MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	ACTGA	2	10	2020	2029	40 %	20 %	20 %	20 %	281427819
2	NC_013655	ATCAC	2	10	3834	3843	40 %	20 %	0 %	40 %	281427822
3	NC_013655	GGCGG	2	10	3972	3981	0 %	0 %	80 %	20 %	281427822
4	NC_013655	AGGGA	2	10	5181	5190	40 %	0 %	60 %	0 %	281427825
5	NC_013655	CCGTG	2	10	10486	10495	0 %	20 %	40 %	40 %	281427833
6	NC_013655	AAATG	2	10	12429	12438	60 %	20 %	20 %	0 %	281427835
7	NC_013655	TCAGT	2	10	13481	13490	20 %	40 %	20 %	20 %	281427838
8	NC_013655	ATTCT	2	10	14024	14033	20 %	60 %	0 %	20 %	281427840
9	NC_013655	ATGCA	2	10	14390	14399	40 %	20 %	20 %	20 %	281427840
10	NC_013655	TCTGA	2	10	15827	15836	20 %	40 %	20 %	20 %	281427843
11	NC_013655	GAAGC	2	10	18775	18784	40 %	0 %	40 %	20 %	281427845
12	NC_013655	TGTTC	2	10	19402	19411	0 %	60 %	20 %	20 %	281427846
13	NC_013655	AGTCC	2	10	19467	19476	20 %	20 %	20 %	40 %	281427846
14	NC_013655	GTGCT	2	10	19841	19850	0 %	40 %	40 %	20 %	281427847
15	NC_013655	CAGAA	2	10	24780	24789	60 %	0 %	20 %	20 %	281427855
16	NC_013655	GCTGG	2	10	27359	27368	0 %	20 %	60 %	20 %	281427859
17	NC_013655	GCAGT	2	10	28960	28969	20 %	20 %	40 %	20 %	281427859
18	NC_013655	TCGCA	2	10	33318	33327	20 %	20 %	20 %	40 %	281427866
19	NC_013655	CACGG	2	10	35393	35402	20 %	0 %	40 %	40 %	281427867
20	NC_013655	GTGCT	2	10	35844	35853	0 %	40 %	40 %	20 %	281427867
21	NC_013655	GCTGG	2	10	37061	37070	0 %	20 %	60 %	20 %	281427868
22	NC_013655	GACCT	2	10	37207	37216	20 %	20 %	20 %	40 %	281427868
23	NC_013655	ACCGG	2	10	38685	38694	20 %	0 %	40 %	40 %	281427868
24	NC_013655	ACCGG	2	10	41385	41394	20 %	0 %	40 %	40 %	281427868
25	NC_013655	GCCGT	2	10	41456	41465	0 %	20 %	40 %	40 %	281427868
26	NC_013655	ACCTG	2	10	41994	42003	20 %	20 %	20 %	40 %	281427868
27	NC_013655	TCTGG	2	10	42331	42340	0 %	40 %	40 %	20 %	281427869
28	NC_013655	CCGGG	2	10	45488	45497	0 %	0 %	60 %	40 %	281427873
29	NC_013655	AAAAC	2	10	45684	45693	80 %	0 %	0 %	20 %	281427874
30	NC_013655	TGCGA	2	10	50853	50862	20 %	20 %	40 %	20 %	281427878
31	NC_013655	TGCTC	2	10	54794	54803	0 %	40 %	20 %	40 %	281427883
32	NC_013655	AGGCC	2	10	54983	54992	20 %	0 %	40 %	40 %	281427883
33	NC_013655	GCTGC	2	10	61285	61294	0 %	20 %	40 %	40 %	281427889
34	NC_013655	CCCGG	2	10	62325	62334	0 %	0 %	40 %	60 %	281427889
35	NC_013655	TTGTT	2	10	66412	66421	0 %	80 %	20 %	0 %	281427896
36	NC_013655	GAAAA	2	10	73368	73377	80 %	0 %	20 %	0 %	281427906
37	NC_013655	CAGAC	2	10	74774	74783	40 %	0 %	20 %	40 %	281427907
38	NC_013655	TAACG	2	10	74906	74915	40 %	20 %	20 %	20 %	281427907
39	NC_013655	TTCAG	2	10	75353	75362	20 %	40 %	20 %	20 %	281427907
40	NC_013655	CAGAG	2	10	80528	80537	40 %	0 %	40 %	20 %	281427912
41	NC_013655	TCAGT	2	10	80650	80659	20 %	40 %	20 %	20 %	281427912
42	NC_013655	AACAA	2	10	82782	82791	80 %	0 %	0 %	20 %	281427916
43	NC_013655	CGTGT	2	10	83841	83850	0 %	40 %	40 %	20 %	281427916
44	NC_013655	TACTG	2	10	83998	84007	20 %	40 %	20 %	20 %	281427916
45	NC_013655	GGCAA	2	10	84016	84025	40 %	0 %	40 %	20 %	281427916
46	NC_013655	GTTCG	2	10	86796	86805	0 %	40 %	40 %	20 %	281427921
47	NC_013655	AAGGT	2	10	87145	87154	40 %	20 %	40 %	0 %	281427921
48	NC_013655	AGCGC	2	10	87545	87554	20 %	0 %	40 %	40 %	281427922
49	NC_013655	TCAAA	2	10	88183	88192	60 %	20 %	0 %	20 %	281427922
50	NC_013655	GGCTG	2	10	88677	88686	0 %	20 %	60 %	20 %	281427923
51	NC_013655	ATCCC	2	10	90182	90191	20 %	20 %	0 %	60 %	281427925
52	NC_013655	TAACT	2	10	90744	90753	40 %	40 %	0 %	20 %	281427925
53	NC_013655	CTGTG	2	10	91219	91228	0 %	40 %	40 %	20 %	281427925
54	NC_013655	GTAAT	2	10	99333	99342	40 %	40 %	20 %	0 %	281427932
55	NC_013655	CTTCC	2	10	104363	104372	0 %	40 %	0 %	60 %	281427938
56	NC_013655	TGATG	2	10	105113	105122	20 %	40 %	40 %	0 %	281427939
57	NC_013655	GTTCA	2	10	106184	106193	20 %	40 %	20 %	20 %	281427941
58	NC_013655	CGTAC	2	10	106646	106655	20 %	20 %	20 %	40 %	281427942
59	NC_013655	AGTTA	2	10	108446	108455	40 %	40 %	20 %	0 %	281427945
60	NC_013655	CTGTT	2	10	108834	108843	0 %	60 %	20 %	20 %	281427946
61	NC_013655	ATGTG	2	10	109686	109695	20 %	40 %	40 %	0 %	281427946
62	NC_013655	AATGC	2	10	109750	109759	40 %	20 %	20 %	20 %	281427946
63	NC_013655	ACCTT	2	10	112429	112438	20 %	40 %	0 %	40 %	281427950
64	NC_013655	CGCGG	2	10	113444	113453	0 %	0 %	60 %	40 %	281427951
65	NC_013655	ACGGG	2	10	113495	113504	20 %	0 %	60 %	20 %	281427951
66	NC_013655	CCGGC	2	10	114108	114117	0 %	0 %	40 %	60 %	281427952
67	NC_013655	GCTGG	2	10	114140	114149	0 %	20 %	60 %	20 %	281427952
68	NC_013655	CGCCA	2	10	115170	115179	20 %	0 %	20 %	60 %	281427955
69	NC_013655	CCGCC	2	10	115806	115815	0 %	0 %	20 %	80 %	281427955
70	NC_013655	ACCGT	2	10	116564	116573	20 %	20 %	20 %	40 %	281427956
71	NC_013655	TGTAC	2	10	116799	116808	20 %	40 %	20 %	20 %	281427957
72	NC_013655	ATGTT	2	10	117552	117561	20 %	60 %	20 %	0 %	281427959
73	NC_013655	GGCGG	2	10	117636	117645	0 %	0 %	80 %	20 %	281427959
74	NC_013655	CCGGG	2	10	118854	118863	0 %	0 %	60 %	40 %	281427962
75	NC_013655	GGCGG	2	10	120913	120922	0 %	0 %	80 %	20 %	281427964

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.