MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter phage S1249

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013597	ATCGA	2	10	737	746	40 %	20 %	20 %	20 %	273809545
2	NC_013597	CCATT	2	10	2427	2436	20 %	40 %	0 %	40 %	273809546
3	NC_013597	TGTCA	2	10	2689	2698	20 %	40 %	20 %	20 %	273809547
4	NC_013597	TTTTG	2	10	4800	4809	0 %	80 %	20 %	0 %	273809550
5	NC_013597	TTTGC	2	10	5392	5401	0 %	60 %	20 %	20 %	273809551
6	NC_013597	TGGTG	2	10	6736	6745	0 %	40 %	60 %	0 %	273809553
7	NC_013597	AATCA	2	10	8383	8392	60 %	20 %	0 %	20 %	273809555
8	NC_013597	AAACC	2	10	9282	9291	60 %	0 %	0 %	40 %	273809555
9	NC_013597	CTTTT	2	10	13373	13382	0 %	80 %	0 %	20 %	273809561
10	NC_013597	CTTTT	2	10	15603	15612	0 %	80 %	0 %	20 %	273809565
11	NC_013597	CGGAT	2	10	15615	15624	20 %	20 %	40 %	20 %	273809565
12	NC_013597	GCCAC	2	10	16654	16663	20 %	0 %	20 %	60 %	273809566
13	NC_013597	TATTT	2	10	21287	21296	20 %	80 %	0 %	0 %	273809570
14	NC_013597	AAATC	2	10	21306	21315	60 %	20 %	0 %	20 %	273809570
15	NC_013597	TTCGT	2	10	22146	22155	0 %	60 %	20 %	20 %	273809571
16	NC_013597	TTTTG	2	10	22409	22418	0 %	80 %	20 %	0 %	273809571
17	NC_013597	CCCAA	2	10	23763	23772	40 %	0 %	0 %	60 %	273809575
18	NC_013597	TTGCT	2	10	25587	25596	0 %	60 %	20 %	20 %	273809579
19	NC_013597	TTTTC	2	10	27445	27454	0 %	80 %	0 %	20 %	273809581
20	NC_013597	AAAAC	2	10	28079	28088	80 %	0 %	0 %	20 %	273809584
21	NC_013597	TAAGT	2	10	29038	29047	40 %	40 %	20 %	0 %	273809586
22	NC_013597	TTTGC	2	10	29677	29686	0 %	60 %	20 %	20 %	273809587
23	NC_013597	CGTTG	2	10	29774	29783	0 %	40 %	40 %	20 %	273809587
24	NC_013597	TTCAA	2	10	37772	37781	40 %	40 %	0 %	20 %	273809598
25	NC_013597	CAAAC	2	10	38286	38295	60 %	0 %	0 %	40 %	273809598
26	NC_013597	CAAAA	2	10	38821	38830	80 %	0 %	0 %	20 %	273809600
27	NC_013597	AAATT	2	10	41213	41222	60 %	40 %	0 %	0 %	273809605
28	NC_013597	GTATC	2	10	41492	41501	20 %	40 %	20 %	20 %	273809605

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.