MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 chromosome

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013530	GTGATC	2	12	123	134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013530	AGTCGG	2	12	54650	54661	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013530	CCGTCG	2	12	84469	84480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013530	GGCCGT	2	12	110581	110592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013530	CGACGC	2	12	181496	181507	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013530	ATCACG	2	12	181557	181568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013530	AGTGCA	2	12	210681	210692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013530	CCGACG	2	12	272774	272785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013530	GAGCGC	2	12	306141	306152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013530	CGGCCC	2	12	315564	315575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013530	CAAGCA	2	12	337403	337414	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013530	CGACAG	2	12	517878	517889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013530	GCTGTG	2	12	519230	519241	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013530	CTGCCG	2	12	532815	532826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013530	CCCGCC	2	12	583408	583419	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
16	NC_013530	CCGCAG	2	12	664225	664236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013530	CGAGGC	2	12	706207	706218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013530	GCCGTC	2	12	714658	714669	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013530	GCCGTC	2	12	714675	714686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013530	CGCCCC	2	12	727569	727580	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
21	NC_013530	CGCCGT	2	12	736133	736144	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013530	GGCCGC	2	12	750095	750106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013530	GGGGGT	2	12	773199	773210	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013530	CCCACC	2	12	797380	797391	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_013530	GTCGAC	2	12	802220	802231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013530	CGCGAG	2	12	834261	834272	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013530	CCGCGC	2	12	856405	856416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013530	GTTGCC	2	12	880401	880412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013530	CGGCGC	2	12	899147	899158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013530	CGGGAT	2	12	901687	901698	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013530	CGCCTC	2	12	901738	901749	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013530	GGTCGG	2	12	902965	902976	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013530	GACGGC	2	12	911412	911423	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013530	CACCAG	2	12	911955	911966	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013530	GTCGAG	2	12	916839	916850	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013530	GGTCGT	2	12	925337	925348	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013530	CCTCGT	2	12	943359	943370	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013530	GAGGCC	2	12	945278	945289	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013530	GGAGCC	2	12	976874	976885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013530	GGCGAC	2	12	976958	976969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013530	GCCGAC	2	12	977336	977347	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013530	ACCCGG	2	12	977544	977555	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013530	GCGTGC	2	12	978246	978257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013530	GCGCGT	2	12	978451	978462	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013530	CCGGCC	2	12	978825	978836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013530	GGGGTT	2	12	1015805	1015816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013530	CGTGAC	2	12	1026650	1026661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013530	GCCATG	2	12	1120687	1120698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013530	CGGTGG	2	12	1137302	1137313	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013530	CGCGCC	2	12	1163859	1163870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013530	CGCACA	2	12	1215255	1215266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013530	CGAGGA	2	12	1243766	1243777	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013530	GGGCGC	2	12	1337179	1337190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013530	GCACAG	2	12	1345476	1345487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013530	CGCGTC	2	12	1377427	1377438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013530	TCGGTA	2	12	1414117	1414128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013530	AGTGCA	2	12	1455853	1455864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013530	ACGCCG	2	12	1491867	1491878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013530	GGCGTC	2	12	1499227	1499238	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013530	GCCACG	2	12	1499323	1499334	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013530	CAGCGA	2	12	1539700	1539711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013530	CACGGG	2	12	1595846	1595857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013530	CTGTGG	2	12	1666806	1666817	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013530	CCGGCG	2	12	1690924	1690935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013530	GTCCCG	2	12	1717472	1717483	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013530	CGCTTG	2	12	1732928	1732939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013530	GAATGA	2	12	1739558	1739569	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013530	TGATCG	2	12	1739624	1739635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013530	CACGCG	2	12	1740262	1740273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013530	GCCGAC	2	12	1740373	1740384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013530	ATGACG	2	12	1743947	1743958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013530	GTCCCG	2	12	1748009	1748020	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013530	CGTCGG	2	12	1770278	1770289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013530	CGTCGC	2	12	1782521	1782532	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013530	GGGTGG	2	12	1792387	1792398	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013530	GGGGTG	2	12	1792448	1792459	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013530	CGGCCT	2	12	1887088	1887099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013530	TCGACC	2	12	1891283	1891294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013530	CGATGC	2	12	1891491	1891502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013530	TCGCCG	2	12	1891865	1891876	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013530	CGTGGG	2	12	1892106	1892117	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013530	GAGATG	2	12	1892269	1892280	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013530	GCGGGC	2	12	1992868	1992879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013530	GCCCGG	2	12	2157852	2157863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013530	CCGTTG	2	12	2216148	2216159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013530	ACGCGA	2	12	2219441	2219452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013530	CGCCCG	2	12	2333460	2333471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013530	GGCGTC	2	12	2335013	2335024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013530	CGGTGC	2	12	2335033	2335044	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013530	GCCGCG	2	12	2335053	2335064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013530	GGTTCT	2	12	2358161	2358172	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013530	GGCCGC	2	12	2387435	2387446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013530	CGCCGG	2	12	2476777	2476788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013530	TCGCGT	2	12	2528107	2528118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013530	AGCTCG	2	12	2542696	2542707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013530	AACACG	2	12	2542741	2542752	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013530	GAGGAA	2	12	2594844	2594855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013530	CGCCCG	2	12	2595356	2595367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013530	CGCGGG	2	12	2595642	2595653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013530	CAGCGC	2	12	2595654	2595665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013530	CCACGG	2	12	2600192	2600203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013530	TGCACT	2	12	2601138	2601149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013530	CGGAGC	2	12	2807434	2807445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013530	AGACGA	2	12	2827805	2827816	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013530	CAGGTC	2	12	2830365	2830376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013530	TGGGGG	2	12	2854271	2854282	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013530	CACGCG	2	12	2857888	2857899	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013530	GCCAGG	2	12	2950574	2950585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013530	TCGCCG	2	12	2959776	2959787	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013530	TCGGGT	2	12	3159670	3159681	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013530	CGGGGT	2	12	3262557	3262568	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013530	CGGGGT	2	12	3262573	3262584	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013530	GGACGG	2	12	3267543	3267554	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013530	CGCCAC	2	12	3298588	3298599	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013530	CGAGGA	2	12	3380242	3380253	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013530	CGAGAC	2	12	3391804	3391815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013530	CGTTGC	2	12	3392043	3392054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013530	CGATCA	2	12	3417849	3417860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013530	CAGCGG	2	12	3513525	3513536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013530	CGCCCG	3	18	3562478	3562495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013530	GGCGGG	2	12	3628128	3628139	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013530	ATCGCA	2	12	3637409	3637420	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013530	GGGGCG	2	12	3650804	3650815	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013530	TGGCGG	2	12	3654110	3654121	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013530	CGCACC	2	12	3668426	3668437	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013530	GGGCGG	2	12	3691623	3691634	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.