MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 18594

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013526	GGC	2	6	108	113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838914
2	NC_013526	TGC	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838914
3	NC_013526	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838914
4	NC_013526	CGA	2	6	168	173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838914
5	NC_013526	ATC	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838914
6	NC_013526	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838914
7	NC_013526	GAT	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838914
8	NC_013526	TCC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838915
9	NC_013526	CTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838915
10	NC_013526	GGA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838915
11	NC_013526	GAG	2	6	392	397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838915
12	NC_013526	CAG	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838915
13	NC_013526	TGG	2	6	453	458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838915
14	NC_013526	GGA	2	6	472	477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838915
15	NC_013526	GCC	2	6	525	530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838915
16	NC_013526	CTG	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
17	NC_013526	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838916
18	NC_013526	CGC	2	6	616	621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
19	NC_013526	GGC	2	6	663	668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838916
20	NC_013526	CGC	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
21	NC_013526	CGT	2	6	711	716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
22	NC_013526	CTC	2	6	779	784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838916
23	NC_013526	CTG	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
24	NC_013526	GCA	2	6	851	856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
25	NC_013526	GCA	2	6	897	902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
26	NC_013526	AGC	2	6	946	951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
27	NC_013526	CCG	2	6	1101	1106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
28	NC_013526	GTC	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
29	NC_013526	GGC	2	6	1164	1169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838916
30	NC_013526	CAC	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838916
31	NC_013526	CCG	2	6	1247	1252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
32	NC_013526	GCT	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
33	NC_013526	TCT	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269838916
34	NC_013526	GCA	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
35	NC_013526	CCG	2	6	1493	1498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
36	NC_013526	CCT	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838916
37	NC_013526	GTC	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
38	NC_013526	TCC	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838916
39	NC_013526	GAT	3	9	1749	1757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838916
40	NC_013526	GGA	2	6	1779	1784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838916
41	NC_013526	CCA	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838916
42	NC_013526	CAC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838916
43	NC_013526	CCG	2	6	1985	1990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
44	NC_013526	CAG	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
45	NC_013526	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
46	NC_013526	CAG	2	6	2143	2148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
47	NC_013526	TAC	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838916
48	NC_013526	GGT	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838916
49	NC_013526	CTC	2	6	2286	2291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838916
50	NC_013526	GCC	2	6	2299	2304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
51	NC_013526	GCC	3	9	2311	2319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
52	NC_013526	ATC	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838916
53	NC_013526	AGG	2	6	2417	2422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838916
54	NC_013526	GGT	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838916
55	NC_013526	GAG	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838916
56	NC_013526	ACG	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
57	NC_013526	GCA	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
58	NC_013526	GAG	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838916
59	NC_013526	CCT	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013526	TCC	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013526	GAG	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013526	GAT	3	9	2715	2723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013526	GAG	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013526	ACG	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838917
65	NC_013526	CTT	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269838917
66	NC_013526	CCA	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
67	NC_013526	GGT	2	6	2898	2903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838917
68	NC_013526	CCA	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
69	NC_013526	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838917
70	NC_013526	GGT	2	6	3048	3053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838917
71	NC_013526	GGC	2	6	3106	3111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838917
72	NC_013526	CGA	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838917
73	NC_013526	ATG	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838917
74	NC_013526	TGG	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838917
75	NC_013526	CCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
76	NC_013526	GCC	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838917
77	NC_013526	GAG	2	6	3404	3409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838917
78	NC_013526	CCT	2	6	3444	3449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838917
79	NC_013526	GCG	2	6	3495	3500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838917
80	NC_013526	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838917
81	NC_013526	GAT	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838917
82	NC_013526	TCC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838917
83	NC_013526	TGG	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838917
84	NC_013526	CAC	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
85	NC_013526	TCG	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838917
86	NC_013526	CCT	2	6	3735	3740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838917
87	NC_013526	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
88	NC_013526	CCT	2	6	3972	3977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
89	NC_013526	GAT	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838918
90	NC_013526	CCT	2	6	4005	4010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
91	NC_013526	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838918
92	NC_013526	CGT	3	9	4137	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
93	NC_013526	CAG	3	9	4159	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838918
94	NC_013526	AGG	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838918
95	NC_013526	TGC	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
96	NC_013526	GTC	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
97	NC_013526	CAG	2	6	4369	4374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838918
98	NC_013526	AGC	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838918
99	NC_013526	AGT	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838918
100	NC_013526	AGC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838918
101	NC_013526	TGG	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838918
102	NC_013526	TGC	2	6	4562	4567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
103	NC_013526	CCT	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
104	NC_013526	GCG	2	6	4625	4630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838918
105	NC_013526	TCA	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838918
106	NC_013526	CGG	2	6	4701	4706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838918
107	NC_013526	CCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838918
108	NC_013526	GTC	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
109	NC_013526	CTC	2	6	4843	4848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
110	NC_013526	CGG	2	6	4857	4862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838918
111	NC_013526	CCA	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838918
112	NC_013526	CTC	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
113	NC_013526	TCT	2	6	4953	4958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269838918
114	NC_013526	CTC	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013526	GGC	2	6	5047	5052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013526	GTT	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013526	GGA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838919
118	NC_013526	CCT	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838919
119	NC_013526	CCA	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838919
120	NC_013526	GTG	2	6	5362	5367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838919
121	NC_013526	CGC	2	6	5380	5385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838919
122	NC_013526	TCG	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838919
123	NC_013526	CTG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838919
124	NC_013526	AGC	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838919
125	NC_013526	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838919
126	NC_013526	GCC	2	6	5619	5624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838919
127	NC_013526	CTC	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838919
128	NC_013526	AGC	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838919
129	NC_013526	ATG	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838919
130	NC_013526	CCG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838919
131	NC_013526	CTC	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838919
132	NC_013526	ACC	2	6	5897	5902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838919
133	NC_013526	AGA	2	6	5937	5942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838919
134	NC_013526	ATG	2	6	5972	5977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838919
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139	NC_013526	TGA	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838919
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147	NC_013526	CAT	2	6	6399	6404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838919
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149	NC_013526	TCG	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838919
150	NC_013526	GCA	2	6	6530	6535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013526	CGG	2	6	6539	6544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013526	CGG	2	6	6571	6576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013526	GCA	2	6	6634	6639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_013526	CAA	2	6	6749	6754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013526	ATT	2	6	6755	6760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013526	TTG	2	6	6770	6775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013526	ATT	3	9	6794	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_013526	AAG	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838920
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175	NC_013526	AGC	2	6	7881	7886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_013526	CTC	2	6	11931	11936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838926
258	NC_013526	TCC	2	6	12073	12078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_013526	CCA	2	6	12104	12109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_013526	GTG	2	6	12114	12119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_013526	GAG	2	6	12136	12141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_013526	CCT	2	6	12158	12163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_013526	CAC	2	6	12217	12222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_013526	CAC	2	6	12332	12337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_013526	GTG	2	6	12356	12361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_013526	GGA	2	6	12463	12468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_013526	TGC	2	6	12546	12551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838927
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269	NC_013526	CGT	2	6	12710	12715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838928
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272	NC_013526	AGG	2	6	12833	12838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_013526	ACC	2	6	12982	12987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_013526	GCT	2	6	13566	13571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_013526	GTG	2	6	13707	13712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013526	CTG	2	6	13775	13780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_013526	GGT	2	6	14065	14070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838930
283	NC_013526	GTG	2	6	14410	14415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013526	GGT	2	6	14432	14437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013526	TGT	2	6	14588	14593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269838931
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294	NC_013526	GAG	2	6	15169	15174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838931
295	NC_013526	TGC	2	6	15186	15191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838931
296	NC_013526	GAG	2	6	15373	15378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838931
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373	NC_013526	CAC	2	6	19316	19321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838933
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379	NC_013526	CAA	2	6	19505	19510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
380	NC_013526	TAA	2	6	19513	19518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
381	NC_013526	GGA	2	6	19519	19524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
382	NC_013526	CGA	2	6	19585	19590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838934
383	NC_013526	CTG	2	6	19808	19813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838934
384	NC_013526	ATA	2	6	19836	19841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269838934
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386	NC_013526	AAG	3	9	19970	19978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838934
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499	NC_013526	CCT	2	6	27725	27730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838942
500	NC_013526	TAG	2	6	27748	27753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838942

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