MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 plasmid pSROS01

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013596	AGGGA	2	10	36	45	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013596	GCCGG	2	10	457	466	0 %	0 %	60 %	40 %	271972121
3	NC_013596	GCCAG	2	10	2140	2149	20 %	0 %	40 %	40 %	271972121
4	NC_013596	GGCCG	2	10	2327	2336	0 %	0 %	60 %	40 %	271972121
5	NC_013596	CGGGC	2	10	2788	2797	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013596	CGCGC	2	10	2814	2823	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_013596	GCCGG	2	10	4129	4138	0 %	0 %	60 %	40 %	271972123
8	NC_013596	CGGCG	2	10	5026	5035	0 %	0 %	60 %	40 %	271972123
9	NC_013596	GCGGT	2	10	5761	5770	0 %	20 %	60 %	20 %	271972124
10	NC_013596	CCGCG	2	10	7569	7578	0 %	0 %	40 %	60 %	271972129
11	NC_013596	ACGGG	2	10	8187	8196	20 %	0 %	60 %	20 %	271972130
12	NC_013596	GCGCT	2	10	8707	8716	0 %	20 %	40 %	40 %	271972130
13	NC_013596	GACGG	2	10	9605	9614	20 %	0 %	60 %	20 %	271972131
14	NC_013596	TGTTC	2	10	15507	15516	0 %	60 %	20 %	20 %	271972139
15	NC_013596	GCCCG	2	10	15585	15594	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_013596	GCCGT	2	10	16573	16582	0 %	20 %	40 %	40 %	271972141
17	NC_013596	GCCCG	2	10	17388	17397	0 %	0 %	40 %	60 %	271972142
18	NC_013596	TGACG	2	10	19187	19196	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013596	GCCGG	2	10	19921	19930	0 %	0 %	60 %	40 %	271972144
20	NC_013596	CTGGC	2	10	20410	20419	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013596	GCCCG	2	10	23244	23253	0 %	0 %	40 %	60 %	271972146
22	NC_013596	GCGCG	2	10	25074	25083	0 %	0 %	60 %	40 %	271972147
23	NC_013596	CAGGA	2	10	25807	25816	40 %	0 %	40 %	20 %	271972148

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.