MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter phage S1249

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013597	AAAAT	2	10	206	215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013597	ATCGA	2	10	737	746	40 %	20 %	20 %	20 %	273809545
3	NC_013597	CCATT	2	10	2427	2436	20 %	40 %	0 %	40 %	273809546
4	NC_013597	TGTCA	2	10	2689	2698	20 %	40 %	20 %	20 %	273809547
5	NC_013597	TTTTG	2	10	4800	4809	0 %	80 %	20 %	0 %	273809550
6	NC_013597	TTTGC	2	10	5392	5401	0 %	60 %	20 %	20 %	273809551
7	NC_013597	TGGTG	2	10	6736	6745	0 %	40 %	60 %	0 %	273809553
8	NC_013597	AATCA	2	10	8383	8392	60 %	20 %	0 %	20 %	273809555
9	NC_013597	AAACC	2	10	9282	9291	60 %	0 %	0 %	40 %	273809555
10	NC_013597	CTTTT	2	10	13373	13382	0 %	80 %	0 %	20 %	273809561
11	NC_013597	CTTTT	2	10	15603	15612	0 %	80 %	0 %	20 %	273809565
12	NC_013597	CGGAT	2	10	15615	15624	20 %	20 %	40 %	20 %	273809565
13	NC_013597	GCCAC	2	10	16654	16663	20 %	0 %	20 %	60 %	273809566
14	NC_013597	TATTT	2	10	21287	21296	20 %	80 %	0 %	0 %	273809570
15	NC_013597	AAATC	2	10	21306	21315	60 %	20 %	0 %	20 %	273809570
16	NC_013597	TTCGT	2	10	22146	22155	0 %	60 %	20 %	20 %	273809571
17	NC_013597	TTTTG	2	10	22409	22418	0 %	80 %	20 %	0 %	273809571
18	NC_013597	CCCAA	2	10	23763	23772	40 %	0 %	0 %	60 %	273809575
19	NC_013597	TTGCT	2	10	25587	25596	0 %	60 %	20 %	20 %	273809579
20	NC_013597	GTATT	2	10	26479	26488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013597	TTTTC	2	10	27445	27454	0 %	80 %	0 %	20 %	273809581
22	NC_013597	AAAAC	2	10	28079	28088	80 %	0 %	0 %	20 %	273809584
23	NC_013597	TAAGT	2	10	29038	29047	40 %	40 %	20 %	0 %	273809586
24	NC_013597	TTTGC	2	10	29677	29686	0 %	60 %	20 %	20 %	273809587
25	NC_013597	CGTTG	2	10	29774	29783	0 %	40 %	40 %	20 %	273809587
26	NC_013597	GTAAA	2	10	31836	31845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013597	TACTT	2	10	34476	34485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013597	GAAAA	2	10	36155	36164	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013597	TAATA	2	10	37410	37419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013597	TTCAA	2	10	37772	37781	40 %	40 %	0 %	20 %	273809598
31	NC_013597	CAAAC	2	10	38286	38295	60 %	0 %	0 %	40 %	273809598
32	NC_013597	CAAAA	2	10	38821	38830	80 %	0 %	0 %	20 %	273809600
33	NC_013597	AAATT	2	10	41213	41222	60 %	40 %	0 %	0 %	273809605
34	NC_013597	GTATC	2	10	41492	41501	20 %	40 %	20 %	20 %	273809605

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.