MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013526	TGGGT	2	10	12379	12388	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013526	CAGAG	2	10	13471	13480	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013526	CGAGA	2	10	23749	23758	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013526	TACGC	2	10	34789	34798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013526	TATAT	2	10	46799	46808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013526	TGTGG	2	10	54382	54391	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013526	AATAT	2	10	55778	55787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013526	CAGCC	2	10	103986	103995	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013526	GTAGT	2	10	122877	122886	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013526	CTAAG	2	10	174021	174030	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013526	CCCCG	2	10	191775	191784	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_013526	TGGAA	2	10	203951	203960	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013526	ATGAC	2	10	215090	215099	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013526	GAGCC	2	10	228336	228345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013526	GCTCT	2	10	233324	233333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013526	CTGTG	2	10	268202	268211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013526	TTTAT	2	10	284862	284871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013526	AGCAC	2	10	302832	302841	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013526	CGGCA	2	10	324589	324598	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013526	TATTG	2	10	329138	329147	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013526	CGTAT	2	10	329619	329628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013526	TTAAG	2	10	330354	330363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013526	TATAC	2	10	358128	358137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013526	CATTT	2	10	359374	359383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013526	GATTA	2	10	369293	369302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013526	GCGTG	2	10	370925	370934	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013526	GGAGG	2	10	376672	376681	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013526	CCCAG	2	10	379507	379516	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_013526	GATAG	2	10	383877	383886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013526	ACATA	2	10	410592	410601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013526	GCACC	2	10	438188	438197	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_013526	CTCTC	2	10	497147	497156	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_013526	CTTAG	2	10	505517	505526	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013526	GCAGG	2	10	535898	535907	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013526	TACAA	2	10	541286	541295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013526	GATAT	2	10	541299	541308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013526	GTGAT	2	10	547418	547427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013526	ATATT	2	10	553293	553302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013526	TGGCT	2	10	559080	559089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013526	TCTCC	2	10	562647	562656	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_013526	AACCG	2	10	582882	582891	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013526	CGCAG	2	10	583852	583861	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013526	ACGAA	2	10	599089	599098	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013526	AGCGT	2	10	602883	602892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013526	CTAGC	2	10	621244	621253	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013526	CGGCA	2	10	650354	650363	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013526	AGATC	2	10	650656	650665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013526	GTGGG	2	10	664520	664529	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013526	TGGGG	2	10	710921	710930	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013526	CCAAC	2	10	721183	721192	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_013526	CGCGG	2	10	726168	726177	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013526	GCAGC	2	10	748652	748661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013526	TCGCC	2	10	766418	766427	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_013526	ACCTC	2	10	789389	789398	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_013526	GGCGC	2	10	803618	803627	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_013526	TCCTT	2	10	805800	805809	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_013526	CCCTA	2	10	841013	841022	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_013526	CCCCT	2	10	894459	894468	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
59	NC_013526	AGCAC	2	10	915761	915770	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_013526	GGAGA	2	10	920987	920996	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013526	GCAGA	2	10	923188	923197	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013526	GGGCT	2	10	923331	923340	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013526	CCCTG	2	10	944206	944215	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_013526	GTCGC	2	10	955706	955715	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013526	GGCTA	2	10	963925	963934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013526	CTGTG	2	10	972421	972430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013526	CCGAT	2	10	972873	972882	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013526	GGATG	2	10	973218	973227	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013526	ATGTA	2	10	975589	975598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013526	GAGCT	2	10	983209	983218	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013526	CCTCC	2	10	1012748	1012757	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_013526	CGTGA	2	10	1030908	1030917	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013526	GGCGG	2	10	1043888	1043897	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013526	CGTTT	2	10	1046275	1046284	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013526	CGTTT	2	10	1047870	1047879	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013526	TGCCC	2	10	1048011	1048020	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_013526	ACCTC	2	10	1049299	1049308	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_013526	GTTTC	2	10	1049716	1049725	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013526	CGAAC	2	10	1053342	1053351	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013526	TGGGT	2	10	1053985	1053994	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013526	CCCTG	2	10	1064771	1064780	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_013526	GCCCC	2	10	1072479	1072488	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.