MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 plasmid pXCEL01

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013531	CGAGC	2	10	505	514	20 %	0 %	40 %	40 %	269958149
2	NC_013531	CTGGC	2	10	745	754	0 %	20 %	40 %	40 %	269958149
3	NC_013531	GCCGA	2	10	816	825	20 %	0 %	40 %	40 %	269958149
4	NC_013531	GCACC	2	10	1202	1211	20 %	0 %	20 %	60 %	269958150
5	NC_013531	TGCGG	2	10	1439	1448	0 %	20 %	60 %	20 %	269958151
6	NC_013531	GGGCT	2	10	1740	1749	0 %	20 %	60 %	20 %	269958151
7	NC_013531	GCGCA	2	10	3976	3985	20 %	0 %	40 %	40 %	269958155
8	NC_013531	CATGG	2	10	4144	4153	20 %	20 %	40 %	20 %	269958155
9	NC_013531	GCCGG	2	10	5568	5577	0 %	0 %	60 %	40 %	269958157
10	NC_013531	GTCCG	2	10	8070	8079	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013531	CGGGG	2	10	9712	9721	0 %	0 %	80 %	20 %	269958164
12	NC_013531	CCCGG	2	10	10719	10728	0 %	0 %	40 %	60 %	269958165
13	NC_013531	ATCAC	2	10	11684	11693	40 %	20 %	0 %	40 %	269958167
14	NC_013531	CTCGT	2	10	12493	12502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013531	TTCCG	2	10	13061	13070	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013531	GCCCT	2	10	14153	14162	0 %	20 %	20 %	60 %	269958171
17	NC_013531	CCCGC	2	10	14906	14915	0 %	0 %	20 %	80 %	269958173
18	NC_013531	AGGTC	2	10	16618	16627	20 %	20 %	40 %	20 %	269958176
19	NC_013531	TTGGC	2	10	17675	17684	0 %	40 %	40 %	20 %	269958178
20	NC_013531	CGAGC	2	10	18625	18634	20 %	0 %	40 %	40 %	269958180
21	NC_013531	CCGGT	2	10	19740	19749	0 %	20 %	40 %	40 %	269958180
22	NC_013531	GCGGG	2	10	19833	19842	0 %	0 %	80 %	20 %	269958180
23	NC_013531	GGTTG	2	10	19999	20008	0 %	40 %	60 %	0 %	269958180
24	NC_013531	GCCGC	2	10	20491	20500	0 %	0 %	40 %	60 %	269958180
25	NC_013531	CCGTG	2	10	21023	21032	0 %	20 %	40 %	40 %	269958180
26	NC_013531	CGGGT	2	10	21608	21617	0 %	20 %	60 %	20 %	269958180
27	NC_013531	GCGCG	2	10	21958	21967	0 %	0 %	60 %	40 %	269958180
28	NC_013531	CGGCG	2	10	23268	23277	0 %	0 %	60 %	40 %	269958180
29	NC_013531	CACGC	2	10	23683	23692	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_013531	CGACA	2	10	25646	25655	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013531	CGTGA	2	10	26015	26024	20 %	20 %	40 %	20 %	269958183
32	NC_013531	GCCGA	2	10	26834	26843	20 %	0 %	40 %	40 %	269958183
33	NC_013531	ACGCG	2	10	27862	27871	20 %	0 %	40 %	40 %	269958184
34	NC_013531	CCGTC	2	10	28480	28489	0 %	20 %	20 %	60 %	269958184
35	NC_013531	TCCGC	2	10	28713	28722	0 %	20 %	20 %	60 %	269958185
36	NC_013531	GCAGA	2	10	29378	29387	40 %	0 %	40 %	20 %	269958186
37	NC_013531	ACCTC	2	10	29736	29745	20 %	20 %	0 %	60 %	269958186
38	NC_013531	CCCCG	2	10	30673	30682	0 %	0 %	20 %	80 %	269958187
39	NC_013531	CGAGC	2	10	30759	30768	20 %	0 %	40 %	40 %	269958187
40	NC_013531	CCGAC	2	10	30813	30822	20 %	0 %	20 %	60 %	269958188
41	NC_013531	CCGCC	2	10	30933	30942	0 %	0 %	20 %	80 %	269958188
42	NC_013531	CGCGC	2	10	31000	31009	0 %	0 %	40 %	60 %	269958188
43	NC_013531	CAGCG	2	10	31627	31636	20 %	0 %	40 %	40 %	269958188
44	NC_013531	CCTCG	2	10	32335	32344	0 %	20 %	20 %	60 %	269958188
45	NC_013531	CGAGT	2	10	33711	33720	20 %	20 %	40 %	20 %	269958190
46	NC_013531	GGGAG	2	10	34142	34151	20 %	0 %	80 %	0 %	269958190
47	NC_013531	GTCGC	2	10	34985	34994	0 %	20 %	40 %	40 %	269958193
48	NC_013531	CGTGG	2	10	35940	35949	0 %	20 %	60 %	20 %	269958195
49	NC_013531	CGTCG	2	10	36201	36210	0 %	20 %	40 %	40 %	269958195
50	NC_013531	GTGGC	2	10	40443	40452	0 %	20 %	60 %	20 %	269958197
51	NC_013531	CGCTG	2	10	45434	45443	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013531	GGCCT	2	10	50221	50230	0 %	20 %	40 %	40 %	269958208
53	NC_013531	GGCCT	2	10	50619	50628	0 %	20 %	40 %	40 %	269958209
54	NC_013531	GCCGC	2	10	51862	51871	0 %	0 %	40 %	60 %	269958209
55	NC_013531	GCCGA	2	10	52768	52777	20 %	0 %	40 %	40 %	269958210
56	NC_013531	CGACC	2	10	52938	52947	20 %	0 %	20 %	60 %	269958210
57	NC_013531	CCGGC	2	10	53156	53165	0 %	0 %	40 %	60 %	269958210
58	NC_013531	CCCCG	2	10	54855	54864	0 %	0 %	20 %	80 %	269958211
59	NC_013531	CCGTC	2	10	55175	55184	0 %	20 %	20 %	60 %	269958212
60	NC_013531	AGGTC	2	10	55463	55472	20 %	20 %	40 %	20 %	269958212
61	NC_013531	CGCTG	2	10	55763	55772	0 %	20 %	40 %	40 %	269958213
62	NC_013531	CGGTC	2	10	57858	57867	0 %	20 %	40 %	40 %	269958214
63	NC_013531	CGGGC	2	10	58050	58059	0 %	0 %	60 %	40 %	269958214
64	NC_013531	GCCCG	2	10	58151	58160	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_013531	CGGTC	2	10	58228	58237	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013531	CGGAC	2	10	58277	58286	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013531	GTTCC	2	10	58925	58934	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013531	GCACC	2	10	60494	60503	20 %	0 %	20 %	60 %	269958216
69	NC_013531	CGACC	2	10	60713	60722	20 %	0 %	20 %	60 %	269958216
70	NC_013531	CCGTC	2	10	62651	62660	0 %	20 %	20 %	60 %	269958219
71	NC_013531	GGCCG	2	10	63618	63627	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013531	GATCA	2	10	64685	64694	40 %	20 %	20 %	20 %	269958222
73	NC_013531	GACCG	2	10	65412	65421	20 %	0 %	40 %	40 %	269958224
74	NC_013531	CACGA	2	10	66411	66420	40 %	0 %	20 %	40 %	269958226
75	NC_013531	GGGGA	2	10	66606	66615	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013531	GGCCT	2	10	66656	66665	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013531	CACGA	2	10	68199	68208	40 %	0 %	20 %	40 %	269958230
78	NC_013531	GCTCG	2	10	70099	70108	0 %	20 %	40 %	40 %	269958230
79	NC_013531	GATCC	2	10	71546	71555	20 %	20 %	20 %	40 %	269958233
80	NC_013531	GGCAG	2	10	75647	75656	20 %	0 %	60 %	20 %	269958237
81	NC_013531	CGCGC	2	10	76809	76818	0 %	0 %	40 %	60 %	269958239
82	NC_013531	CTCGC	2	10	77893	77902	0 %	20 %	20 %	60 %	269958241
83	NC_013531	CGGGC	2	10	80480	80489	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013531	TGGGC	2	10	83388	83397	0 %	20 %	60 %	20 %	269958249
85	NC_013531	ACCCG	2	10	83430	83439	20 %	0 %	20 %	60 %	269958249
86	NC_013531	CTGGT	2	10	83660	83669	0 %	40 %	40 %	20 %	269958249
87	NC_013531	GGGCT	2	10	83776	83785	0 %	20 %	60 %	20 %	269958249
88	NC_013531	CCGGC	2	10	84173	84182	0 %	0 %	40 %	60 %	269958250
89	NC_013531	CGCCC	2	10	84684	84693	0 %	0 %	20 %	80 %	269958250
90	NC_013531	CACCC	2	10	85188	85197	20 %	0 %	0 %	80 %	269958250
91	NC_013531	GCGTC	2	10	86359	86368	0 %	20 %	40 %	40 %	269958252
92	NC_013531	CCCGG	2	10	86790	86799	0 %	0 %	40 %	60 %	269958253
93	NC_013531	GCCCG	2	10	87053	87062	0 %	0 %	40 %	60 %	269958253
94	NC_013531	CCCCG	2	10	87384	87393	0 %	0 %	20 %	80 %	269958253
95	NC_013531	CGCAC	2	10	88202	88211	20 %	0 %	20 %	60 %	269958254

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.