MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013526	ATCACC	2	12	6860	6871	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013526	TGGGAG	2	12	12508	12519	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013526	TGGGGC	2	12	13887	13898	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013526	TGCGGG	2	12	14289	14300	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013526	CTGCAC	2	12	23542	23553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013526	GGGCGC	2	12	23789	23800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013526	GGGCGC	2	12	23850	23861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013526	AACCGC	2	12	24638	24649	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013526	CCTGGG	2	12	53048	53059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013526	AGGATG	2	12	97445	97456	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013526	GCATGT	2	12	124383	124394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013526	CTTTTA	2	12	196415	196426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013526	GGTAGG	2	12	239427	239438	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013526	CCAGCC	2	12	253094	253105	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013526	GGCTGG	2	12	253116	253127	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013526	TATGCC	2	12	267587	267598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013526	CCACCC	2	12	298197	298208	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
18	NC_013526	TTTTGG	2	12	405753	405764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013526	GCCGCG	2	12	406551	406562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013526	GCTGTA	2	12	420897	420908	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013526	TCATAA	2	12	479918	479929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013526	GGAGTA	2	12	547680	547691	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013526	CAGGCG	2	12	616626	616637	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013526	GCTAGG	2	12	618080	618091	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013526	CCTCAT	2	12	621148	621159	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013526	CCTTCA	2	12	650722	650733	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013526	TGGCGG	2	12	761674	761685	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013526	GACGTT	2	12	795646	795657	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013526	AGTATT	2	12	810685	810696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013526	CCCAGT	2	12	832067	832078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013526	CGGAAG	2	12	944254	944265	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013526	CTCGGC	2	12	954215	954226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013526	CCCAAC	2	12	975789	975800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013526	CCGGCA	2	12	1010978	1010989	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013526	GAGAGC	2	12	1012731	1012742	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013526	AGGAGA	2	12	1049843	1049854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013526	ACGAAC	2	12	1050079	1050090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.