452	NC_013656	GATTAT	2	12	1104045	1104056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281491563
453	NC_013656	TGGTTG	2	12	1107906	1107917	0 %	50 %	50 %	0 %	281491568
454	NC_013656	ATGTTC	2	12	1108510	1108521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	281491569
455	NC_013656	AATTGA	2	12	1110246	1110257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281491570
456	NC_013656	GTCAAA	2	12	1113144	1113155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281491574
457	NC_013656	AATTAA	2	12	1116037	1116048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281491577
458	NC_013656	TGTTGA	2	12	1119967	1119978	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	281491582
459	NC_013656	GATATT	2	12	1123097	1123108	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281491587
460	NC_013656	CAAAAG	2	12	1126718	1126729	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	281491591
461	NC_013656	GTAATG	2	12	1131900	1131911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281491595
462	NC_013656	TTTATA	2	12	1132764	1132775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281491597
463	NC_013656	CTTTGG	2	12	1133680	1133691	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	281491597
464	NC_013656	TTCAAT	2	12	1134149	1134160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	281491598
465	NC_013656	CATGCT	2	12	1135540	1135551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281491599
466	NC_013656	TTGAAA	2	12	1137991	1138002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281491602
467	NC_013656	GCTAAA	2	12	1139556	1139567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281491603
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478	NC_013656	TGCTGA	2	12	1153372	1153383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281491612
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487	NC_013656	CTGGAG	2	12	1182746	1182757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281491638
488	NC_013656	ATTGAT	2	12	1192021	1192032	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281491650
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