MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 chromosome

Total Repeats: 1656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013656	AACTG	2	10	832	841	40 %	20 %	20 %	20 %	281490499
2	NC_013656	ATAAA	2	10	7618	7627	80 %	20 %	0 %	0 %	281490502
3	NC_013656	AAGAT	2	10	10404	10413	60 %	20 %	20 %	0 %	281490503
4	NC_013656	AGTAA	2	10	10547	10556	60 %	20 %	20 %	0 %	281490504
5	NC_013656	TAATA	2	10	10731	10740	60 %	40 %	0 %	0 %	281490504
6	NC_013656	CTTTA	2	10	12853	12862	20 %	60 %	0 %	20 %	281490506
7	NC_013656	AATTT	2	10	13665	13674	40 %	60 %	0 %	0 %	281490508
8	NC_013656	ATAGG	2	10	14191	14200	40 %	20 %	40 %	0 %	281490508
9	NC_013656	ACTCT	2	10	14475	14484	20 %	40 %	0 %	40 %	281490508
10	NC_013656	TAAAT	2	10	15545	15554	60 %	40 %	0 %	0 %	281490509
11	NC_013656	ATTTT	2	10	18064	18073	20 %	80 %	0 %	0 %	281490512
12	NC_013656	AAATG	2	10	18302	18311	60 %	20 %	20 %	0 %	281490512
13	NC_013656	TACTT	2	10	19964	19973	20 %	60 %	0 %	20 %	281490512
14	NC_013656	TTTAG	2	10	22036	22045	20 %	60 %	20 %	0 %	281490515
15	NC_013656	GGGTT	2	10	23332	23341	0 %	40 %	60 %	0 %	281490517
16	NC_013656	ATTTT	2	10	24969	24978	20 %	80 %	0 %	0 %	281490518
17	NC_013656	TGGTA	2	10	27764	27773	20 %	40 %	40 %	0 %	281490520
18	NC_013656	TTTTA	2	10	30311	30320	20 %	80 %	0 %	0 %	281490521
19	NC_013656	ACTTT	2	10	35893	35902	20 %	60 %	0 %	20 %	281490526
20	NC_013656	GATTG	2	10	36154	36163	20 %	40 %	40 %	0 %	281490527
21	NC_013656	AAAAG	2	10	36607	36616	80 %	0 %	20 %	0 %	281490528
22	NC_013656	ATTCA	2	10	37232	37241	40 %	40 %	0 %	20 %	281490528
23	NC_013656	AAATT	2	10	37585	37594	60 %	40 %	0 %	0 %	281490528
24	NC_013656	ATCAA	2	10	38561	38570	60 %	20 %	0 %	20 %	281490529
25	NC_013656	GGATT	2	10	39740	39749	20 %	40 %	40 %	0 %	281490530
26	NC_013656	ATTAT	2	10	39908	39917	40 %	60 %	0 %	0 %	281490530
27	NC_013656	CTTAT	2	10	40101	40110	20 %	60 %	0 %	20 %	281490530
28	NC_013656	TATTG	2	10	42417	42426	20 %	60 %	20 %	0 %	281490533
29	NC_013656	TTTAA	2	10	42550	42559	40 %	60 %	0 %	0 %	281490533
30	NC_013656	TTAAT	2	10	43536	43545	40 %	60 %	0 %	0 %	281490534
31	NC_013656	CAAAA	2	10	44729	44738	80 %	0 %	0 %	20 %	281490535
32	NC_013656	TAGTA	2	10	45007	45016	40 %	40 %	20 %	0 %	281490535
33	NC_013656	GCTTG	2	10	45623	45632	0 %	40 %	40 %	20 %	281490536
34	NC_013656	TCCAT	2	10	45974	45983	20 %	40 %	0 %	40 %	281490536
35	NC_013656	GGCTT	2	10	48751	48760	0 %	40 %	40 %	20 %	281490538
36	NC_013656	AATTA	2	10	49255	49264	60 %	40 %	0 %	0 %	281490539
37	NC_013656	GACTT	2	10	49714	49723	20 %	40 %	20 %	20 %	281490540
38	NC_013656	GTTTT	2	10	49868	49877	0 %	80 %	20 %	0 %	281490540
39	NC_013656	TTTCA	2	10	49911	49920	20 %	60 %	0 %	20 %	281490540
40	NC_013656	AAATT	2	10	51508	51517	60 %	40 %	0 %	0 %	281490541
41	NC_013656	GGTTC	2	10	52930	52939	0 %	40 %	40 %	20 %	281490542
42	NC_013656	CTTTA	2	10	52965	52974	20 %	60 %	0 %	20 %	281490542
43	NC_013656	AATAA	2	10	57602	57611	80 %	20 %	0 %	0 %	281490547
44	NC_013656	GGTTT	2	10	58655	58664	0 %	60 %	40 %	0 %	281490549
45	NC_013656	ACATC	2	10	59138	59147	40 %	20 %	0 %	40 %	281490549
46	NC_013656	AATCA	2	10	59775	59784	60 %	20 %	0 %	20 %	281490550
47	NC_013656	CCATT	2	10	61862	61871	20 %	40 %	0 %	40 %	281490551
48	NC_013656	GAAGT	2	10	62584	62593	40 %	20 %	40 %	0 %	281490552
49	NC_013656	ATGAT	2	10	63597	63606	40 %	40 %	20 %	0 %	281490554
50	NC_013656	TGGTT	2	10	64593	64602	0 %	60 %	40 %	0 %	281490555
51	NC_013656	ATTTA	2	10	68357	68366	40 %	60 %	0 %	0 %	281490560
52	NC_013656	TTTTA	2	10	71184	71193	20 %	80 %	0 %	0 %	281490563
53	NC_013656	TCAAG	2	10	75972	75981	40 %	20 %	20 %	20 %	281490568
54	NC_013656	GTTTG	2	10	76610	76619	0 %	60 %	40 %	0 %	281490568
55	NC_013656	TAGCT	2	10	80672	80681	20 %	40 %	20 %	20 %	281490571
56	NC_013656	AGTTG	2	10	80726	80735	20 %	40 %	40 %	0 %	281490571
57	NC_013656	TAAAA	2	10	80847	80856	80 %	20 %	0 %	0 %	281490572
58	NC_013656	CAGGT	2	10	82682	82691	20 %	20 %	40 %	20 %	281490574
59	NC_013656	TCTGG	2	10	83222	83231	0 %	40 %	40 %	20 %	281490574
60	NC_013656	GTTTG	2	10	84276	84285	0 %	60 %	40 %	0 %	281490575
61	NC_013656	TTTAC	2	10	87386	87395	20 %	60 %	0 %	20 %	281490578
62	NC_013656	ACAAT	2	10	88177	88186	60 %	20 %	0 %	20 %	281490578
63	NC_013656	GATTT	2	10	88248	88257	20 %	60 %	20 %	0 %	281490578
64	NC_013656	TTACA	2	10	89225	89234	40 %	40 %	0 %	20 %	281490579
65	NC_013656	CTAAT	2	10	92481	92490	40 %	40 %	0 %	20 %	281490582
66	NC_013656	AATAG	2	10	93531	93540	60 %	20 %	20 %	0 %	281490584
67	NC_013656	TGACC	2	10	94141	94150	20 %	20 %	20 %	40 %	281490584
68	NC_013656	TATTC	2	10	94745	94754	20 %	60 %	0 %	20 %	281490585
69	NC_013656	TTTTA	2	10	95478	95487	20 %	80 %	0 %	0 %	281490586
70	NC_013656	TAATA	2	10	97622	97631	60 %	40 %	0 %	0 %	281490588
71	NC_013656	TTAGT	2	10	97678	97687	20 %	60 %	20 %	0 %	281490588
72	NC_013656	CCTAT	2	10	97893	97902	20 %	40 %	0 %	40 %	281490589
73	NC_013656	GGAAT	2	10	98687	98696	40 %	20 %	40 %	0 %	281490590
74	NC_013656	AAATC	2	10	99617	99626	60 %	20 %	0 %	20 %	281490590
75	NC_013656	CTATC	2	10	99932	99941	20 %	40 %	0 %	40 %	281490591
76	NC_013656	TAAAT	2	10	100884	100893	60 %	40 %	0 %	0 %	281490593
77	NC_013656	TAGCT	2	10	101649	101658	20 %	40 %	20 %	20 %	281490593
78	NC_013656	CATTA	2	10	102702	102711	40 %	40 %	0 %	20 %	281490595
79	NC_013656	AAATT	2	10	102780	102789	60 %	40 %	0 %	0 %	281490595
80	NC_013656	ATCTC	2	10	104395	104404	20 %	40 %	0 %	40 %	281490598
81	NC_013656	ATTAT	2	10	104937	104946	40 %	60 %	0 %	0 %	281490598
82	NC_013656	TATAG	2	10	107158	107167	40 %	40 %	20 %	0 %	281490600
83	NC_013656	TTCTT	2	10	108111	108120	0 %	80 %	0 %	20 %	281490601
84	NC_013656	AAGAT	2	10	108331	108340	60 %	20 %	20 %	0 %	281490602
85	NC_013656	TGGAT	2	10	109223	109232	20 %	40 %	40 %	0 %	281490604
86	NC_013656	ATCTT	2	10	110681	110690	20 %	60 %	0 %	20 %	281490605
87	NC_013656	GAAAA	2	10	112132	112141	80 %	0 %	20 %	0 %	281490606
88	NC_013656	CCAAA	2	10	112960	112969	60 %	0 %	0 %	40 %	281490606
89	NC_013656	TGGCT	2	10	113921	113930	0 %	40 %	40 %	20 %	281490608
90	NC_013656	GCCAT	2	10	114121	114130	20 %	20 %	20 %	40 %	281490608
91	NC_013656	CAAAT	2	10	114500	114509	60 %	20 %	0 %	20 %	281490609
92	NC_013656	TAAAA	2	10	118962	118971	80 %	20 %	0 %	0 %	281490615
93	NC_013656	CGTCG	2	10	122948	122957	0 %	20 %	40 %	40 %	281490621
94	NC_013656	ACCAA	2	10	124378	124387	60 %	0 %	0 %	40 %	281490622
95	NC_013656	AAAAT	2	10	134147	134156	80 %	20 %	0 %	0 %	281490625
96	NC_013656	AGGTT	2	10	134815	134824	20 %	40 %	40 %	0 %	281490626
97	NC_013656	CTCAA	2	10	134904	134913	40 %	20 %	0 %	40 %	281490626
98	NC_013656	AAGTC	2	10	135475	135484	40 %	20 %	20 %	20 %	281490626
99	NC_013656	GAGTA	2	10	136229	136238	40 %	20 %	40 %	0 %	281490627
100	NC_013656	CAAAA	2	10	137028	137037	80 %	0 %	0 %	20 %	281490628
101	NC_013656	TTATT	2	10	139543	139552	20 %	80 %	0 %	0 %	281490631
102	NC_013656	AAAAT	2	10	139735	139744	80 %	20 %	0 %	0 %	281490631
103	NC_013656	TATCT	2	10	140103	140112	20 %	60 %	0 %	20 %	281490632
104	NC_013656	AAAAT	2	10	141062	141071	80 %	20 %	0 %	0 %	281490633
105	NC_013656	TAAAA	2	10	141162	141171	80 %	20 %	0 %	0 %	281490633
106	NC_013656	TGCGG	2	10	141766	141775	0 %	20 %	60 %	20 %	281490633
107	NC_013656	GAAAA	2	10	141846	141855	80 %	0 %	20 %	0 %	281490633
108	NC_013656	TTTTA	2	10	144373	144382	20 %	80 %	0 %	0 %	281490635
109	NC_013656	TTTTA	2	10	145677	145686	20 %	80 %	0 %	0 %	281490637
110	NC_013656	AACAA	2	10	146505	146514	80 %	0 %	0 %	20 %	281490637
111	NC_013656	AAGTC	2	10	148065	148074	40 %	20 %	20 %	20 %	281490639
112	NC_013656	TGTTT	2	10	149354	149363	0 %	80 %	20 %	0 %	281490640
113	NC_013656	CTTTC	2	10	152791	152800	0 %	60 %	0 %	40 %	281490645
114	NC_013656	TGTCA	2	10	153885	153894	20 %	40 %	20 %	20 %	281490646
115	NC_013656	TTTAT	2	10	153901	153910	20 %	80 %	0 %	0 %	281490646
116	NC_013656	TAATT	2	10	155438	155447	40 %	60 %	0 %	0 %	281490647
117	NC_013656	ACGGA	2	10	160427	160436	40 %	0 %	40 %	20 %	281490652
118	NC_013656	TGGTT	2	10	161256	161265	0 %	60 %	40 %	0 %	281490652
119	NC_013656	TGAAA	2	10	163580	163589	60 %	20 %	20 %	0 %	281490654
120	NC_013656	AATTT	2	10	165269	165278	40 %	60 %	0 %	0 %	281490656
121	NC_013656	TCTTT	2	10	166137	166146	0 %	80 %	0 %	20 %	281490657
122	NC_013656	CCAAA	2	10	170237	170246	60 %	0 %	0 %	40 %	281490661
123	NC_013656	TTCTC	2	10	170937	170946	0 %	60 %	0 %	40 %	281490661
124	NC_013656	TTGGC	2	10	171717	171726	0 %	40 %	40 %	20 %	281490663
125	NC_013656	GTAAA	2	10	172436	172445	60 %	20 %	20 %	0 %	281490664
126	NC_013656	AAATT	2	10	173588	173597	60 %	40 %	0 %	0 %	281490665
127	NC_013656	ATTCG	2	10	177041	177050	20 %	40 %	20 %	20 %	281490668
128	NC_013656	ATTTT	2	10	178568	178577	20 %	80 %	0 %	0 %	281490670
129	NC_013656	TCACA	2	10	178962	178971	40 %	20 %	0 %	40 %	281490670
130	NC_013656	TTGGT	2	10	180109	180118	0 %	60 %	40 %	0 %	281490671
131	NC_013656	CAAGA	2	10	181273	181282	60 %	0 %	20 %	20 %	281490672
132	NC_013656	AATTG	2	10	181703	181712	40 %	40 %	20 %	0 %	281490673
133	NC_013656	ACAAT	2	10	184279	184288	60 %	20 %	0 %	20 %	281490676
134	NC_013656	AAATA	2	10	185440	185449	80 %	20 %	0 %	0 %	281490676
135	NC_013656	TCGAT	2	10	185511	185520	20 %	40 %	20 %	20 %	281490676
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263	NC_013656	AAAAT	2	10	375368	375377	80 %	20 %	0 %	0 %	281490875
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