MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	CCG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013655	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013655	CAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013655	ATG	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013655	GGT	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013655	GCT	2	6	3676	3681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013655	GGT	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013655	AAC	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013655	GCG	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013655	GCG	2	6	4177	4182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013655	GTT	2	6	4194	4199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013655	GAT	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013655	TGA	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013655	TTG	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013655	TGT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013655	TAT	2	6	5784	5789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013655	TTC	2	6	5792	5797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013655	GTC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013655	AGG	2	6	5887	5892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013655	AAT	2	6	6575	6580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013655	TGG	2	6	6612	6617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013655	CAC	2	6	6622	6627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013655	CAC	2	6	6634	6639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013655	AAT	2	6	6699	6704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013655	TAA	3	9	6797	6805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013655	AAC	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013655	TGC	2	6	6855	6860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013655	TGA	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013655	TTA	2	6	8298	8303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013655	CGG	2	6	13681	13686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013655	GGA	2	6	13769	13774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013655	ATA	2	6	14539	14544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013655	ATA	2	6	24347	24352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013655	TAT	2	6	30526	30531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013655	AGG	2	6	31301	31306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013655	CCT	2	6	31320	31325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013655	CAT	2	6	32238	32243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013655	TAA	2	6	43035	43040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013655	ACA	2	6	43041	43046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013655	AGT	2	6	43975	43980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013655	GGA	2	6	43992	43997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013655	CCT	2	6	44591	44596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_013655	AGG	2	6	44606	44611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013655	CTT	2	6	44637	44642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013655	AGA	2	6	44654	44659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013655	TTA	2	6	49163	49168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013655	CGG	2	6	51750	51755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013655	GTA	2	6	51833	51838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013655	GAG	2	6	51870	51875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013655	CTT	2	6	52151	52156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013655	CGA	2	6	52301	52306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013655	AGA	2	6	52307	52312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013655	CAA	2	6	52342	52347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013655	CTT	2	6	52394	52399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013655	CCT	2	6	53305	53310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013655	AAT	2	6	53314	53319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013655	GGA	2	6	53332	53337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013655	CAC	2	6	53377	53382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013655	TCA	2	6	53398	53403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013655	ACT	2	6	53597	53602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013655	GCG	2	6	53679	53684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013655	ACA	2	6	53710	53715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013655	CTC	2	6	53774	53779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_013655	TGT	2	6	53843	53848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013655	TCG	2	6	53962	53967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013655	CGG	2	6	54082	54087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013655	ACA	2	6	54110	54115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013655	GCC	2	6	54120	54125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013655	CAC	2	6	54228	54233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013655	GGT	2	6	54237	54242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013655	GGT	2	6	54310	54315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013655	ATC	2	6	54325	54330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013655	AAT	2	6	55117	55122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013655	CAT	2	6	55222	55227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013655	CGA	2	6	55231	55236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013655	GAT	2	6	55237	55242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013655	GGT	2	6	55276	55281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013655	TGC	2	6	55894	55899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013655	TTA	2	6	55917	55922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013655	AAT	2	6	56857	56862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013655	TCA	2	6	56974	56979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013655	TGA	2	6	56985	56990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013655	GTC	2	6	57009	57014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013655	ATA	2	6	57065	57070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013655	GTT	2	6	59056	59061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013655	AGG	2	6	59631	59636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013655	CCG	2	6	59693	59698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013655	ACG	2	6	64672	64677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013655	TCT	2	6	65207	65212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013655	AAC	2	6	65283	65288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013655	CCA	2	6	66058	66063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013655	ACT	2	6	66680	66685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013655	GAG	2	6	66782	66787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013655	GCT	2	6	66858	66863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013655	TCC	2	6	66929	66934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013655	GTG	2	6	66962	66967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013655	TTC	2	6	67006	67011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013655	ATC	2	6	67037	67042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013655	TTG	2	6	67151	67156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013655	ATG	2	6	69239	69244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013655	ATT	3	9	69272	69280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013655	TGT	2	6	69296	69301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013655	TTA	2	6	69788	69793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013655	GTT	2	6	69869	69874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013655	GTG	2	6	69995	70000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013655	TTC	2	6	70119	70124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013655	TAT	2	6	70181	70186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013655	TCT	2	6	70274	70279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013655	AAT	2	6	70286	70291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013655	ATT	2	6	70303	70308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013655	GCT	2	6	70344	70349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013655	ATT	2	6	70354	70359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013655	CAG	2	6	70453	70458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013655	GAA	2	6	70507	70512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013655	ATT	2	6	70613	70618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013655	GGT	2	6	70711	70716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013655	AAT	2	6	70787	70792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013655	TTC	2	6	71863	71868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013655	ATA	2	6	72014	72019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013655	TTG	2	6	72055	72060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013655	TTA	2	6	73956	73961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013655	CGC	2	6	77585	77590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_013655	AAT	2	6	77659	77664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013655	ATT	2	6	77745	77750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013655	AGT	2	6	77752	77757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013655	ATT	2	6	77850	77855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013655	CAG	2	6	77907	77912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013655	CTG	2	6	78674	78679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013655	AAT	2	6	81114	81119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013655	GTC	2	6	81144	81149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013655	CAT	2	6	81186	81191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013655	GAA	2	6	81233	81238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013655	ATC	2	6	81265	81270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013655	GCA	2	6	81879	81884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013655	GCA	2	6	82338	82343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013655	CCT	2	6	82415	82420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013655	GTA	2	6	82516	82521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013655	GAG	2	6	84180	84185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013655	GTC	2	6	84245	84250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013655	TGG	2	6	84624	84629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013655	TGG	2	6	88283	88288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.