MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma centrale str. Israel chromosome

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013532	GATAAG	2	12	118	129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269958256
2	NC_013532	GCCGAG	2	12	1567	1578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	269958256
3	NC_013532	CATAGG	2	12	7057	7068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269958264
4	NC_013532	TGCCGG	2	12	7830	7841	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269958264
5	NC_013532	CTAGAT	2	12	13041	13052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269958268
6	NC_013532	ACCGGA	2	12	15691	15702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269958272
7	NC_013532	GCCGCG	2	12	17932	17943	0 %	0 %	50 %	50 %	269958273
8	NC_013532	TCCCTG	2	12	20673	20684	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269958274
9	NC_013532	ACTTCA	2	12	25094	25105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269958277
10	NC_013532	GGGTTT	2	12	33803	33814	0 %	50 %	50 %	0 %	269958287
11	NC_013532	GTTGAA	2	12	36536	36547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958288
12	NC_013532	AAAGCA	2	12	38872	38883	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	269958290
13	NC_013532	CCTTTT	2	12	39237	39248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269958291
14	NC_013532	GCCTCT	2	12	40010	40021	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269958291
15	NC_013532	TGCACT	2	12	41377	41388	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958292
16	NC_013532	TGGTGC	2	12	61113	61124	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958303
17	NC_013532	TAAGGT	2	12	88962	88973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958326
18	NC_013532	AACATG	2	12	93789	93800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269958331
19	NC_013532	TTGAAT	2	12	96537	96548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269958334
20	NC_013532	TAGAGT	2	12	97913	97924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958336
21	NC_013532	CTGTTT	2	12	107681	107692	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	269958345
22	NC_013532	TCCAGC	2	12	108776	108787	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958346
23	NC_013532	TGATAT	2	12	110392	110403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269958348
24	NC_013532	CCTATT	2	12	112054	112065	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	269958349
25	NC_013532	AGCATG	2	12	114583	114594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269958352
26	NC_013532	ACCTTA	2	12	116118	116129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269958354
27	NC_013532	CAATTA	2	12	141976	141987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	269958377
28	NC_013532	TGGTGC	2	12	151852	151863	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958388
29	NC_013532	GTGATA	2	12	153149	153160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958389
30	NC_013532	CTTTGA	2	12	153294	153305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269958389
31	NC_013532	GTACCC	2	12	156027	156038	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958392
32	NC_013532	TTGTGG	2	12	157943	157954	0 %	50 %	50 %	0 %	269958395
33	NC_013532	CTTGTG	2	12	161084	161095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	269958396
34	NC_013532	TTGGGT	2	12	161888	161899	0 %	50 %	50 %	0 %	269958397
35	NC_013532	TAGAAC	2	12	170655	170666	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269958404
36	NC_013532	TGCCAT	2	12	179023	179034	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958411
37	NC_013532	TGAACA	2	12	183115	183126	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269958413
38	NC_013532	GTATGA	2	12	185436	185447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958415
39	NC_013532	GGCTGT	2	12	187292	187303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958417
40	NC_013532	CAAGAT	2	12	187729	187740	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269958417
41	NC_013532	AAGTAC	2	12	187867	187878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269958417
42	NC_013532	GGTTGT	2	12	190797	190808	0 %	50 %	50 %	0 %	269958420
43	NC_013532	TGCGCG	2	12	196152	196163	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269958425
44	NC_013532	GCTTTG	2	12	196486	196497	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	269958425
45	NC_013532	TGGTGC	2	12	203524	203535	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958429
46	NC_013532	ACTTCA	2	12	203886	203897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269958429
47	NC_013532	CTCCAT	2	12	214441	214452	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	269958439
48	NC_013532	GTTAAT	2	12	218908	218919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269958445
49	NC_013532	GTTCTG	2	12	220229	220240	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	269958446
50	NC_013532	TGGCCT	2	12	222736	222747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269958447
51	NC_013532	GACATC	2	12	223352	223363	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269958447
52	NC_013532	CAAGTT	2	12	252580	252591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269958472
53	NC_013532	GCTGCA	2	12	259853	259864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958479
54	NC_013532	GCCAAG	2	12	265249	265260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269958485
55	NC_013532	CACCTT	2	12	268424	268435	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	269958488
56	NC_013532	GGTGGC	2	12	273575	273586	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269958489
57	NC_013532	TTGAGG	2	12	287756	287767	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	269958494
58	NC_013532	AGTAAT	2	12	287917	287928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	269958494
59	NC_013532	AAATAA	2	12	288620	288631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	269958494
60	NC_013532	GGGTGA	2	12	288767	288778	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	269958494
61	NC_013532	TTAGGA	2	12	293746	293757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958496
62	NC_013532	GCTGCG	2	12	305266	305277	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269958504
63	NC_013532	AGCCGC	2	12	308269	308280	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269958507
64	NC_013532	GGGTTT	2	12	331312	331323	0 %	50 %	50 %	0 %	269958527
65	NC_013532	TTTTCA	2	12	340818	340829	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	269958534
66	NC_013532	AAGAAA	2	12	341868	341879	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	269958534
67	NC_013532	ACTGGT	2	12	355327	355338	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269958546
68	NC_013532	GCTGTT	2	12	355783	355794	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	269958546
69	NC_013532	TCTTGA	2	12	362672	362683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269958551
70	NC_013532	TCTATT	2	12	364918	364929	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	269958552
71	NC_013532	AACCAA	2	12	374954	374965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269958559
72	NC_013532	GTCCTG	2	12	385082	385093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269958566
73	NC_013532	CAAAAG	2	12	398297	398308	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	269958575
74	NC_013532	TTCTGC	2	12	398323	398334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	269958575
75	NC_013532	TGAAGA	2	12	404096	404107	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269958582
76	NC_013532	AAGGTC	2	12	405162	405173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269958583
77	NC_013532	GGGTAA	2	12	409166	409177	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	269958591
78	NC_013532	CAAGGG	2	12	412213	412224	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	269958599
79	NC_013532	TTGCTG	2	12	420254	420265	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	269958609
80	NC_013532	GGCTAT	2	12	423171	423182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269958611
81	NC_013532	CTCCCG	2	12	427229	427240	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	269958616
82	NC_013532	GGCTGT	2	12	431972	431983	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958621
83	NC_013532	TACGAC	2	12	436041	436052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269958626
84	NC_013532	AACTGC	2	12	439859	439870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269958629
85	NC_013532	TCCATA	2	12	442093	442104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269958630
86	NC_013532	CCACTA	2	12	444950	444961	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	269958633
87	NC_013532	AGGTAC	2	12	452990	453001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269958642
88	NC_013532	TTTCGG	2	12	453252	453263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	269958642
89	NC_013532	GCTGAT	2	12	457227	457238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269958645
90	NC_013532	TACCTG	2	12	466190	466201	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958653
91	NC_013532	TGCGTG	2	12	470520	470531	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958656
92	NC_013532	TGTACA	2	12	492279	492290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269958667
93	NC_013532	TTGCCA	2	12	493563	493574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958667
94	NC_013532	AAGCCA	2	12	496169	496180	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	269958668
95	NC_013532	GGCAGC	2	12	502685	502696	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	269958670
96	NC_013532	CAGCAC	2	12	505928	505939	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	269958673
97	NC_013532	TTCCTT	2	12	508309	508320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269958675
98	NC_013532	TGCCGG	2	12	508975	508986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269958675
99	NC_013532	GAAGCT	2	12	512750	512761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269958678
100	NC_013532	AGCTGC	2	12	520718	520729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958688
101	NC_013532	ATCTGT	2	12	533351	533362	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269958696
102	NC_013532	GAGGGC	2	12	543271	543282	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	269958706
103	NC_013532	CGGTGG	2	12	552624	552635	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269958714
104	NC_013532	GATGAG	2	12	552807	552818	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	269958714
105	NC_013532	TGGAGT	2	12	553931	553942	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	269958714
106	NC_013532	ACAAGT	2	12	560235	560246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269958718
107	NC_013532	AAGGAA	2	12	562103	562114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269958719
108	NC_013532	TGACCG	2	12	567615	567626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958722
109	NC_013532	GCCTGC	2	12	572673	572684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269958726
110	NC_013532	CCTGCT	2	12	573599	573610	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269958727
111	NC_013532	TGGTTG	2	12	584921	584932	0 %	50 %	50 %	0 %	269958728
112	NC_013532	ACTTCA	2	12	586537	586548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269958731
113	NC_013532	GCACCT	2	12	586582	586593	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958731
114	NC_013532	GTTGAA	2	12	586632	586643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958731
115	NC_013532	TAAAGG	2	12	587365	587376	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269958731
116	NC_013532	ATTGGC	2	12	597452	597463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269958736
117	NC_013532	GAAAAG	2	12	600998	601009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269958738
118	NC_013532	TTGGCA	2	12	606649	606660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269958742
119	NC_013532	ACAGCT	2	12	608377	608388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269958742
120	NC_013532	GCCACT	2	12	611237	611248	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958743
121	NC_013532	CTGGGC	2	12	614038	614049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269958746
122	NC_013532	TTGATT	2	12	614282	614293	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	269958746
123	NC_013532	CTGGTG	2	12	615299	615310	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958747
124	NC_013532	TGCACT	2	12	615766	615777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958747
125	NC_013532	CTGGTG	2	12	624916	624927	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958756
126	NC_013532	TATACA	2	12	629224	629235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	269958761
127	NC_013532	CCTTGC	2	12	631778	631789	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269958764
128	NC_013532	TAGGCA	2	12	634361	634372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269958766
129	NC_013532	CTATGC	2	12	643205	643216	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958770
130	NC_013532	CATTGC	2	12	647723	647734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958770
131	NC_013532	CTCCAT	2	12	649048	649059	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	269958771
132	NC_013532	TCCTAA	2	12	652407	652418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269958775
133	NC_013532	TGGTAA	2	12	653193	653204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958775
134	NC_013532	TTAGGA	2	12	663438	663449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269958779
135	NC_013532	TCCTAA	2	12	667500	667511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269958782
136	NC_013532	CTGGTG	2	12	667649	667660	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958782
137	NC_013532	TGCACT	2	12	668116	668127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958782
138	NC_013532	GCGCCT	2	12	677284	677295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269958790
139	NC_013532	AAGCTG	2	12	682030	682041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269958794
140	NC_013532	CGGTGG	2	12	694042	694053	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269958801
141	NC_013532	TCAACC	2	12	697589	697600	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	269958804
142	NC_013532	CGAATT	2	12	700712	700723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269958810
143	NC_013532	GGAAAT	2	12	720120	720131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269958830
144	NC_013532	ACTGCA	2	12	720660	720671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269958830
145	NC_013532	ACCAGA	2	12	734044	734055	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	269958840
146	NC_013532	ACCAGA	2	12	736756	736767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	269958841
147	NC_013532	GCCAGA	2	12	743596	743607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269958843
148	NC_013532	CCTTAG	2	12	751274	751285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958846
149	NC_013532	CCTTAG	2	12	751349	751360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958846
150	NC_013532	CCCGTT	2	12	751988	751999	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269958846
151	NC_013532	GCGGGA	2	12	766235	766246	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	269958856
152	NC_013532	ATCGTC	2	12	783848	783859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958869
153	NC_013532	TGGGCT	2	12	790254	790265	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958873
154	NC_013532	TACGTG	2	12	790303	790314	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269958873
155	NC_013532	CCGTAA	2	12	793570	793581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269958877
156	NC_013532	TGGAAA	2	12	795031	795042	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269958878
157	NC_013532	CACATA	2	12	808553	808564	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	269958886
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163	NC_013532	GTCTGG	2	12	828958	828969	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958900
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184	NC_013532	ATTGCA	2	12	952022	952033	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269958977
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189	NC_013532	GCTGAG	2	12	970744	970755	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269958993
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198	NC_013532	AATCCG	2	12	1041903	1041914	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269959050
199	NC_013532	ACGCAG	2	12	1050501	1050512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269959056
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201	NC_013532	GGAGCT	2	12	1055725	1055736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269959061
202	NC_013532	ATTTAC	2	12	1056508	1056519	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	269959061
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204	NC_013532	GTCCTT	2	12	1065208	1065219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	269959069
205	NC_013532	CCACAG	2	12	1068479	1068490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	269959073
206	NC_013532	GACCTA	2	12	1072273	1072284	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269959075
207	NC_013532	AGCTTG	2	12	1082808	1082819	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269959083
208	NC_013532	TGTGCA	2	12	1086643	1086654	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269959085
209	NC_013532	CGTGGC	2	12	1090305	1090316	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269959088
210	NC_013532	CTTCGC	2	12	1098399	1098410	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269959092
211	NC_013532	TCCAGA	2	12	1104856	1104867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269959098
212	NC_013532	GCTCAA	2	12	1109844	1109855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269959102
213	NC_013532	ATGAAC	2	12	1116542	1116553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269959110
214	NC_013532	CATGCC	2	12	1116802	1116813	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269959110
215	NC_013532	AAGGGC	2	12	1119204	1119215	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	269959111
216	NC_013532	AGCAAG	2	12	1126575	1126586	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	269959117
217	NC_013532	CCATCG	2	12	1143423	1143434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269959133
218	NC_013532	ACCTTA	2	12	1145082	1145093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269959133
219	NC_013532	TCCAGG	2	12	1146125	1146136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269959134
220	NC_013532	GTAGAT	2	12	1150693	1150704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269959136
221	NC_013532	ACACAA	2	12	1165084	1165095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269959149
222	NC_013532	CTACAA	2	12	1169990	1170001	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	269959150
223	NC_013532	AAGGGT	2	12	1171033	1171044	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	269959151
224	NC_013532	ACCAGT	2	12	1178755	1178766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269959157
225	NC_013532	GTTGAA	2	12	1179261	1179272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269959158
226	NC_013532	ATAAAC	2	12	1180466	1180477	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	269959159
227	NC_013532	GTTGAA	2	12	1184938	1184949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269959162
228	NC_013532	AAAGAC	2	12	1186381	1186392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	269959163
229	NC_013532	ACCACA	2	12	1195836	1195847	50 %	0 %	0 %	50 %	269959170
230	NC_013532	ACTGCA	2	12	1197631	1197642	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269959173

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.