MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	GGCGCT	2	12	594	605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	281427818
2	NC_013655	CAGGTG	2	12	625	636	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281427818
3	NC_013655	GTGGCG	2	12	715	726	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	281427818
4	NC_013655	GCCGGA	2	12	966	977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	281427818
5	NC_013655	CACTGG	2	12	2360	2371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	281427819
6	NC_013655	TGGCAG	2	12	3036	3047	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281427820
7	NC_013655	CTCTGA	2	12	3875	3886	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281427822
8	NC_013655	CTCTGA	2	12	3893	3904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281427822
9	NC_013655	TGGAAA	2	12	15666	15677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	281427843
10	NC_013655	GTCAAC	2	12	25063	25074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281427855
11	NC_013655	TCTGTT	2	12	25322	25333	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	281427856
12	NC_013655	GATTAT	2	12	25491	25502	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281427857
13	NC_013655	GGCAGG	2	12	25961	25972	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	281427858
14	NC_013655	ACAGTT	2	12	27955	27966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281427859
15	NC_013655	TTGGTG	2	12	29101	29112	0 %	50 %	50 %	0 %	281427859
16	NC_013655	AGTTTA	2	12	30205	30216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281427860
17	NC_013655	TCCACT	2	12	32786	32797	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	281427864
18	NC_013655	GCTGAT	2	12	33091	33102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281427865
19	NC_013655	GGCGGA	2	12	34659	34670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	281427866
20	NC_013655	ATGTGG	2	12	39722	39733	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	281427868
21	NC_013655	TGGGGC	2	12	40028	40039	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	281427868
22	NC_013655	TGCCCT	2	12	40821	40832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	281427868
23	NC_013655	AACACG	2	12	42269	42280	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	281427869
24	NC_013655	TGGGGA	2	12	42536	42547	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	281427869
25	NC_013655	GTAACT	2	12	48039	48050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281427877
26	NC_013655	TCCGCC	2	12	49510	49521	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	281427878
27	NC_013655	CATCAG	2	12	51077	51088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281427879
28	NC_013655	AGTGGA	2	12	51383	51394	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	281427880
29	NC_013655	GAGATG	2	12	57663	57674	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	281427886
30	NC_013655	GCGAAG	2	12	58210	58221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	281427886
31	NC_013655	CTGGCG	2	12	60422	60433	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	281427888
32	NC_013655	CTGCGT	2	12	62414	62425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427890
33	NC_013655	TTCTGG	2	12	63635	63646	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	281427891
34	NC_013655	TCAAAA	2	12	84691	84702	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	281427918
35	NC_013655	GCACCT	2	12	85931	85942	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	281427920
36	NC_013655	CAGGAG	2	12	86778	86789	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	281427921
37	NC_013655	TAAGAA	2	12	90216	90227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281427925
38	NC_013655	TGCCTA	2	12	93209	93220	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281427927
39	NC_013655	AATAAA	2	12	94634	94645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	281427928
40	NC_013655	TATCCA	2	12	97698	97709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427930
41	NC_013655	GTGTCA	2	12	97896	97907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281427930
42	NC_013655	GACAGC	2	12	102097	102108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427934
43	NC_013655	GGAAAA	2	12	105674	105685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427940
44	NC_013655	AACTTA	2	12	109055	109066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	281427946
45	NC_013655	ACCGGA	2	12	115359	115370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427955
46	NC_013655	TCAGCA	2	12	119495	119506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281427962
47	NC_013655	TACCGC	2	12	119925	119936	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	281427962
48	NC_013655	CTGCTA	5	30	120804	120833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281427964

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.