MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	ACTGA	2	10	2020	2029	40 %	20 %	20 %	20 %	281427819
2	NC_013655	ATCAC	2	10	3834	3843	40 %	20 %	0 %	40 %	281427822
3	NC_013655	GGCGG	2	10	3972	3981	0 %	0 %	80 %	20 %	281427822
4	NC_013655	AGGGA	2	10	5181	5190	40 %	0 %	60 %	0 %	281427825
5	NC_013655	GTGAT	2	10	6844	6853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013655	CGATT	2	10	6890	6899	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013655	CCGTG	2	10	10486	10495	0 %	20 %	40 %	40 %	281427833
8	NC_013655	AAATG	2	10	12429	12438	60 %	20 %	20 %	0 %	281427835
9	NC_013655	TCAGT	2	10	13481	13490	20 %	40 %	20 %	20 %	281427838
10	NC_013655	ATTCT	2	10	14024	14033	20 %	60 %	0 %	20 %	281427840
11	NC_013655	ATGCA	2	10	14390	14399	40 %	20 %	20 %	20 %	281427840
12	NC_013655	ATGAA	2	10	14790	14799	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013655	TCTGA	2	10	15827	15836	20 %	40 %	20 %	20 %	281427843
14	NC_013655	GAAGC	2	10	18775	18784	40 %	0 %	40 %	20 %	281427845
15	NC_013655	TGTTC	2	10	19402	19411	0 %	60 %	20 %	20 %	281427846
16	NC_013655	AGTCC	2	10	19467	19476	20 %	20 %	20 %	40 %	281427846
17	NC_013655	GTGCT	2	10	19841	19850	0 %	40 %	40 %	20 %	281427847
18	NC_013655	CAGAA	2	10	24780	24789	60 %	0 %	20 %	20 %	281427855
19	NC_013655	GCTGG	2	10	27359	27368	0 %	20 %	60 %	20 %	281427859
20	NC_013655	GCAGT	2	10	28960	28969	20 %	20 %	40 %	20 %	281427859
21	NC_013655	TCGCA	2	10	33318	33327	20 %	20 %	20 %	40 %	281427866
22	NC_013655	CACGG	2	10	35393	35402	20 %	0 %	40 %	40 %	281427867
23	NC_013655	GTGCT	2	10	35844	35853	0 %	40 %	40 %	20 %	281427867
24	NC_013655	GCTGG	2	10	37061	37070	0 %	20 %	60 %	20 %	281427868
25	NC_013655	GACCT	2	10	37207	37216	20 %	20 %	20 %	40 %	281427868
26	NC_013655	ACCGG	2	10	38685	38694	20 %	0 %	40 %	40 %	281427868
27	NC_013655	ACCGG	2	10	41385	41394	20 %	0 %	40 %	40 %	281427868
28	NC_013655	GCCGT	2	10	41456	41465	0 %	20 %	40 %	40 %	281427868
29	NC_013655	ACCTG	2	10	41994	42003	20 %	20 %	20 %	40 %	281427868
30	NC_013655	TCTGG	2	10	42331	42340	0 %	40 %	40 %	20 %	281427869
31	NC_013655	CCGGG	2	10	45488	45497	0 %	0 %	60 %	40 %	281427873
32	NC_013655	AAAAC	2	10	45684	45693	80 %	0 %	0 %	20 %	281427874
33	NC_013655	TGCGA	2	10	50853	50862	20 %	20 %	40 %	20 %	281427878
34	NC_013655	CCTGT	2	10	53639	53648	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013655	GCCCC	2	10	53794	53803	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
36	NC_013655	TGCTC	2	10	54794	54803	0 %	40 %	20 %	40 %	281427883
37	NC_013655	AGGCC	2	10	54983	54992	20 %	0 %	40 %	40 %	281427883
38	NC_013655	GCTGC	2	10	61285	61294	0 %	20 %	40 %	40 %	281427889
39	NC_013655	CCCGG	2	10	62325	62334	0 %	0 %	40 %	60 %	281427889
40	NC_013655	TTGTT	2	10	66412	66421	0 %	80 %	20 %	0 %	281427896
41	NC_013655	TATTT	2	10	69699	69708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013655	GTGTA	2	10	71089	71098	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013655	GAAAA	2	10	73368	73377	80 %	0 %	20 %	0 %	281427906
44	NC_013655	AATTT	2	10	73849	73858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013655	CAGAC	2	10	74774	74783	40 %	0 %	20 %	40 %	281427907
46	NC_013655	TAACG	2	10	74906	74915	40 %	20 %	20 %	20 %	281427907
47	NC_013655	TTCAG	2	10	75353	75362	20 %	40 %	20 %	20 %	281427907
48	NC_013655	CAGAG	2	10	80528	80537	40 %	0 %	40 %	20 %	281427912
49	NC_013655	TCAGT	2	10	80650	80659	20 %	40 %	20 %	20 %	281427912
50	NC_013655	AACAA	2	10	82782	82791	80 %	0 %	0 %	20 %	281427916
51	NC_013655	CGTGT	2	10	83841	83850	0 %	40 %	40 %	20 %	281427916
52	NC_013655	TACTG	2	10	83998	84007	20 %	40 %	20 %	20 %	281427916
53	NC_013655	GGCAA	2	10	84016	84025	40 %	0 %	40 %	20 %	281427916
54	NC_013655	TACTC	2	10	84220	84229	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_013655	GTTCG	2	10	86796	86805	0 %	40 %	40 %	20 %	281427921
56	NC_013655	AAGGT	2	10	87145	87154	40 %	20 %	40 %	0 %	281427921
57	NC_013655	AGCGC	2	10	87545	87554	20 %	0 %	40 %	40 %	281427922
58	NC_013655	TCAAA	2	10	88183	88192	60 %	20 %	0 %	20 %	281427922
59	NC_013655	GGCTG	2	10	88677	88686	0 %	20 %	60 %	20 %	281427923
60	NC_013655	CAGGG	2	10	88977	88986	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013655	ATCCC	2	10	90182	90191	20 %	20 %	0 %	60 %	281427925
62	NC_013655	TAACT	2	10	90744	90753	40 %	40 %	0 %	20 %	281427925
63	NC_013655	CTGTG	2	10	91219	91228	0 %	40 %	40 %	20 %	281427925
64	NC_013655	TCTAT	2	10	92961	92970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013655	TAAAA	2	10	93467	93476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013655	CAAGT	2	10	94053	94062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013655	CATAA	3	15	95577	95591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013655	CATAA	2	10	96757	96766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013655	AAGGA	2	10	99058	99067	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013655	GTAAT	2	10	99333	99342	40 %	40 %	20 %	0 %	281427932
71	NC_013655	TCAGC	2	10	99813	99822	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013655	TACCA	2	10	100050	100059	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013655	CTTCC	2	10	104363	104372	0 %	40 %	0 %	60 %	281427938
74	NC_013655	ATGTG	2	10	104470	104479	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013655	TGATG	2	10	105113	105122	20 %	40 %	40 %	0 %	281427939
76	NC_013655	GTTCA	2	10	106184	106193	20 %	40 %	20 %	20 %	281427941
77	NC_013655	CGTAC	2	10	106646	106655	20 %	20 %	20 %	40 %	281427942
78	NC_013655	CTTTT	2	10	108023	108032	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013655	AGTTA	2	10	108446	108455	40 %	40 %	20 %	0 %	281427945
80	NC_013655	CTGTT	2	10	108834	108843	0 %	60 %	20 %	20 %	281427946
81	NC_013655	ATGTG	2	10	109686	109695	20 %	40 %	40 %	0 %	281427946
82	NC_013655	AATGC	2	10	109750	109759	40 %	20 %	20 %	20 %	281427946
83	NC_013655	ACCTT	2	10	112429	112438	20 %	40 %	0 %	40 %	281427950
84	NC_013655	CGCGG	2	10	113444	113453	0 %	0 %	60 %	40 %	281427951
85	NC_013655	ACGGG	2	10	113495	113504	20 %	0 %	60 %	20 %	281427951
86	NC_013655	CCGGC	2	10	114108	114117	0 %	0 %	40 %	60 %	281427952
87	NC_013655	GCTGG	2	10	114140	114149	0 %	20 %	60 %	20 %	281427952
88	NC_013655	CGCCA	2	10	115170	115179	20 %	0 %	20 %	60 %	281427955
89	NC_013655	CCGCC	2	10	115806	115815	0 %	0 %	20 %	80 %	281427955
90	NC_013655	AAGGT	2	10	116101	116110	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013655	GGCAC	2	10	116274	116283	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_013655	ACCGT	2	10	116564	116573	20 %	20 %	20 %	40 %	281427956
93	NC_013655	TGTAC	2	10	116799	116808	20 %	40 %	20 %	20 %	281427957
94	NC_013655	ATGTT	2	10	117552	117561	20 %	60 %	20 %	0 %	281427959
95	NC_013655	GGCGG	2	10	117636	117645	0 %	0 %	80 %	20 %	281427959
96	NC_013655	CCGGG	2	10	118854	118863	0 %	0 %	60 %	40 %	281427962
97	NC_013655	GGCGG	2	10	120913	120922	0 %	0 %	80 %	20 %	281427964

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.