MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE15

Total Repeats: 3049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013654	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	387828055
2	NC_013654	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	387828056
3	NC_013654	CGCAG	2	10	8248	8257	20 %	0 %	40 %	40 %	387828061
4	NC_013654	GTGAA	2	10	8925	8934	40 %	20 %	40 %	0 %	387828061
5	NC_013654	CGTAC	2	10	9676	9685	20 %	20 %	20 %	40 %	387828062
6	NC_013654	CGCGC	2	10	10663	10672	0 %	0 %	40 %	60 %	387828064
7	NC_013654	GTTTC	2	10	11559	11568	0 %	60 %	20 %	20 %	387828065
8	NC_013654	CTGGA	2	10	17930	17939	20 %	20 %	40 %	20 %	387828071
9	NC_013654	AATGT	2	10	18342	18351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013654	ACCAC	2	10	18769	18778	40 %	0 %	0 %	60 %	387828072
11	NC_013654	TCCTT	2	10	19608	19617	0 %	60 %	0 %	40 %	387828072
12	NC_013654	CCAGA	2	10	24138	24147	40 %	0 %	20 %	40 %	387828075
13	NC_013654	GATGC	2	10	30865	30874	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013654	GCGAA	2	10	37984	37993	40 %	0 %	40 %	20 %	387828089
15	NC_013654	CCGTT	2	10	38878	38887	0 %	40 %	20 %	40 %	387828089
16	NC_013654	CACGG	2	10	39255	39264	20 %	0 %	40 %	40 %	387828089
17	NC_013654	GATGC	2	10	40246	40255	20 %	20 %	40 %	20 %	387828092
18	NC_013654	CGAAT	2	10	41997	42006	40 %	20 %	20 %	20 %	387828095
19	NC_013654	CCATG	2	10	43534	43543	20 %	20 %	20 %	40 %	387828096
20	NC_013654	CCGTA	2	10	45169	45178	20 %	20 %	20 %	40 %	387828097
21	NC_013654	TTAAA	2	10	45907	45916	60 %	40 %	0 %	0 %	387828097
22	NC_013654	ACCCA	2	10	46651	46660	40 %	0 %	0 %	60 %	387828098
23	NC_013654	TTTGA	2	10	48277	48286	20 %	60 %	20 %	0 %	387828099
24	NC_013654	CGGCG	2	10	48528	48537	0 %	0 %	60 %	40 %	387828099
25	NC_013654	AATCA	2	10	48810	48819	60 %	20 %	0 %	20 %	387828100
26	NC_013654	CAAAC	2	10	48896	48905	60 %	0 %	0 %	40 %	387828100
27	NC_013654	CGGTT	2	10	49765	49774	0 %	40 %	40 %	20 %	387828101
28	NC_013654	TGGCG	2	10	51457	51466	0 %	20 %	60 %	20 %	387828103
29	NC_013654	TGCAC	2	10	53219	53228	20 %	20 %	20 %	40 %	387828104
30	NC_013654	AACGT	2	10	57624	57633	40 %	20 %	20 %	20 %	387828110
31	NC_013654	GCGTC	2	10	60608	60617	0 %	20 %	40 %	40 %	387828113
32	NC_013654	ATGTT	2	10	61422	61431	20 %	60 %	20 %	0 %	387828114
33	NC_013654	TGCGT	2	10	62141	62150	0 %	40 %	40 %	20 %	387828114
34	NC_013654	AAAGT	2	10	67908	67917	60 %	20 %	20 %	0 %	387828117
35	NC_013654	GGTGA	2	10	70156	70165	20 %	20 %	60 %	0 %	387828118
36	NC_013654	CAGCG	2	10	71524	71533	20 %	0 %	40 %	40 %	387828120
37	NC_013654	TCGCG	2	10	72794	72803	0 %	20 %	40 %	40 %	387828120
38	NC_013654	TTTAT	2	10	75959	75968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013654	TCGCT	2	10	77243	77252	0 %	40 %	20 %	40 %	387828124
40	NC_013654	GCGAA	2	10	78960	78969	40 %	0 %	40 %	20 %	387828126
41	NC_013654	TTTTA	2	10	79657	79666	20 %	80 %	0 %	0 %	387828127
42	NC_013654	CAGCA	2	10	81788	81797	40 %	0 %	20 %	40 %	387828129
43	NC_013654	TGGTT	2	10	84703	84712	0 %	60 %	40 %	0 %	387828132
44	NC_013654	TAGTG	2	10	85733	85742	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013654	TTGCT	2	10	85885	85894	0 %	60 %	20 %	20 %	387828133
46	NC_013654	GATGG	2	10	86621	86630	20 %	20 %	60 %	0 %	387828133
47	NC_013654	ATTTT	2	10	87449	87458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013654	GGGAG	2	10	87613	87622	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013654	CGCCA	2	10	87677	87686	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_013654	ACCGG	2	10	88617	88626	20 %	0 %	40 %	40 %	387828135
51	NC_013654	CCTGG	2	10	88873	88882	0 %	20 %	40 %	40 %	387828135
52	NC_013654	ATGCG	2	10	90318	90327	20 %	20 %	40 %	20 %	387828136
53	NC_013654	ATGTT	2	10	93686	93695	20 %	60 %	20 %	0 %	387828139
54	NC_013654	AAAAC	2	10	94101	94110	80 %	0 %	0 %	20 %	387828139
55	NC_013654	TGCAT	2	10	94628	94637	20 %	40 %	20 %	20 %	387828140
56	NC_013654	ATTCC	2	10	94798	94807	20 %	40 %	0 %	40 %	387828140
57	NC_013654	AGTTC	2	10	99891	99900	20 %	40 %	20 %	20 %	387828145
58	NC_013654	TGCCT	2	10	99991	100000	0 %	40 %	20 %	40 %	387828146
59	NC_013654	CGTGG	2	10	101264	101273	0 %	20 %	60 %	20 %	387828147
60	NC_013654	TATCG	2	10	101771	101780	20 %	40 %	20 %	20 %	387828147
61	NC_013654	GGGCT	2	10	105643	105652	0 %	20 %	60 %	20 %	387828150
62	NC_013654	GCCTG	2	10	106103	106112	0 %	20 %	40 %	40 %	387828151
63	NC_013654	TCTGG	2	10	107350	107359	0 %	40 %	40 %	20 %	387828152
64	NC_013654	ACCGT	2	10	108016	108025	20 %	20 %	20 %	40 %	387828152
65	NC_013654	ATCAG	2	10	109789	109798	40 %	20 %	20 %	20 %	387828154
66	NC_013654	AGCCG	2	10	111557	111566	20 %	0 %	40 %	40 %	387828155
67	NC_013654	GCGCA	2	10	113885	113894	20 %	0 %	40 %	40 %	387828157
68	NC_013654	GCATC	2	10	120403	120412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013654	CGCGG	2	10	121054	121063	0 %	0 %	60 %	40 %	387828164
70	NC_013654	CATCG	2	10	123311	123320	20 %	20 %	20 %	40 %	387828167
71	NC_013654	TAACG	2	10	124005	124014	40 %	20 %	20 %	20 %	387828167
72	NC_013654	AATGC	2	10	125747	125756	40 %	20 %	20 %	20 %	387828168
73	NC_013654	TCTGT	2	10	126694	126703	0 %	60 %	20 %	20 %	387828170
74	NC_013654	GCAGG	2	10	129126	129135	20 %	0 %	60 %	20 %	387828173
75	NC_013654	GTGTT	2	10	130335	130344	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013654	TCATT	2	10	134166	134175	20 %	60 %	0 %	20 %	387828177
77	NC_013654	AATTG	2	10	135190	135199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013654	CGAAG	2	10	135643	135652	40 %	0 %	40 %	20 %	387828179
79	NC_013654	ACACG	2	10	135776	135785	40 %	0 %	20 %	40 %	387828179
80	NC_013654	TCGCG	2	10	136037	136046	0 %	20 %	40 %	40 %	387828179
81	NC_013654	GCATC	2	10	136127	136136	20 %	20 %	20 %	40 %	387828179
82	NC_013654	GACTG	2	10	137445	137454	20 %	20 %	40 %	20 %	387828180
83	NC_013654	AGAGC	2	10	137855	137864	40 %	0 %	40 %	20 %	387828180
84	NC_013654	TCTGG	2	10	146319	146328	0 %	40 %	40 %	20 %	387828184
85	NC_013654	GGGCA	2	10	147730	147739	20 %	0 %	60 %	20 %	387828185
86	NC_013654	CAGCG	2	10	148009	148018	20 %	0 %	40 %	40 %	387828186
87	NC_013654	GCGCG	2	10	154048	154057	0 %	0 %	60 %	40 %	387828190
88	NC_013654	CCGTC	2	10	154839	154848	0 %	20 %	20 %	60 %	387828191
89	NC_013654	GTGAA	2	10	154849	154858	40 %	20 %	40 %	0 %	387828191
90	NC_013654	GGCAT	2	10	155011	155020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013654	GTTCA	2	10	155236	155245	20 %	40 %	20 %	20 %	387828192
92	NC_013654	ATCCA	2	10	155562	155571	40 %	20 %	0 %	40 %	387828192
93	NC_013654	GTAAG	2	10	155775	155784	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013654	CTTTA	2	10	156825	156834	20 %	60 %	0 %	20 %	387828194
95	NC_013654	TCCTC	2	10	157495	157504	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_013654	GGGAG	2	10	160690	160699	20 %	0 %	80 %	0 %	387828198
97	NC_013654	GCCAA	2	10	161311	161320	40 %	0 %	20 %	40 %	387828199
98	NC_013654	TGTGG	2	10	163811	163820	0 %	40 %	60 %	0 %	387828201
99	NC_013654	TTTGC	2	10	168878	168887	0 %	60 %	20 %	20 %	387828206
100	NC_013654	TGCTG	2	10	169939	169948	0 %	40 %	40 %	20 %	387828207
101	NC_013654	TGGGG	2	10	170462	170471	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013654	TCGGC	2	10	171755	171764	0 %	20 %	40 %	40 %	387828209
103	NC_013654	TGGCG	2	10	172179	172188	0 %	20 %	60 %	20 %	387828209
104	NC_013654	ACCAC	2	10	175083	175092	40 %	0 %	0 %	60 %	387828213
105	NC_013654	GGCGT	2	10	176786	176795	0 %	20 %	60 %	20 %	387828214
106	NC_013654	CGACG	2	10	177825	177834	20 %	0 %	40 %	40 %	387828214
107	NC_013654	TAAAA	2	10	180608	180617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013654	TCTAA	2	10	180696	180705	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013654	TGGAA	2	10	180770	180779	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013654	TCAAA	2	10	181527	181536	60 %	20 %	0 %	20 %	387828217
111	NC_013654	ACATC	2	10	183960	183969	40 %	20 %	0 %	40 %	387828218
112	NC_013654	CTTTC	2	10	186724	186733	0 %	60 %	0 %	40 %	387828220
113	NC_013654	GCAAA	2	10	187127	187136	60 %	0 %	20 %	20 %	387828220
114	NC_013654	TGGTT	2	10	187212	187221	0 %	60 %	40 %	0 %	387828220
115	NC_013654	TGGTC	2	10	189333	189342	0 %	40 %	40 %	20 %	387828222
116	NC_013654	TGGCG	2	10	190578	190587	0 %	20 %	60 %	20 %	387828223
117	NC_013654	CGGCG	2	10	191208	191217	0 %	0 %	60 %	40 %	387828223
118	NC_013654	TTCCA	2	10	191819	191828	20 %	40 %	0 %	40 %	387828223
119	NC_013654	ACATC	2	10	192103	192112	40 %	20 %	0 %	40 %	387828224
120	NC_013654	GACCG	2	10	192344	192353	20 %	0 %	40 %	40 %	387828224
121	NC_013654	GGTCC	2	10	196142	196151	0 %	20 %	40 %	40 %	387828228
122	NC_013654	ACGGG	2	10	198059	198068	20 %	0 %	60 %	20 %	387828230
123	NC_013654	TGCGC	2	10	199766	199775	0 %	20 %	40 %	40 %	387828231
124	NC_013654	GTGAT	2	10	200218	200227	20 %	40 %	40 %	0 %	387828231
125	NC_013654	GTGAT	2	10	200509	200518	20 %	40 %	40 %	0 %	387828231
126	NC_013654	TACGT	2	10	200754	200763	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013654	TGGCC	2	10	202444	202453	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_013654	GCCAG	2	10	204188	204197	20 %	0 %	40 %	40 %	387828235
129	NC_013654	GGCGT	2	10	205026	205035	0 %	20 %	60 %	20 %	387828235
130	NC_013654	GTTCT	2	10	205629	205638	0 %	60 %	20 %	20 %	387828235
131	NC_013654	CTGAA	2	10	207621	207630	40 %	20 %	20 %	20 %	387828237
132	NC_013654	AAGCG	2	10	207685	207694	40 %	0 %	40 %	20 %	387828237
133	NC_013654	TGGTG	2	10	209468	209477	0 %	40 %	60 %	0 %	387828239
134	NC_013654	TGCAC	2	10	209594	209603	20 %	20 %	20 %	40 %	387828239
135	NC_013654	TGCGC	2	10	209987	209996	0 %	20 %	40 %	40 %	387828239
136	NC_013654	GTCTG	2	10	210152	210161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013654	CATGG	2	10	211688	211697	20 %	20 %	40 %	20 %	387828241
138	NC_013654	CAGAT	2	10	212727	212736	40 %	20 %	20 %	20 %	387828242
139	NC_013654	ACTTT	2	10	212860	212869	20 %	60 %	0 %	20 %	387828242
140	NC_013654	GACGT	2	10	216780	216789	20 %	20 %	40 %	20 %	387828245
141	NC_013654	ATGCC	2	10	221175	221184	20 %	20 %	20 %	40 %	387828250
142	NC_013654	TGGCC	2	10	222501	222510	0 %	20 %	40 %	40 %	387828252
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144	NC_013654	GTAAC	2	10	223244	223253	40 %	20 %	20 %	20 %	387828252
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146	NC_013654	GGTGG	2	10	223981	223990	0 %	20 %	80 %	0 %	387828252
147	NC_013654	TGCGC	2	10	233335	233344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_013654	ACGGT	2	10	234991	235000	20 %	20 %	40 %	20 %	387828263
149	NC_013654	AGCTC	2	10	235679	235688	20 %	20 %	20 %	40 %	387828263
150	NC_013654	TGATT	2	10	237832	237841	20 %	60 %	20 %	0 %	387828266
151	NC_013654	CGGTT	2	10	240795	240804	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_013654	GGTGA	2	10	243109	243118	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013654	GTGAA	2	10	249669	249678	40 %	20 %	40 %	0 %	387828273
154	NC_013654	TAATT	2	10	249853	249862	40 %	60 %	0 %	0 %	387828273
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174	NC_013654	ACATT	2	10	288154	288163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_013654	GCAAT	2	10	289170	289179	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_013654	TTCTC	2	10	292152	292161	0 %	60 %	0 %	40 %	387828312
177	NC_013654	ACGCC	2	10	293595	293604	20 %	0 %	20 %	60 %	387828313
178	NC_013654	CGCAG	2	10	294057	294066	20 %	0 %	40 %	40 %	387828313
179	NC_013654	TGTGT	2	10	297012	297021	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013654	TGTTA	2	10	298120	298129	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013654	TTGAT	2	10	299009	299018	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013654	TCAAT	2	10	299329	299338	40 %	40 %	0 %	20 %	387828320
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196	NC_013654	AGGGT	2	10	310260	310269	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
197	NC_013654	TACCG	2	10	310550	310559	20 %	20 %	20 %	40 %	387828327
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201	NC_013654	AATGC	2	10	318777	318786	40 %	20 %	20 %	20 %	387828335
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244	NC_013654	CTTCT	2	10	388180	388189	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
245	NC_013654	ACGCA	2	10	389538	389547	40 %	0 %	20 %	40 %	387828395
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247	NC_013654	CGCTG	2	10	391104	391113	0 %	20 %	40 %	40 %	387828397
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249	NC_013654	CAACA	2	10	392355	392364	60 %	0 %	0 %	40 %	387828398
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251	NC_013654	TTTTC	2	10	394456	394465	0 %	80 %	0 %	20 %	387828400
252	NC_013654	TGCAG	2	10	396136	396145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
253	NC_013654	CAAAC	2	10	401285	401294	60 %	0 %	0 %	40 %	387828409
254	NC_013654	TCTTT	2	10	403179	403188	0 %	80 %	0 %	20 %	387828410
255	NC_013654	TCGCG	2	10	410806	410815	0 %	20 %	40 %	40 %	387828415
256	NC_013654	TCGCT	2	10	410909	410918	0 %	40 %	20 %	40 %	387828415
257	NC_013654	CAAAG	2	10	411405	411414	60 %	0 %	20 %	20 %	387828416
258	NC_013654	CCTGG	2	10	412777	412786	0 %	20 %	40 %	40 %	387828416
259	NC_013654	CACAT	2	10	413522	413531	40 %	20 %	0 %	40 %	387828417
260	NC_013654	TGGCG	2	10	417213	417222	0 %	20 %	60 %	20 %	387828421
261	NC_013654	AAGCG	2	10	417732	417741	40 %	0 %	40 %	20 %	387828421
262	NC_013654	CTTGC	2	10	417857	417866	0 %	40 %	20 %	40 %	387828421
263	NC_013654	TGACC	2	10	418933	418942	20 %	20 %	20 %	40 %	387828422
264	NC_013654	AGTTC	2	10	419906	419915	20 %	40 %	20 %	20 %	387828424
265	NC_013654	GTTTC	2	10	420833	420842	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_013654	CACTT	2	10	421480	421489	20 %	40 %	0 %	40 %	387828425
267	NC_013654	CTCGT	2	10	421754	421763	0 %	40 %	20 %	40 %	387828426
268	NC_013654	GCGAC	2	10	422688	422697	20 %	0 %	40 %	40 %	387828427
269	NC_013654	CTTTT	2	10	424309	424318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
270	NC_013654	GCGCT	2	10	425099	425108	0 %	20 %	40 %	40 %	387828430
271	NC_013654	GGAGT	2	10	426881	426890	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
272	NC_013654	AGCGT	2	10	427173	427182	20 %	20 %	40 %	20 %	387828433
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281	NC_013654	CCAGC	2	10	441608	441617	20 %	0 %	20 %	60 %	387828446
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284	NC_013654	CGTTC	2	10	446417	446426	0 %	40 %	20 %	40 %	387828452
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291	NC_013654	TGAGT	2	10	463794	463803	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
292	NC_013654	CAACA	2	10	464087	464096	60 %	0 %	0 %	40 %	387828467
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334	NC_013654	GATGC	2	10	539841	539850	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
335	NC_013654	GATGC	2	10	539941	539950	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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374	NC_013654	GTTAA	2	10	603160	603169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_013654	GGGTA	2	10	609800	609809	20 %	20 %	60 %	0 %	387828597
382	NC_013654	ATAGC	2	10	611044	611053	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
383	NC_013654	GCTTA	2	10	611317	611326	20 %	40 %	20 %	20 %	387828599
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393	NC_013654	CCAGA	2	10	626974	626983	40 %	0 %	20 %	40 %	387828614
394	NC_013654	ATTTG	2	10	629854	629863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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