MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 plasmid pXCEL01

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013531	CGCGGC	2	12	1590	1601	0 %	0 %	50 %	50 %	269958151
2	NC_013531	CACGTG	2	12	3360	3371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958154
3	NC_013531	CCGGGC	2	12	4920	4931	0 %	0 %	50 %	50 %	269958156
4	NC_013531	GGTCGG	2	12	5084	5095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269958156
5	NC_013531	CGAGGG	2	12	6906	6917	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	269958160
6	NC_013531	GCCGTC	2	12	7795	7806	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269958161
7	NC_013531	GCGGCC	2	12	8984	8995	0 %	0 %	50 %	50 %	269958163
8	NC_013531	TTGGCG	2	12	12539	12550	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269958169
9	NC_013531	GCCTTC	2	12	12628	12639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269958169
10	NC_013531	TTCTCC	2	12	17041	17052	0 %	50 %	0 %	50 %	269958178
11	NC_013531	TCGATG	2	12	17715	17726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269958179
12	NC_013531	GTCGAG	2	12	17864	17875	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269958179
13	NC_013531	GGTCTC	2	12	19093	19104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269958180
14	NC_013531	CGGGCC	2	12	22559	22570	0 %	0 %	50 %	50 %	269958180
15	NC_013531	CTTGGC	2	12	22594	22605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269958180
16	NC_013531	AGTGTC	2	12	25774	25785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269958183
17	NC_013531	TCGAGC	2	12	26897	26908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958183
18	NC_013531	ACGTTC	2	12	28929	28940	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958185
19	NC_013531	CCCAGG	2	12	30295	30306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269958187
20	NC_013531	CTGCAC	2	12	31763	31774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958188
21	NC_013531	CGTCGG	2	12	32721	32732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269958189
22	NC_013531	TGCCGC	2	12	37025	37036	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269958195
23	NC_013531	AGGACG	2	12	38483	38494	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	269958195
24	NC_013531	CGGATC	2	12	38839	38850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958195
25	NC_013531	CCGCAC	2	12	39039	39050	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	269958196
26	NC_013531	CGACGC	2	12	39137	39148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269958196
27	NC_013531	AACGGC	2	12	39789	39800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269958197
28	NC_013531	GAACGG	2	12	39824	39835	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	269958197
29	NC_013531	CGCGGT	2	12	42366	42377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269958200
30	NC_013531	TACACC	2	12	47396	47407	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	269958207
31	NC_013531	GGTCGG	2	12	47410	47421	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269958207
32	NC_013531	GGTGCG	2	12	47573	47584	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269958207
33	NC_013531	TCGAGG	2	12	48965	48976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269958208
34	NC_013531	CGAGCA	2	12	49893	49904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269958208
35	NC_013531	CGGCCG	2	12	50563	50574	0 %	0 %	50 %	50 %	269958209
36	NC_013531	GCCCTG	2	12	50769	50780	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269958209
37	NC_013531	GATCGC	2	12	50966	50977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958209
38	NC_013531	CATCGT	2	12	51662	51673	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269958209
39	NC_013531	CGGCGC	3	18	51932	51949	0 %	0 %	50 %	50 %	269958209
40	NC_013531	ACCGCG	2	12	52783	52794	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269958210
41	NC_013531	CGCCGT	2	12	52832	52843	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269958210
42	NC_013531	ACCTCG	2	12	54289	54300	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958211
43	NC_013531	AGGATG	2	12	55345	55356	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	269958212
44	NC_013531	GCCTTG	2	12	58316	58327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269958215
45	NC_013531	CGCGAT	2	12	59561	59572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958216
46	NC_013531	CGTCGA	2	12	60266	60277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958216
47	NC_013531	GGCCGA	2	12	62079	62090	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	269958218
48	NC_013531	CCTCGA	2	12	64412	64423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958221
49	NC_013531	CGCCAC	2	12	64460	64471	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	269958221
50	NC_013531	AGGCCC	2	12	65687	65698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269958225
51	NC_013531	CGTCCG	2	12	66146	66157	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269958226
52	NC_013531	CCTGCA	2	12	70672	70683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958231
53	NC_013531	CTCGTC	2	12	71231	71242	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269958233
54	NC_013531	CGTGTC	2	12	73460	73471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269958235
55	NC_013531	GACCTC	2	12	78580	78591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269958242
56	NC_013531	GACCGT	2	12	82906	82917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269958249
57	NC_013531	GCGTCG	2	12	83643	83654	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269958249
58	NC_013531	GGGGGA	2	12	85024	85035	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	269958250
59	NC_013531	CGCCAG	2	12	86591	86602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269958252
60	NC_013531	CCCGAC	2	12	86751	86762	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	269958253
61	NC_013531	CGTTCC	2	12	88212	88223	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269958254
62	NC_013531	GCGACA	2	12	88308	88319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269958254

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.