MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	GTGAT	2	10	6844	6853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013655	CGATT	2	10	6890	6899	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013655	ATGAA	2	10	14790	14799	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013655	CCTGT	2	10	53639	53648	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013655	GCCCC	2	10	53794	53803	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6	NC_013655	TATTT	2	10	69699	69708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013655	GTGTA	2	10	71089	71098	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013655	AATTT	2	10	73849	73858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013655	TACTC	2	10	84220	84229	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013655	CAGGG	2	10	88977	88986	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013655	TCTAT	2	10	92961	92970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013655	TAAAA	2	10	93467	93476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013655	CAAGT	2	10	94053	94062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013655	CATAA	3	15	95577	95591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013655	CATAA	2	10	96757	96766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013655	AAGGA	2	10	99058	99067	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013655	TCAGC	2	10	99813	99822	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013655	TACCA	2	10	100050	100059	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013655	ATGTG	2	10	104470	104479	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013655	CTTTT	2	10	108023	108032	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013655	AAGGT	2	10	116101	116110	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013655	GGCAC	2	10	116274	116283	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.