MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 plasmid pSROS01

Total Repeats: 495

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013596	CAG	2	6	101	106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
2	NC_013596	TCG	2	6	108	113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
3	NC_013596	GAC	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
4	NC_013596	TGC	2	6	148	153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
5	NC_013596	CGG	2	6	157	162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
6	NC_013596	CGA	2	6	166	171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
7	NC_013596	CAG	2	6	185	190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
8	NC_013596	GCA	2	6	238	243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
9	NC_013596	GGT	2	6	263	268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972121
10	NC_013596	CGG	2	6	280	285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
11	NC_013596	TGA	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271972121
12	NC_013596	GTC	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
13	NC_013596	GTC	2	6	317	322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
14	NC_013596	GTC	2	6	329	334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
15	NC_013596	GTC	2	6	371	376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
16	NC_013596	GGT	3	9	379	387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972121
17	NC_013596	CGA	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
18	NC_013596	AAC	2	6	539	544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271972121
19	NC_013596	GAC	2	6	614	619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
20	NC_013596	CGG	2	6	661	666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
21	NC_013596	CAT	2	6	722	727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972121
22	NC_013596	TCG	2	6	741	746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
23	NC_013596	CAG	2	6	755	760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
24	NC_013596	CCG	2	6	790	795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972121
25	NC_013596	GGC	2	6	797	802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
26	NC_013596	GTC	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
27	NC_013596	GGC	2	6	857	862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
28	NC_013596	GTC	2	6	866	871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972121
29	NC_013596	GCG	2	6	875	880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
30	NC_013596	CAC	2	6	893	898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972121
31	NC_013596	CGG	2	6	913	918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
32	NC_013596	CTT	2	6	920	925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271972121
33	NC_013596	TGA	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271972121
34	NC_013596	TCA	2	6	946	951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972121
35	NC_013596	GAG	2	6	1044	1049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271972121
36	NC_013596	CGA	2	6	1165	1170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
37	NC_013596	GCG	2	6	1194	1199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
38	NC_013596	CCG	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972121
39	NC_013596	CTC	2	6	1442	1447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972121
40	NC_013596	GCG	2	6	1464	1469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
41	NC_013596	TGG	2	6	1489	1494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972121
42	NC_013596	GCA	2	6	1519	1524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
43	NC_013596	GCA	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
44	NC_013596	GGC	3	9	1550	1558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
45	NC_013596	GAC	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
46	NC_013596	GGC	2	6	1790	1795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
47	NC_013596	CGG	2	6	1826	1831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
48	NC_013596	CGG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
49	NC_013596	GCG	3	9	1850	1858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
50	NC_013596	CCA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972121
51	NC_013596	CAG	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
52	NC_013596	CGG	3	9	1954	1962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
53	NC_013596	GCA	3	9	1963	1971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
54	NC_013596	CCG	2	6	2007	2012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972121
55	NC_013596	GCC	2	6	2013	2018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972121
56	NC_013596	GAT	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271972121
57	NC_013596	CGG	2	6	2068	2073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
58	NC_013596	CAC	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972121
59	NC_013596	CAG	2	6	2132	2137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
60	NC_013596	CCA	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972121
61	NC_013596	GCG	2	6	2202	2207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
62	NC_013596	CGA	2	6	2236	2241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
63	NC_013596	CAG	2	6	2285	2290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972121
64	NC_013596	TGG	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972121
65	NC_013596	GCG	2	6	2313	2318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
66	NC_013596	GCC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972121
67	NC_013596	TCA	2	6	2416	2421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972121
68	NC_013596	GCG	2	6	2453	2458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972121
69	NC_013596	GCC	2	6	2473	2478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972121
70	NC_013596	GCC	2	6	2924	2929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972122
71	NC_013596	CGG	2	6	2956	2961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972122
72	NC_013596	CAG	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972122
73	NC_013596	TCG	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972122
74	NC_013596	GAC	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972122
75	NC_013596	GCC	2	6	3085	3090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972122
76	NC_013596	TCG	3	9	3103	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972122
77	NC_013596	TCG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972122
78	NC_013596	TGA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271972122
79	NC_013596	GCG	2	6	3204	3209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972122
80	NC_013596	TGC	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972122
81	NC_013596	GTC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972122
82	NC_013596	GGT	3	9	3306	3314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972122
83	NC_013596	CAG	2	6	3496	3501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
84	NC_013596	CCT	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972123
85	NC_013596	TCG	3	9	3611	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972123
86	NC_013596	TCC	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972123
87	NC_013596	CGG	2	6	3633	3638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972123
88	NC_013596	CGC	2	6	3648	3653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
89	NC_013596	CCT	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972123
90	NC_013596	GGT	2	6	3711	3716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972123
91	NC_013596	GCG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972123
92	NC_013596	CTC	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972123
93	NC_013596	GCG	2	6	3815	3820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972123
94	NC_013596	GCG	2	6	3914	3919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972123
95	NC_013596	CGG	2	6	3987	3992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972123
96	NC_013596	GGC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972123
97	NC_013596	GAC	2	6	4033	4038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
98	NC_013596	GCT	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972123
99	NC_013596	GGT	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972123
100	NC_013596	GCA	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
101	NC_013596	GGA	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271972123
102	NC_013596	TCG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972123
103	NC_013596	CGC	2	6	4237	4242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
104	NC_013596	TGC	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972123
105	NC_013596	GAA	2	6	4306	4311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	271972123
106	NC_013596	CCG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
107	NC_013596	CTC	2	6	4381	4386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972123
108	NC_013596	GCA	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
109	NC_013596	GAG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271972123
110	NC_013596	GGT	2	6	4452	4457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972123
111	NC_013596	TGA	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271972123
112	NC_013596	CCT	3	9	4509	4517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972123
113	NC_013596	GAT	2	6	4591	4596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271972123
114	NC_013596	GGC	2	6	4602	4607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972123
115	NC_013596	CGC	2	6	4668	4673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
116	NC_013596	GCG	2	6	4702	4707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972123
117	NC_013596	CGA	2	6	4725	4730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
118	NC_013596	CGC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
119	NC_013596	TGC	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972123
120	NC_013596	ATC	2	6	4937	4942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972123
121	NC_013596	GCC	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
122	NC_013596	CGC	2	6	5007	5012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
123	NC_013596	CGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
124	NC_013596	GAC	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
125	NC_013596	GCA	3	9	5256	5264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
126	NC_013596	GAA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	271972123
127	NC_013596	GCC	2	6	5305	5310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
128	NC_013596	CGC	2	6	5355	5360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
129	NC_013596	ATG	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271972123
130	NC_013596	CAG	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972123
131	NC_013596	CCG	2	6	5453	5458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972123
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254	NC_013596	GCG	2	6	11290	11295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972134
255	NC_013596	ACC	3	9	11823	11831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972135
256	NC_013596	CCG	2	6	11955	11960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972135
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258	NC_013596	CGA	2	6	12757	12762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972136
259	NC_013596	CCA	2	6	12792	12797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972136
260	NC_013596	CGC	2	6	12804	12809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972136
261	NC_013596	TGC	2	6	12830	12835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972136
262	NC_013596	GCG	2	6	12945	12950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972136
263	NC_013596	GCG	2	6	12987	12992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972136
264	NC_013596	CGT	2	6	13075	13080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972136
265	NC_013596	CGC	2	6	13119	13124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972136
266	NC_013596	CGC	2	6	13225	13230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972136
267	NC_013596	ATC	2	6	13253	13258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972136
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283	NC_013596	CGA	2	6	14196	14201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972137
284	NC_013596	CGA	2	6	14208	14213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972137
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291	NC_013596	CCG	2	6	14686	14691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972138
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377	NC_013596	GCC	3	9	21197	21205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972145
378	NC_013596	GAG	2	6	21274	21279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271972145
379	NC_013596	CTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972146
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381	NC_013596	CAT	2	6	22762	22767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972146
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