MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 plasmid pXCEL01

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013531	CGCC	2	8	79	86	0 %	0 %	25 %	75 %	269958149
2	NC_013531	CGCC	2	8	217	224	0 %	0 %	25 %	75 %	269958149
3	NC_013531	GACC	2	8	365	372	25 %	0 %	25 %	50 %	269958149
4	NC_013531	CGAG	2	8	424	431	25 %	0 %	50 %	25 %	269958149
5	NC_013531	GGGA	2	8	586	593	25 %	0 %	75 %	0 %	269958149
6	NC_013531	CTCG	2	8	695	702	0 %	25 %	25 %	50 %	269958149
7	NC_013531	CGCC	2	8	1225	1232	0 %	0 %	25 %	75 %	269958150
8	NC_013531	CGGG	2	8	2414	2421	0 %	0 %	75 %	25 %	269958153
9	NC_013531	GGTC	2	8	2945	2952	0 %	25 %	50 %	25 %	269958153
10	NC_013531	GCGG	2	8	3104	3111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013531	CGGG	2	8	3502	3509	0 %	0 %	75 %	25 %	269958154
12	NC_013531	CGCC	2	8	3664	3671	0 %	0 %	25 %	75 %	269958154
13	NC_013531	GCCG	2	8	3987	3994	0 %	0 %	50 %	50 %	269958155
14	NC_013531	CCGC	2	8	4286	4293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_013531	GCGG	2	8	4311	4318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013531	CGAC	2	8	4537	4544	25 %	0 %	25 %	50 %	269958156
17	NC_013531	GCAC	2	8	4662	4669	25 %	0 %	25 %	50 %	269958156
18	NC_013531	GCGG	2	8	4679	4686	0 %	0 %	75 %	25 %	269958156
19	NC_013531	GGGC	2	8	4834	4841	0 %	0 %	75 %	25 %	269958156
20	NC_013531	CGCT	2	8	5277	5284	0 %	25 %	25 %	50 %	269958156
21	NC_013531	CCCA	2	8	5400	5407	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_013531	GCCT	2	8	5426	5433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013531	GTCG	2	8	5772	5779	0 %	25 %	50 %	25 %	269958157
24	NC_013531	GTCG	2	8	5964	5971	0 %	25 %	50 %	25 %	269958157
25	NC_013531	CGAG	2	8	5981	5988	25 %	0 %	50 %	25 %	269958157
26	NC_013531	CGGG	2	8	6018	6025	0 %	0 %	75 %	25 %	269958157
27	NC_013531	TGGT	2	8	6043	6050	0 %	50 %	50 %	0 %	269958157
28	NC_013531	GGCG	2	8	6104	6111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013531	AGCG	2	8	6154	6161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013531	GCTC	2	8	6358	6365	0 %	25 %	25 %	50 %	269958158
31	NC_013531	GCGG	2	8	6757	6764	0 %	0 %	75 %	25 %	269958159
32	NC_013531	CCGG	2	8	7127	7134	0 %	0 %	50 %	50 %	269958160
33	NC_013531	CCAG	2	8	7211	7218	25 %	0 %	25 %	50 %	269958160
34	NC_013531	GCGG	2	8	7353	7360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013531	TGGT	2	8	8004	8011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013531	GGGC	2	8	8141	8148	0 %	0 %	75 %	25 %	269958162
37	NC_013531	GCGG	2	8	8382	8389	0 %	0 %	75 %	25 %	269958162
38	NC_013531	TGCT	2	8	8506	8513	0 %	50 %	25 %	25 %	269958162
39	NC_013531	CGGG	2	8	8629	8636	0 %	0 %	75 %	25 %	269958162
40	NC_013531	GCCG	2	8	9364	9371	0 %	0 %	50 %	50 %	269958163
41	NC_013531	GCAC	2	8	9603	9610	25 %	0 %	25 %	50 %	269958163
42	NC_013531	TGCG	2	8	10074	10081	0 %	25 %	50 %	25 %	269958164
43	NC_013531	GCCG	2	8	10851	10858	0 %	0 %	50 %	50 %	269958165
44	NC_013531	GGTG	2	8	11107	11114	0 %	25 %	75 %	0 %	269958166
45	NC_013531	GGCG	2	8	11272	11279	0 %	0 %	75 %	25 %	269958167
46	NC_013531	GGTC	2	8	11646	11653	0 %	25 %	50 %	25 %	269958167
47	NC_013531	AGCG	2	8	11724	11731	25 %	0 %	50 %	25 %	269958167
48	NC_013531	TGCC	2	8	12101	12108	0 %	25 %	25 %	50 %	269958168
49	NC_013531	CGCT	2	8	12551	12558	0 %	25 %	25 %	50 %	269958169
50	NC_013531	GGCG	2	8	12669	12676	0 %	0 %	75 %	25 %	269958169
51	NC_013531	CGTC	2	8	12809	12816	0 %	25 %	25 %	50 %	269958169
52	NC_013531	GTGG	2	8	12895	12902	0 %	25 %	75 %	0 %	269958169
53	NC_013531	TGCT	2	8	13121	13128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013531	GACC	2	8	13182	13189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013531	GCTG	2	8	13218	13225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013531	GCCG	2	8	13356	13363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013531	GGCG	2	8	13503	13510	0 %	0 %	75 %	25 %	269958170
58	NC_013531	GGCG	2	8	13596	13603	0 %	0 %	75 %	25 %	269958170
59	NC_013531	GGGT	2	8	14321	14328	0 %	25 %	75 %	0 %	269958171
60	NC_013531	CGGC	2	8	14397	14404	0 %	0 %	50 %	50 %	269958171
61	NC_013531	AGCG	2	8	14839	14846	25 %	0 %	50 %	25 %	269958173
62	NC_013531	CAGC	2	8	14934	14941	25 %	0 %	25 %	50 %	269958173
63	NC_013531	CACC	2	8	15448	15455	25 %	0 %	0 %	75 %	269958173
64	NC_013531	GGCG	2	8	15489	15496	0 %	0 %	75 %	25 %	269958174
65	NC_013531	TCCA	2	8	16129	16136	25 %	25 %	0 %	50 %	269958175
66	NC_013531	GGGC	2	8	16654	16661	0 %	0 %	75 %	25 %	269958176
67	NC_013531	GCAG	2	8	16738	16745	25 %	0 %	50 %	25 %	269958176
68	NC_013531	AGTG	2	8	16836	16843	25 %	25 %	50 %	0 %	269958176
69	NC_013531	GTCG	2	8	16903	16910	0 %	25 %	50 %	25 %	269958177
70	NC_013531	TGCT	2	8	17023	17030	0 %	50 %	25 %	25 %	269958177
71	NC_013531	CAGC	2	8	17547	17554	25 %	0 %	25 %	50 %	269958178
72	NC_013531	CGGC	2	8	18000	18007	0 %	0 %	50 %	50 %	269958179
73	NC_013531	GTCG	2	8	18484	18491	0 %	25 %	50 %	25 %	269958180
74	NC_013531	CGGC	2	8	18851	18858	0 %	0 %	50 %	50 %	269958180
75	NC_013531	GACG	2	8	19300	19307	25 %	0 %	50 %	25 %	269958180
76	NC_013531	CCAG	2	8	19338	19345	25 %	0 %	25 %	50 %	269958180
77	NC_013531	TCGA	2	8	19502	19509	25 %	25 %	25 %	25 %	269958180
78	NC_013531	GCCG	2	8	19729	19736	0 %	0 %	50 %	50 %	269958180
79	NC_013531	GTCG	2	8	19938	19945	0 %	25 %	50 %	25 %	269958180
80	NC_013531	GCCT	2	8	20084	20091	0 %	25 %	25 %	50 %	269958180
81	NC_013531	CACG	2	8	20593	20600	25 %	0 %	25 %	50 %	269958180
82	NC_013531	GTGC	2	8	20956	20963	0 %	25 %	50 %	25 %	269958180
83	NC_013531	CCAG	2	8	20985	20992	25 %	0 %	25 %	50 %	269958180
84	NC_013531	CAGC	2	8	21301	21308	25 %	0 %	25 %	50 %	269958180
85	NC_013531	GGTG	2	8	21711	21718	0 %	25 %	75 %	0 %	269958180
86	NC_013531	CGCT	2	8	21817	21824	0 %	25 %	25 %	50 %	269958180
87	NC_013531	GTGC	2	8	22202	22209	0 %	25 %	50 %	25 %	269958180
88	NC_013531	GGCC	2	8	22689	22696	0 %	0 %	50 %	50 %	269958180
89	NC_013531	GCCG	2	8	24086	24093	0 %	0 %	50 %	50 %	269958181
90	NC_013531	GCAC	2	8	24304	24311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013531	AGCG	2	8	24498	24505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013531	GAGC	2	8	24775	24782	25 %	0 %	50 %	25 %	269958182
93	NC_013531	CGCA	2	8	24839	24846	25 %	0 %	25 %	50 %	269958182
94	NC_013531	TGCC	2	8	25066	25073	0 %	25 %	25 %	50 %	269958182
95	NC_013531	ACCG	2	8	25584	25591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013531	CGCC	2	8	25677	25684	0 %	0 %	25 %	75 %	269958183
97	NC_013531	TCGG	2	8	26158	26165	0 %	25 %	50 %	25 %	269958183
98	NC_013531	CCAC	2	8	26694	26701	25 %	0 %	0 %	75 %	269958183
99	NC_013531	GGCC	2	8	26952	26959	0 %	0 %	50 %	50 %	269958183
100	NC_013531	GATG	2	8	27378	27385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013531	TGAG	2	8	27595	27602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013531	GACG	2	8	28223	28230	25 %	0 %	50 %	25 %	269958184
103	NC_013531	CTGC	2	8	28727	28734	0 %	25 %	25 %	50 %	269958185
104	NC_013531	GCAG	2	8	28795	28802	25 %	0 %	50 %	25 %	269958185
105	NC_013531	CCGC	2	8	29331	29338	0 %	0 %	25 %	75 %	269958186
106	NC_013531	GCGG	2	8	29638	29645	0 %	0 %	75 %	25 %	269958186
107	NC_013531	TGAC	2	8	29688	29695	25 %	25 %	25 %	25 %	269958186
108	NC_013531	GTCG	2	8	29719	29726	0 %	25 %	50 %	25 %	269958186
109	NC_013531	GACG	2	8	29827	29834	25 %	0 %	50 %	25 %	269958186
110	NC_013531	GCCC	2	8	30868	30875	0 %	0 %	25 %	75 %	269958188
111	NC_013531	GGCC	2	8	30895	30902	0 %	0 %	50 %	50 %	269958188
112	NC_013531	CTGG	2	8	31333	31340	0 %	25 %	50 %	25 %	269958188
113	NC_013531	CGTT	2	8	31413	31420	0 %	50 %	25 %	25 %	269958188
114	NC_013531	CCGT	2	8	31532	31539	0 %	25 %	25 %	50 %	269958188
115	NC_013531	GTCG	2	8	31651	31658	0 %	25 %	50 %	25 %	269958188
116	NC_013531	GGCC	2	8	32053	32060	0 %	0 %	50 %	50 %	269958188
117	NC_013531	GGGT	2	8	32581	32588	0 %	25 %	75 %	0 %	269958189
118	NC_013531	GCCC	2	8	32628	32635	0 %	0 %	25 %	75 %	269958189
119	NC_013531	CGTC	2	8	32936	32943	0 %	25 %	25 %	50 %	269958189
120	NC_013531	CTCG	2	8	32949	32956	0 %	25 %	25 %	50 %	269958189
121	NC_013531	CCGC	2	8	33026	33033	0 %	0 %	25 %	75 %	269958189
122	NC_013531	GCCC	2	8	33327	33334	0 %	0 %	25 %	75 %	269958190
123	NC_013531	TCAC	2	8	34207	34214	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013531	CCGC	2	8	34515	34522	0 %	0 %	25 %	75 %	269958192
125	NC_013531	GCCC	2	8	34567	34574	0 %	0 %	25 %	75 %	269958192
126	NC_013531	AGGA	2	8	34650	34657	50 %	0 %	50 %	0 %	269958192
127	NC_013531	AGCG	2	8	34687	34694	25 %	0 %	50 %	25 %	269958192
128	NC_013531	GTCG	2	8	34813	34820	0 %	25 %	50 %	25 %	269958192
129	NC_013531	CCGG	2	8	35173	35180	0 %	0 %	50 %	50 %	269958193
130	NC_013531	CGTG	2	8	35210	35217	0 %	25 %	50 %	25 %	269958193
131	NC_013531	GGTC	2	8	35598	35605	0 %	25 %	50 %	25 %	269958194
132	NC_013531	GGCC	2	8	35856	35863	0 %	0 %	50 %	50 %	269958195
133	NC_013531	CTGC	2	8	36115	36122	0 %	25 %	25 %	50 %	269958195
134	NC_013531	CCCA	2	8	36148	36155	25 %	0 %	0 %	75 %	269958195
135	NC_013531	ACCG	2	8	36825	36832	25 %	0 %	25 %	50 %	269958195
136	NC_013531	GCTG	2	8	36948	36955	0 %	25 %	50 %	25 %	269958195
137	NC_013531	CGCC	2	8	36975	36982	0 %	0 %	25 %	75 %	269958195
138	NC_013531	GCTC	2	8	37118	37125	0 %	25 %	25 %	50 %	269958195
139	NC_013531	GGTC	2	8	37298	37305	0 %	25 %	50 %	25 %	269958195
140	NC_013531	CGGC	2	8	37631	37638	0 %	0 %	50 %	50 %	269958195
141	NC_013531	ACCG	2	8	37723	37730	25 %	0 %	25 %	50 %	269958195
142	NC_013531	CGCC	2	8	37964	37971	0 %	0 %	25 %	75 %	269958195
143	NC_013531	GCCG	2	8	38157	38164	0 %	0 %	50 %	50 %	269958195
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.