MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 plasmid pSROS01

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013596	GCGG	2	8	710	717	0 %	0 %	75 %	25 %	271972121
2	NC_013596	GCGG	3	12	1693	1704	0 %	0 %	75 %	25 %	271972121
3	NC_013596	CGGT	2	8	1776	1783	0 %	25 %	50 %	25 %	271972121
4	NC_013596	GTGG	2	8	1796	1803	0 %	25 %	75 %	0 %	271972121
5	NC_013596	GCCA	2	8	1862	1869	25 %	0 %	25 %	50 %	271972121
6	NC_013596	GCCA	2	8	2373	2380	25 %	0 %	25 %	50 %	271972121
7	NC_013596	CCGG	2	8	2897	2904	0 %	0 %	50 %	50 %	271972122
8	NC_013596	GGGC	2	8	3692	3699	0 %	0 %	75 %	25 %	271972123
9	NC_013596	TCGG	2	8	4778	4785	0 %	25 %	50 %	25 %	271972123
10	NC_013596	GCCC	2	8	5077	5084	0 %	0 %	25 %	75 %	271972123
11	NC_013596	GCCG	2	8	5272	5279	0 %	0 %	50 %	50 %	271972123
12	NC_013596	CCGG	2	8	5464	5471	0 %	0 %	50 %	50 %	271972123
13	NC_013596	AAGG	2	8	5670	5677	50 %	0 %	50 %	0 %	271972124
14	NC_013596	CAGC	2	8	5733	5740	25 %	0 %	25 %	50 %	271972124
15	NC_013596	GGCG	2	8	5792	5799	0 %	0 %	75 %	25 %	271972124
16	NC_013596	CTTG	2	8	5927	5934	0 %	50 %	25 %	25 %	271972124
17	NC_013596	CCAG	2	8	6624	6631	25 %	0 %	25 %	50 %	271972126
18	NC_013596	CCGG	3	12	6798	6809	0 %	0 %	50 %	50 %	271972127
19	NC_013596	CCGG	2	8	6899	6906	0 %	0 %	50 %	50 %	271972127
20	NC_013596	GCAG	2	8	7067	7074	25 %	0 %	50 %	25 %	271972127
21	NC_013596	GCGG	2	8	7089	7096	0 %	0 %	75 %	25 %	271972127
22	NC_013596	CAGG	2	8	7109	7116	25 %	0 %	50 %	25 %	271972127
23	NC_013596	GGGC	2	8	7183	7190	0 %	0 %	75 %	25 %	271972128
24	NC_013596	CTGG	2	8	7397	7404	0 %	25 %	50 %	25 %	271972128
25	NC_013596	CCGG	2	8	7640	7647	0 %	0 %	50 %	50 %	271972129
26	NC_013596	CGGT	2	8	7787	7794	0 %	25 %	50 %	25 %	271972129
27	NC_013596	TCGA	2	8	8311	8318	25 %	25 %	25 %	25 %	271972130
28	NC_013596	CCGA	2	8	8326	8333	25 %	0 %	25 %	50 %	271972130
29	NC_013596	TCGA	2	8	8605	8612	25 %	25 %	25 %	25 %	271972130
30	NC_013596	GCGG	2	8	9261	9268	0 %	0 %	75 %	25 %	271972130
31	NC_013596	ACGC	2	8	10609	10616	25 %	0 %	25 %	50 %	271972133
32	NC_013596	CGAG	2	8	10775	10782	25 %	0 %	50 %	25 %	271972133
33	NC_013596	CCCA	2	8	10809	10816	25 %	0 %	0 %	75 %	271972133
34	NC_013596	CTGA	2	8	10914	10921	25 %	25 %	25 %	25 %	271972133
35	NC_013596	GACC	2	8	11785	11792	25 %	0 %	25 %	50 %	271972135
36	NC_013596	CCGT	2	8	11940	11947	0 %	25 %	25 %	50 %	271972135
37	NC_013596	GTCC	2	8	12721	12728	0 %	25 %	25 %	50 %	271972136
38	NC_013596	CTCA	2	8	13391	13398	25 %	25 %	0 %	50 %	271972136
39	NC_013596	CGTT	2	8	13781	13788	0 %	50 %	25 %	25 %	271972137
40	NC_013596	GGCA	2	8	14297	14304	25 %	0 %	50 %	25 %	271972137
41	NC_013596	GCCG	2	8	14899	14906	0 %	0 %	50 %	50 %	271972138
42	NC_013596	TCGT	2	8	14917	14924	0 %	50 %	25 %	25 %	271972138
43	NC_013596	CCAT	2	8	14985	14992	25 %	25 %	0 %	50 %	271972138
44	NC_013596	GGCG	2	8	16309	16316	0 %	0 %	75 %	25 %	271972140
45	NC_013596	CGTG	2	8	16525	16532	0 %	25 %	50 %	25 %	271972140
46	NC_013596	ACGG	2	8	16612	16619	25 %	0 %	50 %	25 %	271972141
47	NC_013596	CGGC	2	8	16682	16689	0 %	0 %	50 %	50 %	271972141
48	NC_013596	CGGC	2	8	16955	16962	0 %	0 %	50 %	50 %	271972141
49	NC_013596	AGCG	2	8	17122	17129	25 %	0 %	50 %	25 %	271972141
50	NC_013596	GGCG	2	8	17228	17235	0 %	0 %	75 %	25 %	271972142
51	NC_013596	CGCA	2	8	17265	17272	25 %	0 %	25 %	50 %	271972142
52	NC_013596	CGGA	2	8	17757	17764	25 %	0 %	50 %	25 %	271972142
53	NC_013596	CGGT	2	8	18098	18105	0 %	25 %	50 %	25 %	271972143
54	NC_013596	CGGT	2	8	18614	18621	0 %	25 %	50 %	25 %	271972143
55	NC_013596	CCGT	2	8	18699	18706	0 %	25 %	25 %	50 %	271972143
56	NC_013596	GACG	2	8	21110	21117	25 %	0 %	50 %	25 %	271972145
57	NC_013596	CCAG	2	8	22773	22780	25 %	0 %	25 %	50 %	271972146
58	NC_013596	GCTC	2	8	22836	22843	0 %	25 %	25 %	50 %	271972146
59	NC_013596	GCCG	2	8	23064	23071	0 %	0 %	50 %	50 %	271972146
60	NC_013596	GGCC	2	8	23832	23839	0 %	0 %	50 %	50 %	271972146
61	NC_013596	GCGG	2	8	25547	25554	0 %	0 %	75 %	25 %	271972148
62	NC_013596	CGGC	2	8	25614	25621	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
63	NC_013596	CCCG	2	8	25882	25889	0 %	0 %	25 %	75 %	271972148
64	NC_013596	GGCC	2	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
65	NC_013596	CCGG	2	8	26228	26235	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
66	NC_013596	GCGG	2	8	26338	26345	0 %	0 %	75 %	25 %	271972148
67	NC_013596	GGTC	2	8	26410	26417	0 %	25 %	50 %	25 %	271972148
68	NC_013596	GGGT	2	8	26463	26470	0 %	25 %	75 %	0 %	271972148
69	NC_013596	GCGG	2	8	26998	27005	0 %	0 %	75 %	25 %	271972149
70	NC_013596	GGCA	2	8	27064	27071	25 %	0 %	50 %	25 %	271972149
71	NC_013596	GCGG	2	8	27208	27215	0 %	0 %	75 %	25 %	271972149
72	NC_013596	CAGC	2	8	27352	27359	25 %	0 %	25 %	50 %	271972149
73	NC_013596	GCCG	2	8	27439	27446	0 %	0 %	50 %	50 %	271972149
74	NC_013596	GCGG	2	8	27541	27548	0 %	0 %	75 %	25 %	271972149
75	NC_013596	CCGG	2	8	27599	27606	0 %	0 %	50 %	50 %	271972149
76	NC_013596	GCGG	2	8	27682	27689	0 %	0 %	75 %	25 %	271972149
77	NC_013596	CGGG	2	8	27992	27999	0 %	0 %	75 %	25 %	271972150

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.