MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013526	AGCCC	2	10	1962	1971	20 %	0 %	20 %	60 %	269838916
2	NC_013526	CGCCC	2	10	5410	5419	0 %	0 %	20 %	80 %	269838919
3	NC_013526	TGGGT	2	10	12379	12388	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013526	GGTGG	2	10	12520	12529	0 %	20 %	80 %	0 %	269838927
5	NC_013526	CAGAG	2	10	13471	13480	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013526	GCAGG	2	10	14784	14793	20 %	0 %	60 %	20 %	269838931
7	NC_013526	GCATG	2	10	15483	15492	20 %	20 %	40 %	20 %	269838931
8	NC_013526	GCGCT	2	10	16141	16150	0 %	20 %	40 %	40 %	269838931
9	NC_013526	GGCGT	2	10	17744	17753	0 %	20 %	60 %	20 %	269838932
10	NC_013526	AGAGG	2	10	19298	19307	40 %	0 %	60 %	0 %	269838933
11	NC_013526	GACCT	2	10	19388	19397	20 %	20 %	20 %	40 %	269838933
12	NC_013526	CTGCA	2	10	21347	21356	20 %	20 %	20 %	40 %	269838935
13	NC_013526	GTGGA	2	10	22568	22577	20 %	20 %	60 %	0 %	269838937
14	NC_013526	CGAGA	2	10	23749	23758	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013526	ACCTG	2	10	27137	27146	20 %	20 %	20 %	40 %	269838941
16	NC_013526	CCTAC	2	10	27265	27274	20 %	20 %	0 %	60 %	269838941
17	NC_013526	GGCCA	2	10	28102	28111	20 %	0 %	40 %	40 %	269838942
18	NC_013526	GTGCC	2	10	28573	28582	0 %	20 %	40 %	40 %	269838943
19	NC_013526	TCCCC	2	10	28628	28637	0 %	20 %	0 %	80 %	269838943
20	NC_013526	CTGCC	2	10	29852	29861	0 %	20 %	20 %	60 %	269838944
21	NC_013526	GCCCC	2	10	32819	32828	0 %	0 %	20 %	80 %	269838947
22	NC_013526	GGGGA	2	10	34059	34068	20 %	0 %	80 %	0 %	269838949
23	NC_013526	GTGGC	2	10	34176	34185	0 %	20 %	60 %	20 %	269838949
24	NC_013526	GCAGG	2	10	34327	34336	20 %	0 %	60 %	20 %	269838949
25	NC_013526	TACGC	2	10	34789	34798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013526	TCCGC	2	10	37469	37478	0 %	20 %	20 %	60 %	269838952
27	NC_013526	TTTTA	2	10	39322	39331	20 %	80 %	0 %	0 %	269838955
28	NC_013526	GAAGG	2	10	39347	39356	40 %	0 %	60 %	0 %	269838955
29	NC_013526	CCTCA	2	10	40586	40595	20 %	20 %	0 %	60 %	269838956
30	NC_013526	TCCTC	2	10	44467	44476	0 %	40 %	0 %	60 %	269838960
31	NC_013526	TATAT	2	10	46799	46808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013526	CCACC	2	10	48989	48998	20 %	0 %	0 %	80 %	269838963
33	NC_013526	TCCCG	2	10	49513	49522	0 %	20 %	20 %	60 %	269838964
34	NC_013526	GCCCT	2	10	49924	49933	0 %	20 %	20 %	60 %	269838964
35	NC_013526	TGTGG	2	10	54382	54391	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013526	GGCTA	2	10	55578	55587	20 %	20 %	40 %	20 %	269838969
37	NC_013526	AATAT	2	10	55778	55787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013526	CTGCA	2	10	59525	59534	20 %	20 %	20 %	40 %	269838973
39	NC_013526	CACGC	2	10	59756	59765	20 %	0 %	20 %	60 %	269838973
40	NC_013526	GCGCT	2	10	60242	60251	0 %	20 %	40 %	40 %	269838974
41	NC_013526	GCTGG	2	10	60393	60402	0 %	20 %	60 %	20 %	269838974
42	NC_013526	GGCCT	2	10	63527	63536	0 %	20 %	40 %	40 %	269838978
43	NC_013526	GCCCC	2	10	65268	65277	0 %	0 %	20 %	80 %	269838979
44	NC_013526	GTTTC	2	10	66167	66176	0 %	60 %	20 %	20 %	269838981
45	NC_013526	GCAGG	2	10	67068	67077	20 %	0 %	60 %	20 %	269838982
46	NC_013526	GATCT	2	10	68858	68867	20 %	40 %	20 %	20 %	269838983
47	NC_013526	GCCGC	2	10	74537	74546	0 %	0 %	40 %	60 %	269838988
48	NC_013526	ATCCC	2	10	74554	74563	20 %	20 %	0 %	60 %	269838988
49	NC_013526	GAGCA	2	10	75388	75397	40 %	0 %	40 %	20 %	269838989
50	NC_013526	GGCAT	2	10	75632	75641	20 %	20 %	40 %	20 %	269838989
51	NC_013526	GATCT	2	10	77102	77111	20 %	40 %	20 %	20 %	269838990
52	NC_013526	CATCT	2	10	79226	79235	20 %	40 %	0 %	40 %	269838992
53	NC_013526	GCCGG	2	10	82484	82493	0 %	0 %	60 %	40 %	269838994
54	NC_013526	TACCA	2	10	83748	83757	40 %	20 %	0 %	40 %	269838995
55	NC_013526	TACCA	2	10	87235	87244	40 %	20 %	0 %	40 %	269838998
56	NC_013526	TGTGA	2	10	88500	88509	20 %	40 %	40 %	0 %	269838999
57	NC_013526	CTCGC	2	10	95603	95612	0 %	20 %	20 %	60 %	269839006
58	NC_013526	AGGAT	2	10	96145	96154	40 %	20 %	40 %	0 %	269839007
59	NC_013526	CGGGG	2	10	98915	98924	0 %	0 %	80 %	20 %	269839010
60	NC_013526	CTGGC	2	10	100451	100460	0 %	20 %	40 %	40 %	269839011
61	NC_013526	GAGAT	2	10	101640	101649	40 %	20 %	40 %	0 %	269839013
62	NC_013526	CTGAT	2	10	101890	101899	20 %	40 %	20 %	20 %	269839013
63	NC_013526	GCCGG	2	10	102117	102126	0 %	0 %	60 %	40 %	269839013
64	NC_013526	AGGGC	2	10	102196	102205	20 %	0 %	60 %	20 %	269839013
65	NC_013526	CAGCC	2	10	103986	103995	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_013526	GCCGT	2	10	104867	104876	0 %	20 %	40 %	40 %	269839016
67	NC_013526	ATGCC	2	10	105073	105082	20 %	20 %	20 %	40 %	269839016
68	NC_013526	ATTGG	2	10	106541	106550	20 %	40 %	40 %	0 %	269839018
69	NC_013526	GCTGT	2	10	107100	107109	0 %	40 %	40 %	20 %	269839020
70	NC_013526	AAGGT	2	10	107473	107482	40 %	20 %	40 %	0 %	269839020
71	NC_013526	ACCTC	2	10	110440	110449	20 %	20 %	0 %	60 %	269839021
72	NC_013526	CGAGC	2	10	112074	112083	20 %	0 %	40 %	40 %	269839022
73	NC_013526	AAGTA	2	10	115557	115566	60 %	20 %	20 %	0 %	269839026
74	NC_013526	GAGCT	2	10	120936	120945	20 %	20 %	40 %	20 %	269839031
75	NC_013526	ACGGC	2	10	122325	122334	20 %	0 %	40 %	40 %	269839032
76	NC_013526	GTAGT	2	10	122877	122886	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013526	AGGAC	2	10	123911	123920	40 %	0 %	40 %	20 %	269839033
78	NC_013526	GGCTA	2	10	126541	126550	20 %	20 %	40 %	20 %	269839036
79	NC_013526	GTGGA	2	10	126567	126576	20 %	20 %	60 %	0 %	269839036
80	NC_013526	AGGAG	2	10	127268	127277	40 %	0 %	60 %	0 %	269839036
81	NC_013526	GCGAG	2	10	129545	129554	20 %	0 %	60 %	20 %	269839039
82	NC_013526	CTCCG	2	10	129943	129952	0 %	20 %	20 %	60 %	269839040
83	NC_013526	CGAGC	2	10	131244	131253	20 %	0 %	40 %	40 %	269839041
84	NC_013526	GGCCT	2	10	132849	132858	0 %	20 %	40 %	40 %	269839042
85	NC_013526	GCCTG	2	10	133133	133142	0 %	20 %	40 %	40 %	269839042
86	NC_013526	CCAGC	2	10	136194	136203	20 %	0 %	20 %	60 %	269839045
87	NC_013526	GGCCG	2	10	139674	139683	0 %	0 %	60 %	40 %	269839047
88	NC_013526	CGCTG	2	10	140318	140327	0 %	20 %	40 %	40 %	269839048
89	NC_013526	GGGGT	2	10	140409	140418	0 %	20 %	80 %	0 %	269839048
90	NC_013526	GCAAC	2	10	147900	147909	40 %	0 %	20 %	40 %	269839055
91	NC_013526	CGGCG	2	10	156466	156475	0 %	0 %	60 %	40 %	269839064
92	NC_013526	CTGCT	2	10	158343	158352	0 %	40 %	20 %	40 %	269839067
93	NC_013526	GGGGA	2	10	159493	159502	20 %	0 %	80 %	0 %	269839069
94	NC_013526	GGCGT	2	10	165861	165870	0 %	20 %	60 %	20 %	269839072
95	NC_013526	CGACA	2	10	166379	166388	40 %	0 %	20 %	40 %	269839072
96	NC_013526	TACCC	2	10	169416	169425	20 %	20 %	0 %	60 %	269839073
97	NC_013526	TCGGG	2	10	170094	170103	0 %	20 %	60 %	20 %	269839074
98	NC_013526	CCCGA	2	10	171819	171828	20 %	0 %	20 %	60 %	269839076
99	NC_013526	GCTTG	2	10	172587	172596	0 %	40 %	40 %	20 %	269839076
100	NC_013526	AGGCG	2	10	173356	173365	20 %	0 %	60 %	20 %	269839077
101	NC_013526	CTAAG	2	10	174021	174030	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013526	TGGGC	2	10	174363	174372	0 %	20 %	60 %	20 %	269839078
103	NC_013526	TGGAG	2	10	175850	175859	20 %	20 %	60 %	0 %	269839079
104	NC_013526	CCCAC	2	10	179038	179047	20 %	0 %	0 %	80 %	269839082
105	NC_013526	AGGAG	2	10	179067	179076	40 %	0 %	60 %	0 %	269839082
106	NC_013526	CTGGC	2	10	180073	180082	0 %	20 %	40 %	40 %	269839083
107	NC_013526	CCCTG	2	10	180586	180595	0 %	20 %	20 %	60 %	269839084
108	NC_013526	CCCAG	2	10	180903	180912	20 %	0 %	20 %	60 %	269839084
109	NC_013526	TGCGC	2	10	183756	183765	0 %	20 %	40 %	40 %	269839086
110	NC_013526	TGGAC	2	10	185936	185945	20 %	20 %	40 %	20 %	269839089
111	NC_013526	AGGTC	2	10	186290	186299	20 %	20 %	40 %	20 %	269839090
112	NC_013526	CGTGC	2	10	186468	186477	0 %	20 %	40 %	40 %	269839090
113	NC_013526	GTGCC	2	10	186492	186501	0 %	20 %	40 %	40 %	269839090
114	NC_013526	GGGGT	2	10	187925	187934	0 %	20 %	80 %	0 %	269839091
115	NC_013526	GGCAG	2	10	188903	188912	20 %	0 %	60 %	20 %	269839093
116	NC_013526	CCGCC	2	10	191048	191057	0 %	0 %	20 %	80 %	269839094
117	NC_013526	CCCCG	2	10	191775	191784	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_013526	CTGGA	2	10	192914	192923	20 %	20 %	40 %	20 %	269839095
119	NC_013526	CTGGC	2	10	193930	193939	0 %	20 %	40 %	40 %	269839096
120	NC_013526	AGCCC	2	10	195560	195569	20 %	0 %	20 %	60 %	269839097
121	NC_013526	GAGGG	2	10	196989	196998	20 %	0 %	80 %	0 %	269839098
122	NC_013526	CGCAT	2	10	199735	199744	20 %	20 %	20 %	40 %	269839100
123	NC_013526	TACCG	2	10	200503	200512	20 %	20 %	20 %	40 %	269839102
124	NC_013526	CTGGC	2	10	200723	200732	0 %	20 %	40 %	40 %	269839102
125	NC_013526	CCTGG	2	10	200875	200884	0 %	20 %	40 %	40 %	269839102
126	NC_013526	CAAGC	2	10	202021	202030	40 %	0 %	20 %	40 %	269839102
127	NC_013526	GGTGC	2	10	202999	203008	0 %	20 %	60 %	20 %	269839103
128	NC_013526	ACGTC	2	10	203534	203543	20 %	20 %	20 %	40 %	269839104
129	NC_013526	TGGAA	2	10	203951	203960	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013526	GGGGC	2	10	205340	205349	0 %	0 %	80 %	20 %	269839106
131	NC_013526	GAGTG	2	10	205741	205750	20 %	20 %	60 %	0 %	269839106
132	NC_013526	AGGAG	2	10	206566	206575	40 %	0 %	60 %	0 %	269839106
133	NC_013526	CTGGC	2	10	209050	209059	0 %	20 %	40 %	40 %	269839108
134	NC_013526	GCCAC	2	10	212078	212087	20 %	0 %	20 %	60 %	269839112
135	NC_013526	ACCCC	2	10	212261	212270	20 %	0 %	0 %	80 %	269839112
136	NC_013526	GCGCC	2	10	213201	213210	0 %	0 %	40 %	60 %	269839113
137	NC_013526	ATGAC	2	10	215090	215099	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013526	CCGTA	2	10	218127	218136	20 %	20 %	20 %	40 %	269839121
139	NC_013526	GCCTG	2	10	219086	219095	0 %	20 %	40 %	40 %	269839122
140	NC_013526	AGCCC	2	10	219491	219500	20 %	0 %	20 %	60 %	269839122
141	NC_013526	GCCGC	2	10	221424	221433	0 %	0 %	40 %	60 %	269839123
142	NC_013526	GCGCA	2	10	221537	221546	20 %	0 %	40 %	40 %	269839123
143	NC_013526	TCTGC	2	10	226068	226077	0 %	40 %	20 %	40 %	269839128
144	NC_013526	CGATG	2	10	226324	226333	20 %	20 %	40 %	20 %	269839128
145	NC_013526	GAGCC	2	10	228336	228345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_013526	GGCGC	2	10	230039	230048	0 %	0 %	60 %	40 %	269839130
147	NC_013526	CCCCA	2	10	230232	230241	20 %	0 %	0 %	80 %	269839131
148	NC_013526	GCTCT	2	10	233324	233333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_013526	GCGAG	2	10	233460	233469	20 %	0 %	60 %	20 %	269839134
150	NC_013526	AGGTG	2	10	236117	236126	20 %	20 %	60 %	0 %	269839137
151	NC_013526	GCTCG	2	10	238099	238108	0 %	20 %	40 %	40 %	269839138
152	NC_013526	TCAGG	2	10	241621	241630	20 %	20 %	40 %	20 %	269839141
153	NC_013526	TCCCC	2	10	244496	244505	0 %	20 %	0 %	80 %	269839142
154	NC_013526	CCCGC	2	10	253212	253221	0 %	0 %	20 %	80 %	269839149
155	NC_013526	GCCCT	2	10	253415	253424	0 %	20 %	20 %	60 %	269839149
156	NC_013526	CAGGT	2	10	254830	254839	20 %	20 %	40 %	20 %	269839150
157	NC_013526	GCGGG	2	10	254964	254973	0 %	0 %	80 %	20 %	269839150
158	NC_013526	CTCAC	2	10	258362	258371	20 %	20 %	0 %	60 %	269839152
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160	NC_013526	GCCCT	2	10	260436	260445	0 %	20 %	20 %	60 %	269839154
161	NC_013526	GGCAC	2	10	260649	260658	20 %	0 %	40 %	40 %	269839154
162	NC_013526	AGCTG	2	10	263411	263420	20 %	20 %	40 %	20 %	269839156
163	NC_013526	GGACT	2	10	266807	266816	20 %	20 %	40 %	20 %	269839157
164	NC_013526	CTGTG	2	10	268202	268211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_013526	CGCGG	2	10	269374	269383	0 %	0 %	60 %	40 %	269839158
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167	NC_013526	TGTCC	2	10	273285	273294	0 %	40 %	20 %	40 %	269839163
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170	NC_013526	CTCCC	2	10	277008	277017	0 %	20 %	0 %	80 %	269839167
171	NC_013526	CCACC	2	10	277452	277461	20 %	0 %	0 %	80 %	269839167
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174	NC_013526	GCGCG	2	10	283113	283122	0 %	0 %	60 %	40 %	269839172
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178	NC_013526	AGGAG	2	10	289007	289016	40 %	0 %	60 %	0 %	269839176
179	NC_013526	GAGGG	2	10	289157	289166	20 %	0 %	80 %	0 %	269839176
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181	NC_013526	GGATG	2	10	290293	290302	20 %	20 %	60 %	0 %	269839176
182	NC_013526	CGTGG	2	10	290854	290863	0 %	20 %	60 %	20 %	269839176
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201	NC_013526	TGTCC	2	10	320894	320903	0 %	40 %	20 %	40 %	269839209
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205	NC_013526	CTGGT	2	10	326833	326842	0 %	40 %	40 %	20 %	269839214
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211	NC_013526	CGTAT	2	10	329619	329628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_013526	GGGGT	2	10	352414	352423	0 %	20 %	80 %	0 %	269839235
231	NC_013526	CCAGG	2	10	354300	354309	20 %	0 %	40 %	40 %	269839236
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233	NC_013526	CGAGG	2	10	358836	358845	20 %	0 %	60 %	20 %	269839240
234	NC_013526	CATTT	2	10	359374	359383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
235	NC_013526	GGGCT	2	10	362746	362755	0 %	20 %	60 %	20 %	269839243
236	NC_013526	AGATC	2	10	366402	366411	40 %	20 %	20 %	20 %	269839245
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239	NC_013526	GCGTG	2	10	370925	370934	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
240	NC_013526	TACGA	2	10	372290	372299	40 %	20 %	20 %	20 %	269839252
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244	NC_013526	AGGCA	2	10	376900	376909	40 %	0 %	40 %	20 %	269839257
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248	NC_013526	ACCGT	2	10	380183	380192	20 %	20 %	20 %	40 %	269839261
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254	NC_013526	GATAG	2	10	383877	383886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
255	NC_013526	TGCGC	2	10	384360	384369	0 %	20 %	40 %	40 %	269839265
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262	NC_013526	CCGTC	2	10	393159	393168	0 %	20 %	20 %	60 %	269839275
263	NC_013526	GAAAG	2	10	395196	395205	60 %	0 %	40 %	0 %	269839278
264	NC_013526	CGTGG	2	10	396573	396582	0 %	20 %	60 %	20 %	269839279
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