MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 plasmid pXCEL01

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013531	GCGG	2	8	3104	3111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013531	CCGC	2	8	4286	4293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_013531	GCGG	2	8	4311	4318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013531	CCCA	2	8	5400	5407	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_013531	GCCT	2	8	5426	5433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013531	GGCG	2	8	6104	6111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013531	AGCG	2	8	6154	6161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013531	GCGG	2	8	7353	7360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013531	TGGT	2	8	8004	8011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013531	TGCT	2	8	13121	13128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013531	GACC	2	8	13182	13189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013531	GCTG	2	8	13218	13225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013531	GCCG	2	8	13356	13363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013531	GCAC	2	8	24304	24311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013531	AGCG	2	8	24498	24505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013531	ACCG	2	8	25584	25591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013531	GATG	2	8	27378	27385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013531	TGAG	2	8	27595	27602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013531	TCAC	2	8	34207	34214	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013531	TTCG	2	8	41346	41353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013531	TGCG	2	8	41527	41534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013531	AGGA	2	8	42614	42621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013531	CGAA	2	8	42770	42777	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013531	AGGC	2	8	43722	43729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013531	GCTC	2	8	43818	43825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013531	GGTC	2	8	43861	43868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013531	TGCG	2	8	44064	44071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013531	CGGT	2	8	45505	45512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013531	ACCG	2	8	55694	55701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013531	AAGG	2	8	56919	56926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013531	GCAC	2	8	58966	58973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013531	CGGC	2	8	59014	59021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013531	GCAG	2	8	59200	59207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013531	GCGA	2	8	59335	59342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013531	GTGA	2	8	59359	59366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013531	CGGT	2	8	63228	63235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013531	GTCC	2	8	63268	63275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013531	AGGC	2	8	63736	63743	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013531	CGGT	2	8	65923	65930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013531	CTCG	2	8	66025	66032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013531	GGTT	2	8	66476	66483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013531	GCGG	2	8	66538	66545	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013531	GTCC	2	8	67160	67167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013531	GCTC	2	8	67297	67304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013531	GACC	2	8	70425	70432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013531	AGGA	2	8	70451	70458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013531	CCAC	2	8	72767	72774	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_013531	GCCG	2	8	74443	74450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013531	ACTC	2	8	75086	75093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013531	AGCG	2	8	79889	79896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013531	GCCG	2	8	80293	80300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013531	TCCA	2	8	80357	80364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013531	TCGT	2	8	80433	80440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013531	CGGC	2	8	82786	82793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013531	CCCG	2	8	88472	88479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_013531	ACCA	2	8	88589	88596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.